zfpl1 (zfpl1)


Basic Information

Item Value
gene id zfpl1
gene name zfpl1
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 25231235 ~ 25263128 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043239175.1
ATAGACATATAAATGACTAGAcgcttcttttttgtttttattatttccaaaatatGGATACAGAATATAGGGGAAAacgatttttaaataaaaacagtgccAGGAGTACAGGGATTACCAAGATTATTAACATAACAATTGATTTCAAAAACGTAACTCGGTCACGTTTGTGGCCTTAAGGTTGTGCTTGGTGACGCAATTTCACTGCGACGGTAGCGGAAGAGACGTGGCAAAAATGCTAACTATTAGACGCTATAATAATATTGAGGAAAGTACTGGGCAGTTGTGTACAGTTTCATGTTGATGTTTGCACCGGTTTGTTTTTGACTcgtattttcttcttcttttaagGAAGAACATGGGTTTGTGCAAGTGTCCTAAGAAGAAGGTAACGAACTTGTTCTGTTTTGAACATCGTGTCAACGTTTGTGAGCACTGTCTTGTATCCAATCACAATAAGtgtaTTGTACAGTCATACCTACAGTGGCTACAAGACAGCGATTACAACCCAAACTGCAGCCTGTGCAGTCAGCCCTTAGATTCCCAGGACACTGTTCGGCTAGTTTGTTATGATTTATTCCACTGGTCATGTCTGAATGAGCTCGCCTCCCGTCAGCCCCTCTACACAGCACCTGCTGGGTACCAGTGCCCAACATGCCAAGGTCCTGTTTTCCCACCTTCAAACCTGGCCAGTCCTGTTGCAGACATGCTGAGAGAGCAACTGTCCTCTGTCAACTGGGCCAGAGCAGGACTAGGCCTTCCACTGATTGAAGATCCACCAAAGAGTGAGGAAAGTACAACACATGAGGATACGAGTTACTCTGAATGGTCATCTTTTGAGACTCCTACAGTGGATATAATTTTGTCAAACCCCACACCCACAAGTCTTCCACCTCATCAGGATGTGGAGCACATGCACAAAAATGGAGAAGTGAGTGGCCAAAATCTCTCTGTCATCAATATGAGCACCACCTCTACCTCCACAGATACAATCACCATTAACACAGCTATATCCCCAAGAAAGGTATATGACACACGGGATTCAGGACAAAGTGCAGTGATGCAGATTGACTTTGATGACGATAAATACCGCAGACGACCTGCCCTTAGCTGGTTTTCACAGGTTCTAAAgAATCGTACTGGCACTAAGAAAAAGGCCCTCACTCTGAAACAGCGCATCTTCATGTTGCTTTTGGTTGGAGTGATTGGTTTCTTTACCCTCATCATAATTATGGCTAAACTGGGAAGGGCCTCAGCTGAGACGGATCCAAACCTGGATCCTATGCTGAATCCCAACATCAGGGTAGGAAACATGTGATGGATCCCCTTCCTGCTAAAACTCTATATGGATTCAGCCTGCAGTTCAACTTTTgcttataaaatgttatttgaaaaaGTTGAAGAAAGCATGTTCCTCAGGAATCTGGGACCAGTGTGAAAATTCAATTGTTTGGACTGTGGGAGAATTGTGTGACGTGGTGGTCAACAATAAAGAAGATAAAGATAGAAGTTGCACAACAAATCTTAAATTTCGCTTGGGTGATATTATTATAGGCTCTATAAGTGTGCAACTGTGTATTATTTAGCTCTGTAATTCTCCCTTGCATACCTTTACAATTGTTGTATGAAAATTGGGATAAAAATATGCCATTGTATTGAAATCTATCTGTCTATTGTTTCTCTGAGGTGTCAAActtttgattgcatttattaattgctGATCAATTAGCAACCCCTGCCTGCGAGATTAATTTTAACATATGTAAAGTTTCTTTGCTGTTgactgtaaaaatgcaaaactgatttaCTAAAGcatctgaaaatgttttggttgGCATGCTTTAGTGGCACTATTTTAgtcattatattttagtaaatacaACCTTTACAAAAGGCAGGTGATAACTGTactcttttgttttgtagttCATAAAGAGTGCACAACTGTCTTTTGTCTGGGTTGTATTCCAtcccaaaaattatttaaaacattaagccTGTTTTAAAGCTAGTTTTTGTGATATTATAATTGTGCCAATTCACCCTACGCTAAAAAAATGCCATAAACTGACAACTTGCTGACAGACAAAGCAAGTTACTTCTGGTATGAAACACAGTCTCAGCTTTCAAGTTTTgttatttaagaaatgtaaaacaataaacagtttTGTGACTTTCTAATGTTTAAAACTTGCAGAACTCCCCACTGCAATCCAAAACGTCAAACATATCTATGTACTGCAACATTTCGCATATTTCAGCTCCTGTTGCATTTTAAGAAAGCGATCATCTGGGTTAACCTTACAGAGATTGCTTAACTGTAGTATATACCATAATATTCACATTATCTCTGATTGTAGTTTacatgttttctctttttttttctcctctgtaAGTGGTTTTCCTAATTTGTCAGTCTACTGTGATTATAGTACTATTGGGTCAGTCCATATCAAGTGGTCCAGTTGATCTTGCTtgacaatttttcttttttttttttttttttttttccttttgagtGATTACCCTATGTACTGTGTTAGTATTTGATATATGGTCAGTTTATAATACCATTTTTtcaactcccctagagttaagatattgagttttaccatttttgaatccattaaGCCTATCTCTGAGTctgtagcacttttagctgtagatTAGCAGggatcattaaaaaacaaaagttgtttataaatgtgctatataattaaacattacacacacacatatatataaataatagatatGCACGCGAATACAAATACACCTttgaatttttgtaaaaattttgtaatttacatattcagatttttcattatgtgatttttatttttattactttttatttagaaaacaaaaagtttctATCCACAAAATTTGGTATTTTGAGGTTCTACTTGTGATTCATCCAGTCAGCGCTTCAAATGCACGCAAAAGGACCAATCGGGATCAACTTTCTTTGTTATGTTGCCCGACTTCTCCTTAACAGCAGGAaagattaaacattaaacaacaataattacataTCTGCATAATCAGTAAATGCAATGCACCATTGTGAACAAGTTCCACAAAAtggcactttttaaaaacatgatgtgatttttttttttcactcattaTTAGCATGTGCATAAAAAAGATGTTCATCTGCAAAAACTGAATGGGCTTGAATGGTTTTACTGCAAAATGTCCTCTGGCGGTGGTAGCGATGGTAAAATCATCTGCTCAGATCAAACCCTTCTAAAGCCCTATTTAGCGTCCAGGGCGACGCTGTTGATCAATCGGGACACTTGTCACTATTTAATACTAATCCCGTGCAAATAGGCCTTATGTTACGAAAGGTAAGGATGTatgctttattctttattttatttattttttaaattgttaaatatcaGGGGAACAATTGTATAATAATTCCATccatgttaaatataaatctatagaTGTGAGAATTGtggtattacaaatttataaaatgttaaatgtgggTTTCAATATAACCATTTGAATGGAAAAGTTATGTATATTGTGACTTACATtataagagcaggaagcccaggCCCTGATCAGTTcctgaacatctggtaggtttCCCAAGTTAAGTGTTTATGCTAATCTCAAGATACACTGTTTCAGGGTTTTTCTAAcgcctatgcatttgaatgacacttgtaTGCTAAACAGATCAAGGCTTGAAAAGTTCCTGTTTCTGTATGTACATGGTAGAAAGAATACCATGTCCTTTGTGTCAAACAATGAGATTTATGTTCGGTCATAAAAATTCCCTCCCACCCCATAACCGGACACCTGTTCATGTACACCTGTTCAATTTTATGAAAAAAGACTGAAACATTTCAATCAAAAATATCATCTACCTTTGTTAAAATATACCAATATATATGACCGGTACGTTAGTTTGTTATggataaaagttaaataaagccAAAAATCTACAACAAAAAGTATAGTACAAGATACATGTTTGAGCATAAGTGTAAGAGACTACCTTTTAAAATTGGTGTGTTAGACTCTGTTGCAGAtacaaagttaaataaaatagaactgACCAGTTTACCgcaatctgaaaaaaaataagaaaaagcatCAGACGTTAGTTAAAACAACAAGATAGAAGTCGAAATCTATgttgccattaaaaaaaaaaaaagttacaaattagaaaaataagaGAGAGAATCTCACTGTGATCtacaaaacatttgattattGTTAAAACAGCATACACCACTAATCCAAAATCTTATAACGTTACAATTTAGGAAAAACTAACTTTTGTCACAAGTTAGAAAAGTTAAACAAAGAGAAATCCTGCAGAGGGATTGTCAGATTCAAACTGggttgtcaaaaaaaaaagcatccgCTCCCAAACCACACCCAGGCCCCACTCCAGCCTCCCTAACACCTAACCCTGTTAGGAGAGACCCGCACGAAGacagattttaaacaaacagatgttttaacgttagaacaaataataaatcttttctttctaaacatttcttaacttATTAGGCCATTGTTGGTGTTTTAACATAGTTAGAGCTTTTTACACAACACATCCAAACCACAAGAAAATGGTTATTCAGATCTTAAAACTTGTTTAGTagttaaaacatacaaatggtGTGCACAAATATAAAGCCACACGTGGCAGAACTGCAGTTGAGTTTTGACTCAATGCTGAAAGGAACTAATGCTGTCTCTTTCACTTCCAGATAGCAGCTTGTGACCGATCAACCCAAAGAGTTGTATTTATGAACTCACTGCACCTAAGAGATTGGATGACCGAGCACTACCAAGCACTGGAACACCTACCCATCGCCCTTTCATCTTACCcctgtattgtttgttaataaaGCCTCCCTCCCGGGtctttattttga
>XM_043239176.1
GCCCATAGACATATAAATGACTAGAcgcttcttttttgtttttattatttccaaaatatGGATACAGAATATAGGGGAAAacgatttttaaataaaaacagtgccAGGAGTACAGGGATTACCAAGATTATTAACATAACAATTGATTTCAAAAACGTAACTCGGTCACGTTTGTGGCCTTAAGGTTGTGCTTGGTGACGCAATTTCACTGCGACGGTAGCGGAAGAGACGTGGCAAAAATGCTAACTATTAGACGCTATAATAATATTGAGGAAAGTACTGGGCAGTTGTGTACAGTTTCATGTTGATGTTTGCACCGGTTTGTTTTTGACTcgtattttcttcttcttttaagGAAGAACATGGGTTTGTGCAAGTGTCCTAAGAAGAAGGTAACGAACTTGTTCTGTTTTGAACATCGTGTCAACGTTTGTGAGCACTGTCTTGTATCCAATCACAATAAGtgtaTTGTACAGTCATACCTACAGTGGCTACAAGACAGCGATTACAACCCAAACTGCAGCCTGTGCAGTCAGCCCTTAGATTCCCAGGACACTGTTCGGCTAGTTTGTTATGATTTATTCCACTGGTCATGTCTGAATGAGCTCGCCTCCCGTCAGCCCCTCTACACAGCACCTGCTGGGTACCAGTGCCCAACATGCCAAGGTCCTGTTTTCCCACCTTCAAACCTGGCCAGTCCTGTTGCAGACATGCTGAGAGAGCAACTGTCCTCTGTCAACTGGGCCAGAGCAGGACTAGGCCTTCCACTGATTGAAGATCCACCAAAGAGTGAGGAAAGTACAACACATGAGGATACGAGTTACTCTGAATGGTCATCTTTTGAGACTATATCCCCAAGAAAGGTATATGACACACGGGATTCAGGACAAAGTGCAGTGATGCAGATTGACTTTGATGACGATAAATACCGCAGACGACCTGCCCTTAGCTGGTTTTCACAGGTTCTAAAgAATCGTACTGGCACTAAGAAAAAGGCCCTCACTCTGAAACAGCGCATCTTCATGTTGCTTTTGGTTGGAGTGATTGGTTTCTTTACCCTCATCATAATTATGGCTAAACTGGGAAGGGCCTCAGCTGAGACGGATCCAAACCTGGATCCTATGCTGAATCCCAACATCAGGGTAGGAAACATGTGATGGATCCCCTTCCTGCTAAAACTCTATATGGATTCAGCCTGCAGTTCAACTTTTgcttataaaatgttatttgaaaaaGTTGAAGAAAGCATGTTCCTCAGGAATCTGGGACCAGTGTGAAAATTCAATTGTTTGGACTGTGGGAGAATTGTGTGACGTGGTGGTCAACAATAAAGAAGATAAAGATAGAAGTTGCACAACAAATCTTAAATTTCGCTTGGGTGATATTATTATAGGCTCTATAAGTGTGCAACTGTGTATTATTTAGCTCTGTAATTCTCCCTTGCATACCTTTACAATTGTTGTATGAAAATTGGGATAAAAATATGCCATTGTATTGAAATCTATCTGTCTATTGTTTCTCTGAGGTGTCAAActtttgattgcatttattaattgctGATCAATTAGCAACCCCTGCCTGCGAGATTAATTTTAACATATGTAAAGTTTCTTTGCTGTTgactgtaaaaatgcaaaactgatttaCTAAAGcatctgaaaatgttttggttgGCATGCTTTAGTGGCACTATTTTAgtcattatattttagtaaatacaACCTTTACAAAAGGCAGGTGATAACTGTactcttttgttttgtagttCATAAAGAGTGCACAACTGTCTTTTGTCTGGGTTGTATTCCAtcccaaaaattatttaaaacattaagccTGTTTTAAAGCTAGTTTTTGTGATATTATAATTGTGCCAATTCACCCTACGCTAAAAAAATGCCATAAACTGACAACTTGCTGACAGACAAAGCAAGTTACTTCTGGTATGAAACACAGTCTCAGCTTTCAAGTTTTgttatttaagaaatgtaaaacaataaacagtttTGTGACTTTCTAATGTTTAAAACTTGCAGAACTCCCCACTGCAATCCAAAACGTCAAACATATCTATGTACTGCAACATTTCGCATATTTCAGCTCCTGTTGCATTTTAAGAAAGCGATCATCTGGGTTAACCTTACAGAGATTGCTTAACTGTAGTATATACCATAATATTCACATTATCTCTGATTGTAGTTTacatgttttctctttttttttctcctctgtaAGTGGTTTTCCTAATTTGTCAGTCTACTGTGATTATAGTACTATTGGGTCAGTCCATATCAAGTGGTCCAGTTGATCTTGCTtgacaatttttcttttttttttttttttttttttccttttgagtGATTACCCTATGTACTGTGTTAGTATTTGATATATGGTCAGTTTATAATACCATTTTTtcaactcccctagagttaagatattgagttttaccatttttgaatccattaaGCCTATCTCTGAGTctgtagcacttttagctgtagatTAGCAGggatcattaaaaaacaaaagttgtttataaatgtgctatataattaaacattacacacacacatatatataaataatagatatGCACGCGAATACAAATACACCTttgaatttttgtaaaaattttgtaatttacatattcagatttttcattatgtgatttttatttttattactttttatttagaaaacaaaaagtttctATCCACAAAATTTGGTATTTTGAGGTTCTACTTGTGATTCATCCAGTCAGCGCTTCAAATGCACGCAAAAGGACCAATCGGGATCAACTTTCTTTGTTATGTTGCCCGACTTCTCCTTAACAGCAGGAaagattaaacattaaacaacaataattacataTCTGCATAATCAGTAAATGCAATGCACCATTGTGAACAAGTTCCACAAAAtggcactttttaaaaacatgatgtgatttttttttttcactcattaTTAGCATGTGCATAAAAAAGATGTTCATCTGCAAAAACTGAATGGGCTTGAATGGTTTTACTGCAAAATGTCCTCTGGCGGTGGTAGCGATGGTAAAATCATCTGCTCAGATCAAACCCTTCTAAAGCCCTATTTAGCGTCCAGGGCGACGCTGTTGATCAATCGGGACACTTGTCACTATTTAATACTAATCCCGTGCAAATAGGCCTTATGTTACGAAAGGTAAGGATGTatgctttattctttattttatttattttttaaattgttaaatatcaGGGGAACAATTGTATAATAATTCCATccatgttaaatataaatctatagaTGTGAGAATTGtggtattacaaatttataaaatgttaaatgtgggTTTCAATATAACCATTTGAATGGAAAAGTTATGTATATTGTGACTTACATtataagagcaggaagcccaggCCCTGATCAGTTcctgaacatctggtaggtttCCCAAGTTAAGTGTTTATGCTAATCTCAAGATACACTGTTTCAGGGTTTTTCTAAcgcctatgcatttgaatgacacttgtaTGCTAAACAGATCAAGGCTTGAAAAGTTCCTGTTTCTGTATGTACATGGTAGAAAGAATACCATGTCCTTTGTGTCAAACAATGAGATTTATGTTCGGTCATAAAAATTCCCTCCCACCCCATAACCGGACACCTGTTCATGTACACCTGTTCAATTTTATGAAAAAAGACTGAAACATTTCAATCAAAAATATCATCTACCTTTGTTAAAATATACCAATATATATGACCGGTACGTTAGTTTGTTATggataaaagttaaataaagccAAAAATCTACAACAAAAAGTATAGTACAAGATACATGTTTGAGCATAAGTGTAAGAGACTACCTTTTAAAATTGGTGTGTTAGACTCTGTTGCAGAtacaaagttaaataaaatagaactgACCAGTTTACCgcaatctgaaaaaaaataagaaaaagcatCAGACGTTAGTTAAAACAACAAGATAGAAGTCGAAATCTATgttgccattaaaaaaaaaaaaagttacaaattagaaaaataagaGAGAGAATCTCACTGTGATCtacaaaacatttgattattGTTAAAACAGCATACACCACTAATCCAAAATCTTATAACGTTACAATTTAGGAAAAACTAACTTTTGTCACAAGTTAGAAAAGTTAAACAAAGAGAAATCCTGCAGAGGGATTGTCAGATTCAAACTGggttgtcaaaaaaaaaagcatccgCTCCCAAACCACACCCAGGCCCCACTCCAGCCTCCCTAACACCTAACCCTGTTAGGAGAGACCCGCACGAAGacagattttaaacaaacagatgttttaacgttagaacaaataataaatcttttctttctaaacatttcttaacttATTAGGCCATTGTTGGTGTTTTAACATAGTTAGAGCTTTTTACACAACACATCCAAACCACAAGAAAATGGTTATTCAGATCTTAAAACTTGTTTAGTagttaaaacatacaaatggtGTGCACAAATATAAAGCCACACGTGGCAGAACTGCAGTTGAGTTTTGACTCAATGCTGAAAGGAACTAATGCTGTCTCTTTCACTTCCAGATAGCAGCTTGTGACCGATCAACCCAAAGAGTTGTATTTATGAACTCACTGCACCTAAGAGATTGGATGACCGAGCACTACCAAGCACTGGAACACCTACCCATCGCCCTTTCATCTTACCcctgtattgtttgttaataaaGCCTCCCTCCCGGGtctttattttga

