G41554


Basic Information

Item Value
gene id G41554
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000006
NCBI id null
chromosome length 13024002
location 2995770 ~ 3006315 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU47174
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU47174 True 10526 lncRNA 0.39 2 2995770 3006315

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000006_02774064_02933983 NRXN2A coding upstream 61787 2774064 ~ 2933983 (+)
CI01000006_02665949_02677083 RASGRP2 coding upstream 318555 2665949 ~ 2677215 (+)
CI01000006_02616480_02616828 NA coding upstream 378931 2616480 ~ 2616839 (+)
CI01000006_02613864_02614742 NA coding upstream 381010 2613754 ~ 2614760 (+)
CI01000006_02531899_02588907 NRG2A coding upstream 406007 2531816 ~ 2589763 (+)
CI01000006_03016090_03016706 NA coding downstream 8822 3015137 ~ 3017314 (+)
CI01000006_03102358_03152576 NRXN2A coding downstream 96043 3102358 ~ 3152869 (+)
CI01000006_03164803_03183473 PCNX3 coding downstream 157874 3164189 ~ 3183719 (+)
CI01000006_03232003_03242938 NA coding downstream 225688 3232003 ~ 3243362 (+)
CI01000006_03294091_03298089 SLC29A2 coding downstream 287673 3293988 ~ 3298671 (+)
G41570 NA non-coding upstream 250973 2737136 ~ 2744797 (+)
G41494 NA non-coding upstream 285755 2709526 ~ 2710015 (+)
G41488 NA non-coding upstream 294944 2700607 ~ 2700826 (+)
G41433 NA non-coding upstream 351385 2634103 ~ 2644385 (+)
G41482 NA non-coding upstream 362940 2632214 ~ 2632830 (+)
G41538 NA non-coding downstream 15783 3022098 ~ 3032710 (+)
G41605 NA non-coding downstream 191521 3197836 ~ 3198286 (+)
G41606 NA non-coding downstream 192247 3198562 ~ 3198765 (+)
G41614 NA non-coding downstream 242808 3249123 ~ 3250070 (+)
G41543 NA non-coding downstream 251734 3258049 ~ 3263442 (+)
G41591 NA other upstream 156349 2836167 ~ 2839421 (+)
G41424 NA other upstream 335200 2645662 ~ 2660570 (+)
G41170 NA other upstream 1299949 1692065 ~ 1695821 (+)
G40768 NA other upstream 2502744 488407 ~ 493026 (+)
G40767 NA other upstream 2512435 360009 ~ 484185 (+)
CI01000006_03734862_03735227 BANF1, BANF1.S, BANF1.L other downstream 722915 3734554 ~ 3736035 (+)
G41996 NA other downstream 2110891 5117206 ~ 5124149 (+)
G43896 NA other downstream 2763774 5770089 ~ 5771775 (+)
CI01000006_06104927_06109730 NA other downstream 3102169 6104927 ~ 6109820 (+)
CI01000006_06122278_06122736 NA other downstream 3115720 6122035 ~ 6122751 (+)

Expression


Co-expression Network