G45684


Basic Information

Item Value
gene id G45684
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056704.1
NCBI id CM032073.1
chromosome length 27473687
location 16295531 ~ 16298954 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU67634
CCTGTAGTGGAAGCTGTATCCGCCGTCGTCATAAATGTCTCCTCTCCATTGGCAAAATACTTGATGCAGATCTGGAGTGTGGCACCGCAACTTTATATCACCTGAAAATTGGCCAGATACTGAAAGGTGACTGCACATTTTACTGTTATGTTACCTaggttcatttttttctctgtttttgtaGTAGTAGGGGATAGTtcacatgaaaataaacattgtcAAATTACACACTCTCATGTTCCAAATGTCCGcgagaaatgcaaaaaagttaACCAGAATGACAACTTTAGTGcgcattcactttcattataagGGAAAAAATGCTAAGAAAGTGAGAGTTCCCAACATTTTGTCTAATATTGTGCCACTGAGAAAAATGCCTAATTGACTtcatatgatatttaattatttgtaagatgtttgcaataaatgtcaaataCATGTTTAGACTGAgtttgaaattttgaaaaacatatGTCGCCAGCTGCTAATATGGTGATGTGGTGCTTAGGAAAATGGTCCAGTTGattcagagaaaataaaagaaaacagttttttggtGTCAGTGTATTATTGTGGTATAATTCCCTTAAATGCCAAATTAAAAACCAATTGGCCCCTTGTTAGTCAGATATTTATATGGGAGCTTTTTGGGAACTTAGCAAcacattacaatatataatattaaagtttAGTATATACTATACAACAGTTCCTTCTTGCCCTCAAATCTAATTGGCTGAGAGGTGTGCTATATTCAATGTTTGTATCAATCCGCTTGCAGTATTTCTCACAGTGATTTTCACGGGGGAAGAAATTCTACTAcaatttgacagttttttttagttgagAATGTAGTTTGTATAGATTTCAAGTATGCGAtatgttaataaagaaaatatttaaaattagtttcAACATTTTCAGAGATTTGTTCAGTTTAGTCTTGCCCATAGTTCTTGCCTCAGCTAGATCTGCTGGAATTTGATGCTGGCTCTGATGTCCCTGGTTAAACATgcaatataatttgttttgggGAAAATATAATGGGCATAGAATTTAAGCTATATTCGTTCCAGAGCTAATAGTTTTTGCCGTtgttggttgttgttgttgtttattaaattattcaataaataatatttatataaataatagtatatttaacataataaaattattaggCATTGAGAAATGGTGATCGTTGTTCCATTAGATGGCGACAATTTGACTGTTCTTATATGAGTGACTCAGcattaaagacttttaaattaaaaaaaagacttcaatAGGGTTGTAAACAAGGAAGCTACTTTTACTTTCAACGGTTTGGCAACAAGAGCAGCCAACAAATGCACTGAGCAGTGCTGTTATTGGATGTTCAAACTAAATGAGAATATGAGATCAAGATGAAGAATGAATGCTGGACCAGATGCAGGCAATCGCACTCACTCAGTCCATCTGTCTCTTATTATATAGTGAGCTTTtaatacagaaacacaaaagtTTTCAATGGAGCGACTTAATGTTCCTTTGTTACTAGATTCTTATGTATTTCTACACTCATGCCATCAAATCATCGTATAAATGCAATATCACCTGCGACTGAATCAAAGCCGTGCTGAGATAAAGGCATATCGCACTGCTGCTCGTCCGATATTGCTCATTTATTATCAGTTAcagtaaacataacattttaacatattgtATTAAGACATGATGTGTTAGTTATGAgctcttaatttaaaaaaccttCAATTTTGCTTTTGTCCTCATATGGAACACAAATTCCATTCAGTGTGCTGAGATGGAGGCTGTGTTGATGCTAAATGTGGAAACAATTCTGCATTTCATTAAATCTAGACTTGAATAAAAGAGCTTAAAAAATGGAGTTTCAAGGGAGTTTCAAAACAAAGGTTGGTGTTGCTTGTGCCACACTATTTCCAACTCTCACCTGCTGTTTGTGGCACCATAGCTGTTACAGTACTTGACCAGTCACTCCAAAAACCACGTCCAGCCTTGACTCTCACTTGCACTGTGCAGTTTTCTCCTGCGACCAGAGACACAAGCTTGTGGGAGTGTTTTGACACCTTTTAACTGTGCCTGACGTGTGTTTGGATCTGTAATGAATTTCATACTGCATGGTCATTGGaaagcttttagtttttttccattcaactaaCATTTGGCCGACGTCGCCAGTGGGATGAAGGGAAATATTTGTTGGAGGATACAGAAAAACGCTGATCCTCCACACTGACGGTGCGATTGTAGATGGTTGTGTTGGTATCTCTGTCTATCACTCTGAGGAGCATCTCGACATACGTGAAGACATCGATTGATGGGAATGTGCAAATATTCAGGACCTTTTTCTCCTCATAAGATTGCTGTTTCACAtcacatattttttcttttgatgatCTGTGTGACAGAAACACGTTTTCTTGAAGCAGGTCCTCAACCATCATAAGTGATACATCCCCCATCTCAcattttgtcagattttttaaaaatcaattcttCACAGAGAGTCGAAGCAAACTGCTTAACCATTTCTTTACAGTAAATgataattttagtttaatatgCAGTATGAGATGAAAGTACTTAAAAAGTCCTTATTCATACATTATGTAGACAAAATAATAGGACTTTCCAGCAGGCGCTTCCCAAAAGCAAGTGAAATCGTCTAGATTCCTGGTGAAACATTTTGGGTCTTTATCCACAGCCAAGAGAACAAATTCTGAGGGTGAAAAAACATTCCATGTAGCtgcatttctaataaaatgCAGAGTTTCCCTGCATCTAGCATTCACTGAAGATTTTACACTTTTCTCTACTAAATGCTCCCTCAAAATTCATGTCTTAAATCAACACTTTTTCCACTGCTAAAACACAACTAGAACAGCTATAACAACTCTTTAGCAGAATTaacttaacataaaataaataaatacacaatgaaCTAAGCAGATGTCTTACCTTGCTTTGATAGTTGAGGCTCTAAATGCACCTGCTCGATCAGACAGGAAAAAAGTATCCACCAGGCAAGTGCTGAATCCATCATGTACATAGGGCATCCATACAtatgactttttaaatatctaGATATGTCAGTGTTCAGTACTTTATGTTTTTAGAAGAGGGCGGGGAGGTTGGTAAGTGGTCATCAGACAGGGTCCAATGTAATAGGAAGTGGTTGCACTGGGGATTGAGGCATGCTCCCCG
>TU67635
CCTGTAGTGGAAGCTGTATCCGCCGTCGTCATAAATGTCTCCTCTCCATTGGCAAAATACTTGATGCAGATCTGGAGTGTGGCACCGCAACTTTATATCACCTGAAAATTGGCCAGATACTGAAAGGTGACTGCACATTTTACTGTTATGTTACCTaggttcatttttttctctgtttttgtaGTAGTAGGGGATAGTtcacatgaaaataaacattgtcAAATTACACACTCTCATGTTCCAAATGTCCGcgagaaatgcaaaaaagttaACCAGAATGACAACTTTAGTGcgcattcactttcattataagGGAAAAAATGCTAAGAAAGTGAGAGTTCCCAACATTTTGTCTAATATTGTGCCACTGAGAAAAATGCCTAATTGACTtcatatgatatttaattatttgtaagatgtttgcaataaatgtcaaataCATGTTTAGACTGAgtttgaaattttgaaaaacatatGTCGCCAGCTGCTAATATGGTGATGTGGTGCTTAGGAAAATGGTCCAGTTGattcagagaaaataaaagaaaacagttttttggtGTCAGTGTATTATTGTGGTATAATTCCCTTAAATGCCAAATTAAAAACCAATTGGCCCCTTGTTAGTCAGATATTTATATGGGAGCTTTTTGGGAACTTAGCAAcacattacaatatataatattaaagtttAGTATATACTATACAACAGTTCCTTCTTGCCCTCAAATCTAATTGGCTGAGAGGTGTGCTATATTCAATGTTTGTATCAATCCGCTTGCAGTATTTCTCACAGTGATTTTCACGGGGGAAGAAATTCTACTAcaatttgacagttttttttagttgagAATGTAGTTTGTATAGATTTCAAGTATGCGAtatgttaataaagaaaatatttaaaattagtttcAACATTTTCAGAGATTTGTTCAGTTTAGTCTTGCCCATAGTTCTTGCCTCAGCTAGATCTGCTGGAATTTGATGCTGGCTCTGATGTCCCTGGTTAAACATgcaatataatttgttttgggGAAAATATAATGGGCATAGAATTTAAGCTATATTCGTTCCAGAGCTAATAGTTTTTGCCGTtgttggttgttgttgttgtttattaaattattcaataaataatatttatataaataatagtatatttaacataataaaattattaggCATTGAGAAATGGTGATCGTTGTTCCATTAGATGGCGACAATTTGACTGTTCTTATATGAGTGACTCAGcattaaagacttttaaattaaaaaaaagacttcaatAGGGTTGTAAACAAGGAAGCTACTTTTACTTTCAACGGTTTGGCAACAAGAGCAGCCAACAAATGCACTGAGCAGTGCTGTTATTGGATGTTCAAACTAAATGAGAATATGAGATCAAGATGAAGAATGAATGCTGGACCAGATGCAGGCAATCGCACTCACTCAGTCCATCTGTCTCTTATTATATAGTGAGCTTTtaatacagaaacacaaaagtTTTCAATGGAGCGACTTAATGTTCCTTTGTTACTAGATTCTTATGTATTTCTACACTCATGCCATCAAATCATCGTATAAATGCAATATCACCTGCGACTGAATCAAAGCCGTGCTGAGATAAAGGCATATCGCACTGCTGCTCGTCCGATATTGCTCATTTATTATCAGTTAcagtaaacataacattttaacatattgtATTAAGACATGATGTGTTAGTTATGAgctcttaatttaaaaaaccttCAATTTTGCTTTTGTCCTCATATGGAACACAAATTCCATTCAGTGTGCTGAGATGGAGGCTGTGTTGATGCTAAATGTGGAAACAATTCTGCATTTCATTAAATCTAGACTTGAATAAAAGAGCTTAAAAAATGGAGTTTCAAGGGAGTTTCAAAACAAAGGTTGGTGTTGCTTGTGCCACACTATTTCCAACTCTCACCTGCTGTTTGTGGCACCATAGCTGTTACAGTACTTGACCAGTCACTCCAAAAACCACGTCCAGCCTTGACTCTCACTTGCACTGTGCAGTTTTCTCCTGCGACCAGAGACACAAGCTTGTGGGAGTGTTTTGACACCTTTTAACTGTGCCTGACGTGTGTTTGGATCTGTAATGAATTTCATACTGCATGGTCATTGGaaagcttttagtttttttccattcaactaaCATTTGGCCGACGTCGCCAGTGGGATGAAGGGAAATATTTGTTGGAGGATACAGAAAAACGCTGATCCTCCACACTGACGGTGCGATTGTAGATGGTTGTGTTGGTATCTCTGTCTATCACTCTGAGGAGCATCTCGACATACGTGAAGACATCGATTGATGGGAATGTGCAAATATTCAGGACCTTTTTCTCCTCATAAGATTGCTGTTTCACAtcacatattttttcttttgatgatCAGCAGGCGCTTCCCAAAAGCAAGTGAAATCGTCTAGATTCCTGGTGAAACATTTTGGGTCTTTATCCACAGCCAAGAGAACAAATTCTGAGGGTGAAAAAACATTCCATGTAGCtgcatttctaataaaatgCAGAGTTTCCCTGCATCTAGCATTCACTGAAGATTTTACACTTTTCTCTACTAAATGCTCCCTCAAAATTCATGTCTTAAATCAACACTTTTTCCACTGCTAAAACACAACTAGAACAGCTATAACAACTCTTTAGCAGAATTaacttaacataaaataaataaatacacaatgaaCTAAGCAGATGTCTTACCTTGCTTTGATAGTTGAGGCTCTAAATGCACCTGCTCGATCAGACAGGAAAAAAGTATCCACCAGGCAAGTGCTGAATCCATCATGTACATAGGGCATCCATACAtatgactttttaaatatctaGATATGTCAGTGTTCAGTACTTTATGTTTTTAGAAGAGGGCGGGGAGGTTGGTAAGTGGTCATCAGACAGGGTCCAATGTAATAGGAAGTGGTTGCACTGGGGATTGAGGCATGCTCCCCG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU67634 True 3228 lncRNA 0.36 3 16295531 16298954
TU67635 False 2993 lncRNA 0.37 4 16295531 16298954

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
orc1 orc1,LOC107551039,LOC107594609 coding upstream 3472 16284228 ~ 16292059 (+)
ccdc17 LOC107684240,LOC107551021,LOC107731625,LOC107594632 coding upstream 23625 16267202 ~ 16271906 (+)
gpbp1l1 gpbp1l1,LOC107731630,LOC107551044,LOC107725200 coding upstream 28551 16257283 ~ 16266980 (+)
pik3r3b pik3r3b,pik3r3,LOC107675943,LOC107717145,LOC107692397,LOC107594617 coding upstream 180801 16105061 ~ 16114730 (+)
LOC122347284 mast4,LOC107740425,LOC107684348,LOC108437187,LOC107730326,LOC107681051 coding upstream 190669 16074460 ~ 16104862 (+)
c6h1orf210 LOC107724134,LOC107684305,LOC107692441,LOC107725196,LOC107594641,LOC107551026 coding downstream 21434 16320388 ~ 16325619 (+)
