LOC122349098


Basic Information

Item Value
gene id LOC122349098
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056705.1
NCBI id CM032074.1
chromosome length 41700998
location 4353061 ~ 4360979 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU74215
ttttaaaatctacagctgaaccaacaaccacaactgttttagCATCTACAAGAGAACAATCAACTACAACTGAGGAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaacaacaactgttttaacatctacaacagaaccatcaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagaACAATCAGCTACATCTGAACAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttgtcatctacaacagaaccaacaaccacaactacTTTAAaatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacagcTACAACAGAACACTCAACTACAACTGAAGAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactggtttaacatctacagcagaaccaacaaccacaaacattttaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagaACAATCAGCTACATCTGAACAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttgtcATCTACAGCAGAACAATCAACTACATCTGAAGAAAGCACCACAACACAGACAGCAACAACATCTGTACCTACAACAAGTACACCTCAGTCAACCACTGAGGCTACAACAAACTCACCTACAACTACAACTTTGTTTACTACTACAGCCCCTCCttcagaaacaacaacaacacaacttATATCTACAGAGGaagcaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgttttgtcATCTACAActgaaccaacaaccacaactgttttgtcatctacaacagaaccaacaaccacaaccactttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttgtAACATCTACagcagaaccaacaaccacaattgtttcaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgtttcaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagaACAATCAGCTACATCTGAACAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttgtcATCTACAGCAGAACAACAACAGAAGAAAGCACCAACACAGACAGCAACAACATCTAAAATCTACAACAG
>TU74229
ttttaaaatctacagctgaaccaacaaccacaactgttttagCATCTACAAGAGAACAATCAACTACAACTGAGGAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaacaacaactgttttaacatctacaacagaaccatcaaccacaactgttttaacatctacagcaaaaccaacaaccacaactgttttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactactttaacatctacaacagaaccaacaaccacaaccactttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgtttcaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgtttcaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagaACAATCAGCTACATCTGAACAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttgtcatctacaacagaaccaacaaccacaactacTTTAAaatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacagcTACAACAGAACACTCAACTACAACTGAAGAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactggtttaacatctacagcagaaccaacaaccacaaacattttaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagaACAATCAGCTACATCTGAACAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttgtcATCTACAGCAGAACAATCAACTACATCTGAAGAAAGCACCACAACACAGACAGCAACAACATCTGTACCTACAACAAGTACACCTCAGTCAACCACTGAGGCTACAACAAACTCACCTACAACTACAACTTTGTTTACTACTACAGCCCCTCCttcagaaacaacaacaacacaacttATATCTACAGAGGaagcaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgttttgtcATCTACAActgaaccaacaaccacaactgttttgtcatctacaacagaaccaacaaccacaaccactttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttgtAACATCTACagcagaaccaacaaccacaattgtttcaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacaacagaaccaacaaccacaactgttttaacatctacagcagaaccaacaaccacaactgtttcaacatctacagcagaaccaacaaccacaacagaACAATCAGCTACATCTGAACAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttgtcATCTACAGCAGAACAACAACAGAAGAAAGCACCAACACAGACAGCAACAACATCTAAAATCTACAACAG
>XM_043245018.1
GTCATGTGACACAAAACAGAGctaataaaaacctaaaatttGAGGACAGCAGTTATTTGCTTTTATCAAGGGACTTAACAGCTTCACCTGTGTGTAAGACTCAGGTGCAAAATGGATTGGgTGGTGTATTTGACAGCTACAAAGATGAGaagaaaaacactaataattgcAGTGTTAAGTTTAGTGTTTTATAGTGCAATAGCTGATTCAGCAAACTCACCTACAACTGCAACAACTGAATACATGACTGTTCTGCCATACTTAGCTGCACAAACAACAGACTTTTGCATACAACTGAAACAACAGCACATTCAATACTGCTCAGCAACAACTGACACAAGCACAGCTGCTTCAACATCTACAACTGAACAAAAAACTACATCTGAACAAAGCACCAtactaaaaacagcaacaacatccCCACCTACAAGTACATCTCATTCTACAACTGGGGTTAGAGCTACAACTTTGTTTACAACTACAGCCCCTCTttcagaaacaacaacaacaacacagctTACATCTACGGCAGAACCAACACCCACAACTGTCTTAACATCTACATCAGGGCAATCAGCTACATTGAAGACAACCACAACATCCCTAACTACAACAAATACAGCTCAATCTACAATTCTGGCTACAACAAACTCACATACTACTAAACAAACAACCccaactgttttaacatctacaacagaaccaacaaaCACAATGGGTTTAACATCTACGGTAAAAAAATCTACATCTGAAGCAAAAACATCCTTACCTACAAGAAGTACATCTCAATCCACAACTAAGGTTACAACAATCTCACCTACAACTACAACTTTGTTTACAACTACAGCCCCTACCTCAGAAACAACTGCAACACAACTCACATCTACGGCAGAAGCAACAACCACAACCTTTTTACCATCTACAGCACAACAATTAACTACATCTGAACATAGCACCacaacacagacagaaacaacaCTCCTGCCTACAACAAGTACAATTCAATTGACAACTGAGGCAACAACAAACTCAACTACAACTGTGTTTACAACTACAGCCCCTGCctcagaaacaacaacaacacaacttATATCTACAGCTGaaccaacaaaaacaactgttttaacaaCTACAACAGAACAATCAACTACATCTGAACATAGCACCACAACACAGACAACAACATCTGTACCTACAACAGGTACAGCTCAATCGACAACAGACATTACAACAAACTTACCTACAACTacaaatttctttaaaactacAGCCCCTCCTTCAGAAACAACACAGCTTATATCTACGGCTAaagcaacaaccacaactgttttaacatctacaacagaacaATCAACTACAACTGAAGAAAGCACCACAACACAGACAGCAACAACATCTGTACCTACAACAAGTACACCTCAGTTGACCACTGAGGTTACAACAAACTCACCTACAACTACAACTTTGTTTACCACCACAGCCCCTCCttcagaaacaacaacaacacaaaacaacaacaacaacaacatctatAGCATCTACAAGAGAACAATCAACTACAACTGGAAACATCTACAAGAGAACAATCAACTACAACTGAGGAAAGCACCACAACACaagcaacaaccacaactgttttaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU74215 False 1318 lncRNA 0.39 3 4353061 4356269
TU74229 True 1642 lncRNA 0.39 4 4353061 4356269
XM_043245018.1 False 1641 mRNA 0.39 4 4356074 4360979

