G43700


Basic Information

Item Value
gene id G43700
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056704.1
NCBI id CM032073.1
chromosome length 27473687
location 8334362 ~ 8343514 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU64763
TTTAAAGTCAACAGTGGGCATATTTCCATCAGTCATTACAGCTCAGGATAGAGGACAGACTAGGTGCGTGTTGTTGTGGATCTAATGTAACAACCAAAGATAGCAACTGTTGCAGGCAGACACGTAACGTTTGATTCACTGAAGATTAATATTacctattaatattaatattaactctCATGGTATTTATAGGAAGATTAGCAACCCTTTATTCTGGTGTTTCAtgatttttatagttttcatcAAGAACAATGCTGTGAAGGTGGtgtttaaaactttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataaaatgtgacgatgtattttaaaaagaatatgaaGTATACCTGTGTCGTGTAGAGTTAGTTGACAGGACGGTTTAGCTGCCAGGGGTCAAGTGTCAGGTGGCTTTGAAAGATCCCcgtccttcaaaaaaaaaggaggagaaaaagaacacaaaacaagaaGGGTTTGGTTCTAAACGGAACTATTAACATGAGTGGAAAACATGGGAAGAACCAGTGTTTTTCTACAGCCTTCATTGTCTGCAATTTCTATTTAACATATGATTGACAAAAATCTTGCAGGTTTGATGAGCACCCCCTATACTCTACGCTTGAACTTTGACATTTTTGCTTGCTTCTTAAATTAGTAATAGCATCTTAATATACATCTTCCACAAGTGTTAATATCACAAGAAGAATATCACAGTGTATTGTTTCAATAAAGAACCATAAATCAAGAATTAACATTAGGCccgttatatttattattttgagattacaaaaccttttttttgacaaacattCACATCAGTAATGAGTCTTATGGGTTTAGCTAGTAGAAGgggattttttaaatagtggtttcatttttcattttggtttatatttcatcaaattcttttttttaatcaaaataaagtctttttttttgtaaatggctTTATGTGAATTATGCAAGCTGCAAGTGATgtatgacaaattaaaaaaaagcaaaaacagtaaaGCACGTAGTAATTCTTGGTGTACTGGAGCACAGTATTTTGTGAGCCAGCTTCTCATTTTAGGATTCCCGGTGAACTTCCTCCCAGAGTGGAGCTGTTTCTCTCTATGCCTTTTAATGCCTGCTGATATTCTGGCGCCGGTTCTGTCTGTGCTGGACAGTGCCCAGCCTTTTTCTTTCCTCATCCATCGCTCTTTTGATCTAGCCCTTCATTCTCCTGGTGCTGTTAACCAGCGCCACGGGAAGTGGCTTTCTGCCGACGACTGCCAGACTGGACACAcagacaacatttttttttcataattgttaTGTAACGTGCAAGCAGGCTTCCAGCATATTTCTCTTGCTCAGATACAGCTAAATatagcacacaaacacacacacacacacacacacactcaaattcatcaaaacaattaaatgaggTGTGtgagcatttctttttttttttttttggtctctctTAAATGGGCCGTTATTGTGCTGTTATTTGTGTGGATTTTAGATGGCTGTTTTGCCCACGTAATCCTTTTGAGAGGTTATATGTTAGTTTGTTCAGCCGTGATTTTGAaattcagcctttttttttttacagatcaGAAGCACTGATCTGTAATATTTCCAGTTTCCAAAAGCACGCAAATCATGCTTGTCTGTTTAGCTTGACAGCAGATTTTTACTGCAATcgggtcacactttatattaggtgtccttaactactatgtgcacatcaaaaaataagcgcaatgtacttattgtgttcatattgtactaAAAAACTACtactgaggtgggatacgggttaAGTTAAGATTAAgagtgggttaaggtgtaaggaaTGGGTCAATAGGGTCATTATAAgtgtaataaagaaaatatatgcacttatatgtaaaaataagcacagtgtatgtacacaataagtgcattgtaccaaatatctattaaaatgtaagtacataggagttaaggccacctaatataacaTCTATGTTTTTCTCATACCCGAGTACAATTTGTACCTTCCCCCAAAATAAACCCATAACATGGtactcaatgttttttttttttttaatattttaaacaacaacacCAACAATGTTTCAGTGATGGCGATGATGTCAGTTATGTTGCACTCCCCTATGACttgcagaaatattttttatacacgTTTGTTTAATTTAGAGATTACAGCATTCCAGAAAGATCAGAGGGGGAACATTTACAACTAGAGCAAAAAGCAGTAATCTTCAAAAGAGAGGCATTAAACACGTGAAGCACAAGAAAAGACAACGAGAACTTCAGAAATCAACCATGTCATATCTTTCCACAGCAGTCTCGCTCTTTAATTTTGgcacgtttttcttttttctttttgttgggtcaataataaaaaaaagtcaagacaGAATAGAAagaataaaacttaaaaataaatcaaacactaCTAAGCCTTCAGTACCACGTGTCTATCAACGCTTGTTTTTAAGTTGAGATGTTAATGGCTGGATGTCGGATGACGTTTCACAAGAGATTAACTGAACGGATGTTGTGTGCTAATGAAGAGAACGGCTAAGACCGACACTTAAATAGCAAAGTAGTTTTACACAATGATCCGAGTGCTGGCAAGTCCACACATTTCTCTCAAAAGTTTCTTTCTACATCTACACTGCGTCAAGAtgaaaatgttgcataaatcaatttatttaaaaaaaaaacccagcaatGGTTATGGTAATGTGTGATAGATTTTAACAACCCATCGTAAATAGTGCAAGGTGGATGGTCTGGAATCGCAACATATTATTTAGAATAAGTTAAAGTTGCTGCGCCGTAACAATTGCTCGGTGAAGGCTACAGGAAAAATCATTTCGCTCTGAATAGAAATTATATTCCACAGAAATACGCTGCCCCTGAGGTGGccaaattttcaaaaataactaGTTGTCATTCGGGGGACTGGTTGTGTGTGTCGTTCCTGTCAAATAATGCACAGTGCACCAGCTTGAAatatccattttttttgtttgtagtttTACTGGCTATGATTTTTACTGGCTttgaatgtacagtatgtacaaTATGACATGGAAATGGTAAATAATACACTACCAAGTTTGGCAAAACCAAGacacttttatgtttttgaaagaaattgctCCTTCTGTCTGCCgagcagtaaaaataaaaattactgcTTGAAATAACtacttttgtatattttcaaatacaattttagcAGTGATGACAAAGAGCTGGTTTCAGAAGCCGTCCGTCGCTCCAGTCTGATACAAACATTTGTTAGAAAGTCTTTAAGAATTCTTTTGAATGTGCCTGTTTTGAACTCAACACAAATGATTGTACAGTATAATAAGACTGCAGGTAAAAAGAACaacggcttttttttttttttttaaagaaacagagtttttttaagaaagtaaCTACCACATGGAGAGAAGTGGACAGCCCATCTCTAGTTTGAGGAGCAAACACCAGCTAGAAGATGTACTGAACCGTACACAATTAAGTCCATTTATAGAAAGGTATGAATTTAAGTTTTCTAGTGTTGACCTGAGGTTCACGGGAAGAGCCAAAACAAGCCAAAACACTCATGGGACGTGCTGAAGAAAGCAGGAGAATGTCTTAATAAGCTGCTTAAATACTGAATGCTGCGCATGTAAGACTCTTCTGAATAACGCGGCATTGGTAacattgtaaaacatttctgataaaTTTGATGCGTCCTAGTttaataagtttaaaaaaaatgtcttggcATTTCCTAACCTTGTAAGGGTAGTGTAGTTGAATGACGGGATGCCGGCAGTTAATGGAGAAGCTGCATTTTAAGATTATGGAATAGAAAGCCATTAGTCTCTATGCCCAAGCAGTCTATTCTTCCTGCTCCTCATACCCCCACTCtctgtctgatctcagcattCATCTCTAGCTTGTCTCCCAGCGGAGCGTATCAAGGAAATAGAGTAGGAGGGGTTCAAGGCTGAGGTAGATGGGGAGCAGCGAAGCAGTCTTTATCTAAGGGTGAGGAGGGTTTAAGCACCATGGAGTACATCACACTTCATTTTCAGCTCTGAGTCCTTCTCATGTCATCTCCGAAATCCACCACTCAAGGGCTTTCCTCTTGAGATGATCTTAACCGCCGTTGTCCAGTACACGTTGCAGGTCTGTGTTAGTTCTTGACACATTACAAGATCGTTTAACACAAAGCGGAGGGAGGTGTCggtaaaaaacacaacagaaacaatgAAAACCTGCGACCGGTATGGAATTTCCCACAAATTCAGAATATCGCTTGAGTAGTGCACCGTGGTGCAGATGTTTCAGaaatttataacaaaatatttgtcTCGTTTGCAGTTGGGTCTATTGATGTCAACGTTACAAGAATCGGTCGTCGCGTTTTGCATATGAAGACAGTCCGTTGAATGTTTGGTGAGTTTATGCTGAATAGTTGTGCTACACATCTTGCCTCGGAAACACAGAGGTAGTCATTTCCATGACTAGTAGTAGTGACCTAcagatgtgttactgttaactTTGTGCTCTAATGTGGGAGATGGCGGATAAGAACATGTCGGGCCTGAGTAAAATGCAGCATGCAGGGCTTTTCCTCAAGATAAATGATTCATGAAAACAACGCGAGAACATTTCACCCCGGTCTCATGACCGCAAAAAGCTGCAGAAAACGACCAGTTATGAAATTAATGTCCAGAAAAGGATCATGTGCTAATCGCTATTGATTAAACTGTCTCGCTCAATGATAAAAGGATATACCAAGAGAGgaataatctttaaataaagaaaagtaagAAGAGATTTGCATGCCAAATGAGATGTCTGTGGGATAGTGGTGTATTTAATCGTTGTTAGTCTTTTCTGCTGCACAGTCATAGAATGATTATTGGTACCTTCAGGTGAACCATgagagataaaataataaatctgttaAATCCAC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Function

