slc25a25b (slc25a25,slc25a25b,LOC106570619,LOC107712386,LOC107587368,LOC107664407)


Basic Information

Item Value
gene id slc25a25b
gene name slc25a25,slc25a25b,LOC106570619,LOC107712386,LOC107587368,LOC107664407
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 7624124 ~ 7640250 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
slc25a25b Predicted to enable calcium ion binding activity. Acts upstream of or within left/right pattern formation. Predicted to be located in mitochondrial inner membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human SLC25A25 (solute carrier family 25 member 25).
slc25a25 Predicted to enable ATP transmembrane transporter activity. Predicted to be involved in ATP transport and transmembrane transport. Predicted to act upstream of or within several processes, including adipose tissue development; response to activity; and response to food. Predicted to be located in mitochondrion.

NR:

description
calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2 isoform X1

GO:

id name namespace
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GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0005509 calcium ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K14684 SLC25A23S; solute carrier family 25 (mitochondrial phosphate transporter), member 23/24/25/41

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043239866.1 False 4651 mRNA 0.45 11 7624124 7640250
XM_043239867.1 False 4616 mRNA 0.45 10 7624124 7640248
XM_043239868.1 False 4614 mRNA 0.45 10 7624124 7640249
XM_043239869.1 False 4617 mRNA 0.43 11 7624124 7635670
XM_043239870.1 False 4501 mRNA 0.44 10 7624124 7640250

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
uap1l1 uap1l1,LOC107598388,LOC107737483,LOC107681846,LOC107712387,LOC107664408,LOC107587443 coding downstream 652 7619097 ~ 7623472 (-)
zdhhc12b zdhhc12b,LOC107597310,LOC107712389,LOC107737479,LOC107681847,LOC103035983 coding downstream 5160 7613889 ~ 7618964 (-)
iscub iscub,iscu,si:ch211-191d15.2,LOC102784710,LOC100705178,LOC103373105 coding downstream 25229 7596285 ~ 7598895 (-)
ungb ungb,LOC107681856 coding downstream 63013 7558279 ~ 7561111 (-)
myo1hb myo1hb,LOC107681857,LOC107723363,LOC107740942,LOC107660767,LOC107587362 coding downstream 66416 7541242 ~ 7557708 (-)
si:dkey-220k22.1 LOC107664520,LOC107597375,LOC107748505,LOC107664410,LOC107712354 coding upstream 85711 7725961 ~ 7780945 (-)
camkk1a camkk1a,camkk1,LOC107587369,LOC107664416,LOC107712376,LOC107664519 coding upstream 154500 7794750 ~ 7829765 (-)
atp2a3 atp2a3,LOC107597397,LOC107664518,LOC107712375,LOC107587360,LOC107748501,LOC107664409 coding upstream 224887 7865137 ~ 7911974 (-)
zzef1 zzef1,LOC107712353,LOC107748500,LOC107664397,LOC107598082,LOC107664510 coding upstream 297921 7938171 ~ 7973561 (-)
ankfy1 ankfy1,LOC107597410,LOC107664513,LOC107587357,LOC107664399 coding upstream 336397 7976647 ~ 7992530 (-)
G34025 LOC107587446,LOC107597252,LOC107723353 non-coding downstream 45912 7572160 ~ 7578212 (-)
LOC122345617 NA non-coding downstream 125336 7495614 ~ 7498788 (-)
LOC122345654 NA non-coding downstream 164013 7450377 ~ 7460111 (-)
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G33985 LOC107691047,LOC107597997,LOC107723329,LOC107740940,LOC107693835,LOC107587379 non-coding downstream 287579 7334414 ~ 7336545 (-)
G34214 NA non-coding upstream 2720 7642970 ~ 7644229 (-)
G34248 NA non-coding upstream 71793 7712043 ~ 7712494 (-)
G34231 NA non-coding upstream 77323 7717573 ~ 7760165 (-)
G34260 NA non-coding upstream 221225 7861475 ~ 7861829 (-)
G34265 NA non-coding upstream 296261 7936511 ~ 7937371 (-)
G33998 LOC108444092 other downstream 226971 7382346 ~ 7397153 (-)
usp20 usp20,LOC107691016,LOC107693839,LOC107710745 other downstream 680921 6922846 ~ 6943203 (-)
G33758 LOC107596916,LOC107710760,LOC107700938,LOC107587412,LOC107693817 other downstream 797942 6824171 ~ 6826182 (-)
G33175 NA other downstream 3001066 4622490 ~ 4623058 (-)
LOC122346168 srrm4,LOC107720865,LOC107702227,LOC107561260,LOC107656798 other downstream 3431043 4144856 ~ 4193081 (-)
LOC122345606 LOC107712378 other upstream 66720 7706970 ~ 7711824 (-)
si:dkey-220k22.3 NA other upstream 78315 7718565 ~ 7721758 (-)
si:ch211-117m20.4 si:ch211-117m20.4,LOC107663429,LOC107597540,LOC107717881,LOC107677428,LOC107677427 other upstream 520627 8160877 ~ 8164026 (-)
G34372 zbtb44,LOC107597664,LOC107717865,LOC107677410,LOC107587334,LOC107722796 other upstream 771632 8411882 ~ 8414806 (-)
timm8b timm8b,LOC107717885,LOC107598437 other upstream 789450 8429700 ~ 8431586 (-)

Expression


Co-expression Network