G45064


Basic Information

Item Value
gene id G45064
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056704.1
NCBI id CM032073.1
chromosome length 27473687
location 13842734 ~ 13848641 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU66683
ACAGATGAATTTTCACATTCTGGCTTTACAGGAAGAAGCTCCATTATACAAGTTATGGAATGGAACCCCACTTCATCATTCCCAGCTACTTGCTCGTGCTCTAAATTTATCTTCAATTACCTCATCAGTGCTATTATAATAGGGCAGTTCTCTGCCCATGATTCTCTGCGGCGTTGGGGGGTCCCATCTGACCCTGTATGAGTGCTATAAGGCCTGAGAATTGGATTACAGCTTATCCATATCAGCAGCTGTAGCATCCTAACAAAGCCCGTGGGCCCCTGGGCGTATTTCAAGCAAACCAGAATTCACCAAGGACACTCCTGACTGGAAAAGTGGAATGGCAGAGGAATATCCGGTGCCATAATCCTCTTTCCCTCAACACATTACCTGACGCACCAGCACATCGACTGTCTAACACCACCAACAGAAGAGGTAAAACATGCTGTGCAGAAGCGCTACCCAGCCACACAACAAGAGGGTCAGAGTTTATTTCCAGCCTGACAACGGAGCTTCTCTAAATCAGTGTGATCACAACCACACTGACAGGTTGTGACTAACCCATGCAATGCCcctaaatcacacacacgctggGCTCAGACCTCACTGTGTGCTTTTATTCTTAGTGCAGTGAATGAGGGCATTTCAGGTCAAAGCTGCAATACTAAAACTAGAAGCATTGGAATGTAATGTCAATATAtacattgcaaaaaaatcagtaaaatttACTCTACAAAACCGGTATTCTAgcataaaaaatgcagtaacaacgttttatgttttaacataaatttacagttaaataccgtaacaTCATTAAcgatataatgataatattaggTTGAATATAAtacaacctattaaagtactgaaatctgttttgtacatttgaaatacactgataatcACCAAAAGCAGGTgttgatgagaaagtcacatgatgaaccaaaacccgtcacaagcagcttttaaatagtaacatatatatataggaggTGCTctgtgtcattcacacaagcactaaacaccatcatggtgtcgttaatcgcaattaaatgcaataaacattaatctaaCAACATTAGATATAACATGCAATCCTAAGAAACATAACTAAGAAGAAACAGtgattccaaaaaaaacattaaattctaacaatattttaaatgcaatgcagggaattctatGAACttcagtttactttttttttttaaatcagtaatttttttacagtgtacttaaCAGCAAATAACTGCTATTTCAGATGACGTCAGCTTTGGATTGACATACTGTCATGTTGTCCTTATATTACAATCAATATAAGATCAAGCTGTAATCTCAGTGAACACATAATGCTAACTAACCGCATAATATGTATTTTCCTAAGTgtacattaatgttttatacaCATTTCCACACACTCATCCCTGGctaatgacaatattttttaattgttgcacTGAAAcaagtattttctgtaaagctgctaaAACTGACTGTAAAA
>TU66684
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>TU66685
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>TU66686
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>TU66688
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU66683 False 1501 lncRNA 0.37 3 13843005 13848641
TU66684 False 1559 lncRNA 0.38 2 13843005 13848641
TU66685 False 1535 lncRNA 0.37 3 13843005 13848641
TU66686 False 1533 lncRNA 0.37 3 13843005 13848641
TU66688 True 1772 lncRNA 0.38 3 13842734 13848641

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mrpl47 LOC107659009,LOC107732024,LOC107590634,LOC107709209,LOC107692352,LOC107548661 coding downstream 149908 13691026 ~ 13692826 (-)
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dpt dpt,LOC107659007,LOC107732012,LOC107590680,LOC107692436 coding downstream 257366 13578792 ~ 13585368 (-)
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dipk1ab fam69a,fam69ab,LOC107590645,LOC107659006,LOC107566484 coding downstream 281709 13543207 ~ 13561025 (-)
lrrc7 lrrc7,LOC107709201,LOC107692363,LOC107739104 coding upstream 137406 13986047 ~ 14040163 (-)
cldn33b LOC107739195,LOC107591162,LOC107659043,LOC107709197,LOC107590677,LOC107692437 coding upstream 277933 14126574 ~ 14128317 (-)
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pde4ba pde4b,pde4ba,LOC107659050,LOC107692372,LOC108443455,LOC107591166,LOC105913193 coding upstream 436856 14285497 ~ 14402960 (-)
G45058 NA non-coding downstream 5196 13837305 ~ 13837538 (-)
LOC122347350 NA non-coding downstream 7143 13823672 ~ 13835591 (-)
G45039 NA non-coding downstream 145023 13697499 ~ 13697711 (-)
G45036 NA non-coding downstream 148570 13693338 ~ 13694164 (-)
G45014 NA non-coding downstream 231141 13536944 ~ 13611593 (-)
G45195 NA non-coding upstream 5256 13853897 ~ 13858117 (-)
G45197 NA non-coding upstream 11609 13860250 ~ 13860818 (-)
G45198 NA non-coding upstream 12594 13861235 ~ 13861445 (-)
G45206 NA non-coding upstream 63043 13911684 ~ 13972094 (-)
G45225 lrrc40,LOC107590628,LOC107709203 non-coding upstream 132588 13981229 ~ 13981885 (-)
pex5la pex5la,LOC107709207,LOC107590632,LOC107659033,LOC107692357,LOC107548659,LOC107732026 other downstream 56831 13718202 ~ 13785903 (-)
tmem131 tmem131,LOC107659030,LOC107692350,LOC107732007 other downstream 161440 13655260 ~ 13681294 (-)
LOC122347614 rab6ba,rab6b,LOC107696768,LOC107552273,LOC102207753,LOC100696791,LOC107694122,LOC103354239 other downstream 945016 12525756 ~ 12897718 (-)
brdt brdt,LOC107678354,LOC107749988,LOC107675431,LOC107730697,LOC107564432 other downstream 2773268 11055035 ~ 11069466 (-)
gng12b LOC107555383,LOC107678346,LOC107705318,LOC107564436,LOC105895117,LOC108271932 other downstream 2857602 10948692 ~ 10985132 (-)
G45257 ttc22,LOC107590622,LOC107692368,LOC107659045,LOC107591163 other upstream 311834 14160475 ~ 14193166 (-)
LOC122347580 ttc4,LOC107738930,LOC107659046,LOC107709194,LOC107692369 other upstream 1478942 15327583 ~ 15330851 (-)
insl5a LOC107692440 other upstream 1640477 15489118 ~ 15490685 (-)
LOC122346545 LOC107582692,LOC107673508,LOC107711046 other upstream 1686745 15535386 ~ 15685485 (-)
G45606 sec61a1,LOC103358725,LOC108436273,LOC108440718,LOC103023094,LOC106518493,LOC102228108 other upstream 1755269 15603910 ~ 15605470 (-)

Expression


Co-expression Network