dnajb5 (dnajb5,LOC107746810,LOC107681063,LOC107708641)


Basic Information

Item Value
gene id dnajb5
gene name dnajb5,LOC107746810,LOC107681063,LOC107708641
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 15480180 ~ 15493670 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043240354.1
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>XM_043240355.1
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>XM_043240356.1
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Function

symbol description
dnajb5 Predicted to enable chaperone binding activity and unfolded protein binding activity. Predicted to be involved in chaperone cofactor-dependent protein refolding. Predicted to act upstream of or within protein folding. Predicted to be active in cytosol. Orthologous to human DNAJB5 (DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B5).

NR:

description
PREDICTED: dnaJ homolog subfamily B member 5

GO:

id name namespace
GO:0006457 protein folding biological_process
GO:0051082 unfolded protein binding molecular_function

KEGG:

id description
K09511 DNAJB5; DnaJ homolog subfamily B member 5

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043240354.1 True 4024 mRNA 0.38 4 15480180 15493024
XM_043240355.1 False 3957 mRNA 0.38 4 15480180 15493594
XM_043240356.1 False 3942 mRNA 0.38 4 15480180 15493670

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
akr1a1a akr1a1a,LOC107602015,LOC107708643,LOC107676648,LOC105901177,LOC108414433 coding downstream 3107 15472092 ~ 15477073 (-)
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mtmr12 mtmr12,LOC107746804,LOC107552602,LOC107708634,LOC107602020 coding downstream 187298 15280214 ~ 15292882 (-)
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si:dkey-65b12.6 LOC107746818,LOC107680961,LOC107552589 coding upstream 96214 15589884 ~ 15604332 (-)
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npr3 LOC107681138,LOC107746807,LOC107552598,LOC107602007,LOC107708637,LOC107661273 other downstream 112767 15350016 ~ 15367413 (-)
zfr zfr,LOC107746805,LOC107681158,LOC107552600,LOC107602019 other downstream 171740 15293856 ~ 15308440 (-)
pdzd2 pdzd2,LOC107746802,LOC107681406,LOC107661237 other downstream 215235 15205951 ~ 15264945 (-)
LOC122345141 LOC107752369,LOC107661250,LOC107567461 other downstream 1177799 14292063 ~ 14302381 (-)
znhit1 znhit1,LOC107752359,LOC107661214,LOC106567874 other downstream 1197560 14279674 ~ 14282620 (-)
alkbh2 alkbh2,LOC107746816,LOC107552593,LOC107676640 other upstream 74349 15568019 ~ 15578967 (-)
cenpv cenpv,LOC107718355,LOC107676655,LOC107746825,LOC107680877,LOC107553589,LOC107552586 other upstream 209863 15703533 ~ 15709430 (-)
emc6 emc6,LOC107680863,LOC107746824,LOC107552584,LOC107553592,LOC107552561 other upstream 231357 15725027 ~ 15728108 (-)
fam222ba LOC107552581,LOC107746861,LOC107680853,LOC107676666,LOC107553569,LOC107680837,LOC107552580,LOC107746822,LOC107746829,LOC107680824,LOC107552579,LOC107676664,LOC107553594,LOC107718349 other upstream 249070 15742740 ~ 15808380 (-)
cxcl11.4 LOC107718357,LOC107746875,LOC107553578,LOC107676639,LOC107680777,LOC107552559,LOC107553571 other upstream 346656 15840326 ~ 15841678 (-)

Expression


Co-expression Network