G44478 (LOC107749977,LOC107730703,LOC107675437,LOC107564626,LOC107698886,LOC107555394)


Basic Information

Item Value
gene id G44478
gene name LOC107749977,LOC107730703,LOC107675437,LOC107564626,LOC107698886,LOC107555394
gene type unknown
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056704.1
NCBI id CM032073.1
chromosome length 27473687
location 11415273 ~ 11420330 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU65822
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TGTCATTTAGTGAGGCAACTTCTGTGAGGGTAAA
>TU65824
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ATTTAGTGAGGCAACTTCTGTGAGGGTAAA

Function

NR:

description
PREDICTED: volume-regulated anion channel subunit LRRC8D-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU65822 True 5034 TUCP 0.39 2 11415273 11420330
TU65824 False 5030 TUCP 0.39 2 11415273 11420330

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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znf648 LOC107678353,LOC107555382,LOC107733900,LOC107719322,LOC107660466,LOC107564440 coding upstream 484840 10922668 ~ 10930433 (+)
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G44465 NA non-coding upstream 169279 11245685 ~ 11245994 (+)
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G44521 NA non-coding downstream 220751 11641081 ~ 11643698 (+)
LOC122347449 NA non-coding downstream 269362 11689692 ~ 11705926 (+)
G44568 sox14,LOC107679857,LOC107756185,LOC107713406,LOC107713405,LOC107694108,LOC103365676 non-coding downstream 358700 11779030 ~ 12264787 (+)
G44574 hdlbpa,hdlbp,LOC107752661,LOC107694132,LOC107733253,LOC107696756 non-coding downstream 516771 11937101 ~ 11977411 (+)
pik3r6a zgc:158654,LOC107733898,LOC107555378,LOC107704002,LOC107757422,LOC105903457 other upstream 522813 10882960 ~ 10892460 (+)
LOC122347096 LOC107704003,LOC107733914,LOC107555377,LOC107569363,LOC107660471,LOC107757423 other upstream 532374 10870378 ~ 10882899 (+)
atad5b LOC107578257,LOC107710017,LOC107669538 other upstream 1291748 10116617 ~ 10123525 (+)
dgke dgke,LOC107669536,LOC107710025,LOC107710026,LOC107669537,LOC107553311,LOC107591925,LOC107701198 other upstream 1374909 9979865 ~ 10040364 (+)
LOC122346828 mcrip1,LOC107710264,LOC107553315,LOC107710031,LOC107591941,LOC108424716 other upstream 1467344 9944518 ~ 9947929 (+)
LOC122346564 LOC107733248,LOC107694106,LOC107576895 other downstream 581817 12002147 ~ 12010539 (+)
G44588 NA other downstream 667069 12087399 ~ 12092455 (+)
scly scly,LOC107552249,LOC107552250,LOC107752645 other downstream 733938 12154268 ~ 12159899 (+)
LOC122347491 LOC107593172,LOC107593170,LOC107694117,LOC107753639,LOC107552274 other downstream 1101443 12521773 ~ 12526957 (+)
crocc2 crocc2,LOC107593190,LOC107753661,LOC107694109,LOC107752664,LOC107552261,LOC107696746 other downstream 1345491 12765821 ~ 12805700 (+)

Expression


Co-expression Network