G60198


Basic Information

Item Value
gene id G60198
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056706.1
NCBI id CM032075.1
chromosome length 24299999
location 1399728 ~ 1493160 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU89031
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>TU89032
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>TU89033
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>TU89034
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU89031 True 4708 lncRNA 0.35 2 1488254 1493160
TU89032 False 1854 lncRNA 0.35 2 1401489 1493160
TU89033 False 1866 lncRNA 0.35 2 1401489 1493160
TU89034 False 3616 lncRNA 0.36 2 1399728 1493160
TU89035 False 4649 lncRNA 0.36 2 1488254 1493160

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pym1 LOC107701384 coding downstream 147212 1250060 ~ 1252516 (-)
LOC122350094 NA coding downstream 151364 1244834 ~ 1248364 (-)
ap3s1 ap3s1,LOC107661175,LOC107566394,LOC107729057 coding downstream 231271 1160400 ~ 1168457 (-)
dmxl1 dmxl1,LOC107571775,LOC107663590,LOC107704574 coding downstream 341801 1016890 ~ 1057927 (-)
prr16 LOC107713553 coding downstream 395315 998648 ~ 1004413 (-)
dtx1 dtx1,LOC107692206,LOC107671029 coding upstream 1345 1494505 ~ 1523464 (-)
LOC122350659 NA coding upstream 134493 1627653 ~ 1646362 (-)
LOC122349997 NA coding upstream 217198 1710358 ~ 1714221 (-)
LOC122350661 NA coding upstream 278822 1771982 ~ 1777474 (-)
si:dkey-178e17.3 LOC107754395,LOC107671045,LOC107657210,LOC107722861 coding upstream 343963 1837123 ~ 1852539 (-)
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G60187 NA non-coding downstream 130344 1268798 ~ 1269384 (-)
G60169 trim36,LOC107749435,LOC107573790 non-coding downstream 132919 1232076 ~ 1266809 (-)
G60217 NA non-coding upstream 49286 1542446 ~ 1544129 (-)
LOC122350073 NA non-coding upstream 157760 1650920 ~ 1655010 (-)
LOC122350074 NA non-coding upstream 164578 1657738 ~ 1659992 (-)
G60209 NA non-coding upstream 168329 1661489 ~ 1671766 (-)
LOC122350072 NA non-coding upstream 171142 1664302 ~ 1666989 (-)
LOC122350266 dgcr6,LOC107572069,LOC107721026,LOC105899531,LOC103029434 other downstream 42775 1349171 ~ 1356953 (-)
commd10 commd10,LOC107728250,LOC107663591 other downstream 240442 1140698 ~ 1159286 (-)
G60098 NA other downstream 261576 1135401 ~ 1138152 (-)
csgalnact1b LOC107712620 other downstream 660356 732793 ~ 739372 (-)
LOC122349987 LOC107661519,LOC107712504,LOC107726877,LOC107704593,LOC107573347,LOC794598 other downstream 667884 723145 ~ 731844 (-)
LOC122350657 pi4ka,pi4kab,LOC107671001,LOC108440297,LOC107698013,LOC107722847,LOC107559589 other upstream 68386 1561546 ~ 1606609 (-)
G60220 NA other upstream 83645 1576805 ~ 1580616 (-)
pi4kab pi4ka,LOC107574565,LOC107671001,LOC107722847,LOC108440297 other upstream 239704 1732864 ~ 1821650 (-)
LOC122349998 sh3glb2b,LOC107748508,LOC107681863 other upstream 255902 1749062 ~ 1762549 (-)
c8h22orf39 si:ch211-51h9.6,LOC107699642,LOC107560060,LOC107670995,LOC107753003,LOC107754424,LOC107559584 other upstream 566234 2059394 ~ 2061481 (-)

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