NR:

description
PREDICTED: SET domain-containing protein 5 isoform X2

GO:

id name namespace
GO:0005886 plasma membrane cellular_component
GO:0071944 cell periphery cellular_component

KEGG:

id description
ko04727 GABAergic synapse
ko04723 Retrograde endocannabinoid signaling
ko05032 Morphine addiction
ko05033 Nicotine addiction

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU64763 True 9093 lncRNA 0.37 3 8334362 8343514

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mtmr14 mtmr14,LOC107716897,LOC107710166,LOC107569464 coding downstream 28775 8295300 ~ 8305587 (-)
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setd5 LOC107710169,LOC107716898,LOC107656119 coding upstream 3247 8346761 ~ 8374675 (-)
si:dkey-19e4.5 si:dkey-19e4.5,LOC107586347,LOC107562898,LOC107710172,LOC103025619,LOC108427613,LOC108272187 coding upstream 31298 8374812 ~ 8379041 (-)
plxnb1b LOC107755667,LOC107586348,LOC107656121,LOC107691484 coding upstream 37626 8381140 ~ 8417770 (-)
cfap100 cfap100,LOC107562886,LOC107691496 coding upstream 87930 8431444 ~ 8439385 (-)
gga1 gga1,LOC107712552,LOC107656124,LOC107586353,LOC107710174,LOC107691488 coding upstream 123224 8466738 ~ 8479836 (-)
G43697 NA non-coding downstream 19739 8314423 ~ 8314623 (-)
G43691 NA non-coding downstream 40076 8294054 ~ 8294286 (-)
G43660 NA non-coding downstream 151480 8182679 ~ 8182882 (-)
G43513 LOC107688815 non-coding downstream 283684 8049397 ~ 8050678 (-)
G43528 NA non-coding downstream 476766 7856465 ~ 7857596 (-)
G43709 NA non-coding upstream 105624 8449138 ~ 8450686 (-)
G43712 NA non-coding upstream 107273 8450787 ~ 8452319 (-)
G43710 NA non-coding upstream 110617 8454131 ~ 8454863 (-)
G43719 LOC108424762,LOC107710154,LOC107562891,LOC556764 non-coding upstream 117392 8460906 ~ 8466646 (-)
G43734 NA non-coding upstream 152250 8495764 ~ 8496633 (-)
G43514 spega,LOC107731772,LOC107688815,LOC107586363,LOC107719300 other downstream 286354 8047102 ~ 8048008 (-)
LOC122346476 cidec,LOC107731779,LOC107688813,LOC107694911,LOC107710160 other downstream 563911 7737090 ~ 7770451 (-)
G43463 nomo,LOC107677623,LOC107562229,LOC107709581,LOC107733372,LOC107688882 other downstream 747995 7579895 ~ 7586367 (-)
nomo nomo,LOC107677623,LOC107562229,LOC107709581,LOC107733372,LOC107688882,LOC107586361 other downstream 1004797 7316947 ~ 7329565 (-)
LOC122346787 unc80,LOC107733373,LOC107677624,LOC107688825 other downstream 1019588 7274840 ~ 7314774 (-)
G43801 pick1,LOC107734822,LOC107734770,LOC107572282 other upstream 365192 8708706 ~ 8713858 (-)
G43890 NA other upstream 917102 9260616 ~ 9261245 (-)
G43896 NA other upstream 922488 9266002 ~ 9267324 (-)
G43899 NA other upstream 925674 9269188 ~ 9270922 (-)
G43900 NA other upstream 927904 9271418 ~ 9272305 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
mexican tetra (Astyanax mexicanus) lhfpl4 lhfpl4,lhfpl4a,LOC107656118,LOC107586345,LOC107716887 misc NC_035909.1 CM008312.1 32279739 ~ 32425396 (-)