ap1m3 ap1m3,LOC107724146,LOC107684323,LOC107692442,LOC108441657,LOC103463064,LOC103355575,LOC104919037 coding downstream 26790 16325744 ~ 16338484 (+)
lrp8 LOC107724141,LOC107684070,LOC107758363,LOC107692412 coding downstream 126465 16425419 ~ 16560115 (+)
il23r LOC107724136,LOC107684101,LOC107692414 coding downstream 281584 16580538 ~ 16591744 (+)
il12rb2 LOC107684120,LOC107724137,LOC107551010 coding downstream 294284 16593238 ~ 16604160 (+)
G45643 NA non-coding upstream 139770 16152182 ~ 16155761 (+)
G45635 NA non-coding upstream 178252 15888757 ~ 16117279 (+)
LOC122346530 NA non-coding upstream 489966 15804288 ~ 15805565 (+)
G45459 LOC107711016,LOC107673510,LOC107748416 non-coding upstream 650405 15644034 ~ 15645126 (+)
G45470 uroc1 non-coding upstream 657007 15637946 ~ 15638524 (+)
G45794 mier1,LOC107551013,LOC107758364,LOC107724131 non-coding downstream 265000 16563954 ~ 16565233 (+)
G45785 uap1,LOC107724142,LOC107551035 non-coding downstream 356744 16655698 ~ 16656620 (+)
G45815 LOC107551035,LOC107724142,LOC107692418 non-coding downstream 359725 16658679 ~ 16659687 (+)
LOC122346974 c6h1orf226,LOC107551033,LOC107684213,LOC107711121,LOC107594625,LOC107732445,LOC107692421 non-coding downstream 371410 16670364 ~ 16679093 (+)
G45817 nos1ap,LOC107594625 non-coding downstream 383787 16682741 ~ 16691061 (+)
G45448 LOC107585177,LOC107673508,LOC107711046,LOC107748403,LOC107582692 other upstream 728863 15564981 ~ 15566668 (+)
G45419 sgip1,sgip1a,LOC107739126 other upstream 836145 15358861 ~ 15459386 (+)
pomgnt1 pomgnt1,LOC107675946,LOC107692396 other upstream 1051251 15236165 ~ 15244280 (+)
meltf mfi2,LOC107692364,LOC107709202,LOC107659038,LOC107591189,LOC107739178,LOC107590629 other upstream 2315245 13972173 ~ 13980286 (+)
G44887 NA other upstream 2885619 13394229 ~ 13409912 (+)
G45894 NA other downstream 887754 17186708 ~ 17187308 (+)
G46022 NA other downstream 1696237 17995191 ~ 17996717 (+)
tubgcp5 tubgcp5,LOC107585157,LOC107673606,LOC107582726,LOC107753407,LOC107685296 other downstream 1857701 18156655 ~ 18166242 (+)
atp10a atp10a,LOC107673579,LOC107711085,LOC107733604,LOC107685287,LOC107585184 other downstream 2278224 18577178 ~ 18616958 (+)
si:dkey-195m11.8 si:dkey-195m11.8,LOC107585129,LOC107673511,LOC107711061,LOC107667357,LOC107733585,LOC107582701,LOC107711063,LOC107673480,LOC107733603,LOC107582828,LOC107667335,LOC107579851 other downstream 2963630 19262584 ~ 19347629 (+)

Expression


Co-expression Network