LOC103030036 (LOC103030036,LOC108437507,LOC107681832,LOC107709017)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103030036
gene name LOC103030036,LOC108437507,LOC107681832,LOC107709017
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035912.1
NCBI id CM008315.1
chromosome length 41032606
location 3571143 ~ 3581126 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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>XM_007250673.2
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Function

NR:

description
phospholipid scramblase 2 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007250671.2 True 2670 mRNA 0.44 9 3571143 3581126
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XM_015606179.2 False 2667 mRNA 0.44 9 3571143 3581126

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
fubp1 fubp1 coding upstream 2465 3554929 ~ 3568678 (+)
miga1 miga1,LOC107558173 coding upstream 18588 3536417 ~ 3552555 (+)
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st6galnac3 st6galnac3,LOC107599847,LOC107681790,LOC107558185 coding upstream 281450 3210560 ~ 3289693 (+)
LOC103030773 LOC103030773,LOC108437505,LOC108267627,LOC107558181 coding downstream 4023 3585149 ~ 3598602 (+)
LOC103031935 ephb3a,LOC108437521,LOC108267069,LOC107656865,LOC107599837,LOC107681809,LOC107708817,LOC105889460 coding downstream 320028 3901154 ~ 3942480 (+)
LOC103021527 NA coding downstream 414816 3995942 ~ 4002916 (+)
LOC103032574 tbl1xr1b,LOC103032574,LOC108437519,LOC107656866,LOC108267995,LOC107568629,LOC106530177,LOC108238308,LOC100706341 coding downstream 441310 4022436 ~ 4046639 (+)
LOC103033521 b3gnt5 coding downstream 471604 4052730 ~ 4065474 (+)
G138609 NA non-coding upstream 44835 3524631 ~ 3526308 (+)
G138593 NA non-coding upstream 64198 3504576 ~ 3506945 (+)
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G138534 NA non-coding upstream 274761 3256901 ~ 3296382 (+)
G138524 gipc2,LOC108430720 non-coding upstream 395779 3156756 ~ 3175364 (+)
G138642 NA non-coding downstream 2892 3584018 ~ 3584290 (+)
G138647 NA non-coding downstream 20729 3601855 ~ 3602193 (+)
G138658 NA non-coding downstream 30067 3611193 ~ 3611402 (+)
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G138663 NA non-coding downstream 88236 3669362 ~ 3669576 (+)
LOC103026108 selenot,selt1a,LOC107681817,LOC107708642 other upstream 451655 3115420 ~ 3119488 (+)
LOC103024858 NA other upstream 486278 3082056 ~ 3084865 (+)
LOC103045052 cfap57,LOC106594647 other upstream 635014 2900475 ~ 2936129 (+)
G137929 NA other upstream 1546757 2022755 ~ 2024386 (+)
LOC103042893 vps4b,LOC107727524,LOC107681797,LOC107710065 other upstream 1719830 1835477 ~ 1851313 (+)
LOC103047488 pls1,LOC108437523,LOC107722705,LOC107656864,LOC107565818,LOC107599860,LOC107709028,LOC107681752 other downstream 220727 3801853 ~ 3839372 (+)
G138701 NA other downstream 252129 3833255 ~ 3834460 (+)
LOC111194271 NA other downstream 514871 4095997 ~ 4102241 (+)
LOC103023077 NA other downstream 584817 4165943 ~ 4172010 (+)
G138839 NA other downstream 656483 4237609 ~ 4245864 (+)

Expression


Co-expression Network