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122349213 LOC107740765,LOC107665753,LOC107571598,LOC107748032 coding downstream 7242 4343102 ~ 4345819 (-)
LOC122349101 LOC107670400,LOC107665746 coding downstream 21292 4326166 ~ 4331769 (-)
dctn1a dctn1a,LOC107665752,LOC107748035,LOC108260758 coding downstream 35341 4296640 ~ 4317720 (-)
LOC122349601 alpk1,LOC107572659 coding downstream 158580 4186569 ~ 4194481 (-)
LOC122349599 LOC107740753 coding downstream 166668 4183344 ~ 4186393 (-)
LOC122349105 LOC107740765,LOC107571598 coding upstream 13222 4374201 ~ 4377134 (-)
LOC122349112 NA coding upstream 25559 4386538 ~ 4395999 (-)
LOC122349212 LOC107572454,LOC107670399,LOC107740765,LOC107571598,LOC107665753,LOC107748032 coding upstream 37291 4398270 ~ 4405088 (-)
LOC122349116 NA coding upstream 44612 4405591 ~ 4409854 (-)
si:cabz01085394.1 NA coding upstream 49376 4410355 ~ 4414884 (-)
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G50093 LOC107572452,LOC107656764,LOC107574007,LOC105895407,LOC106608490 non-coding upstream 78470 4439449 ~ 4441606 (-)
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LOC122348471 pwp1,LOC107658969,LOC105905702 other downstream 2445899 1901590 ~ 1907162 (-)
G49309 LOC107658783,LOC107708003 other downstream 2454235 1898083 ~ 1898826 (-)
G50107 NA other upstream 172067 4533046 ~ 4574002 (-)
LOC122349182 lpcat4,LOC107698138,LOC107574180,LOC107720499 other upstream 664966 5025945 ~ 5029603 (-)
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G50305 NA other upstream 1303833 5664812 ~ 5665720 (-)

Expression


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