Function

symbol description
zfpl1 Predicted to enable metal ion binding activity. Predicted to act upstream of or within vesicle-mediated transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in Golgi apparatus. Is expressed in several structures, including gill; heart; integument; liver; and pleuroperitoneal region. Orthologous to human ZFPL1 (zinc finger protein like 1).

NR:

description
PREDICTED: zinc finger protein-like 1

GO:

id name namespace
GO:0016192 vesicle-mediated transport biological_process
GO:0006810 transport biological_process
GO:0005794 Golgi apparatus cellular_component
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043239175.1 True 4919 mRNA 0.36 8 25231235 25263124
XM_043239176.1 False 4758 mRNA 0.36 7 25231235 25263128

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122346005 LOC107727699,LOC107595976,LOC107660332 coding downstream 327946 24814609 ~ 24903289 (-)
taf6 taf6,LOC103372846 coding downstream 448587 24759478 ~ 24782648 (-)
sat2b sat2,sat2b,LOC107596022 coding downstream 479953 24749282 ~ 24751282 (-)
LOC122345804 LOC107730346,LOC107595984,LOC107684368 coding downstream 507326 24714443 ~ 24723909 (-)
rangrf rangrf coding downstream 541045 24685346 ~ 24690190 (-)
LOC122345796 pak3,LOC107566210,LOC107712492,LOC103475835,LOC103141826,LOC108245238,LOC107093501 coding upstream 40347 25303475 ~ 25446662 (-)
LOC122345798 dcx coding upstream 207524 25470652 ~ 25523837 (-)
hip1rb hip1r,hip1rb,LOC107571022 coding upstream 354983 25618111 ~ 25651008 (-)
kntc1 kntc1 coding upstream 392379 25655507 ~ 25708679 (-)
trnal-cag_26 NA coding upstream 614543 25877671 ~ 25877755 (-)
G39401 NA non-coding downstream 54886 25175308 ~ 25176349 (-)
G39384 NA non-coding downstream 179717 25051181 ~ 25051518 (-)
G39377 NA non-coding downstream 211744 25019249 ~ 25019491 (-)
G39375 NA non-coding downstream 214394 25016561 ~ 25016841 (-)
trnag-gcc_23 NA non-coding downstream 236003 24995162 ~ 24995232 (-)
G39456 NA non-coding upstream 34748 25297876 ~ 25299229 (-)
G39458 NA non-coding upstream 36395 25299523 ~ 25299916 (-)
G39470 NA non-coding upstream 190384 25453512 ~ 25453834 (-)
G39490 NA non-coding upstream 265755 25528883 ~ 25529111 (-)
G39503 NA non-coding upstream 294168 25557296 ~ 25557522 (-)
LOC122345923 NA other downstream 472567 24754202 ~ 24758668 (-)
naa38 naa38 other downstream 482625 24746672 ~ 24748610 (-)
anapc2 anapc2,LOC107559737,LOC107730340,LOC107746468,LOC107683706,LOC107595991,LOC107684355 other downstream 637119 24587724 ~ 24594116 (-)
tmc2a tmc2a,tmc1,LOC107684381,LOC107596032,LOC108437175,LOC107730318,LOC108259782 other downstream 953931 24265464 ~ 24277304 (-)
G39113 NA other downstream 1030739 24197705 ~ 24200496 (-)
G39413 LOC102215562 other upstream 18758 25281886 ~ 25282286 (-)
LOC122344921 NA other upstream 298846 25561974 ~ 25568686 (-)
LOC122345426 smpx,LOC107705278,LOC107671350,LOC107590224,LOC107663668,LOC107586736,LOC107721880 other upstream 1836687 27099815 ~ 27107385 (-)
isca1 isca1,LOC107702919,LOC107662049 other upstream 2119793 27382921 ~ 27398741 (-)
LOC122344874 NA other upstream 2622913 27886041 ~ 27895454 (-)

Expression


Co-expression Network