LOC103047078


Basic Information

Item Value
gene id LOC103047078
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035912.1
NCBI id CM008315.1
chromosome length 41032606
location 1084808 ~ 1089511 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_015604027.2
tttttaagGTTTGTCGTCGCTCGACCTTCAGATCAACATGAGTACGGTTACATCCCGACTGTCCAGACAGCAGGAGAAGCAGCTCTGCTTCTTACTGAACTGCTCCAGACTCAGCCTGCTGTTCAAGGCCAGTGTTCACGGCTACACCGCGGACGCCTTCCACAGGCGCTGCGATCGGCAGGGGCCGACCGTTACAGTAGCCTACAACAACTCTTGGTTTATCTTTGGAGCGTACACCAGCAAAGACTACGCCCAGACAGGCCAGAATATCGCAGATGACAAAGCCTTCGTGTTCAGCTTCAACGAGCGAGAGATGAAGAAAAAACCTCTGCGTGTGGTCAGCACAGAAGCCCAGCGTTCCTTCATTGATGCAAATACTGGTCCAAATTTTGTATCCCTGCTGTTTTTATATAACAATACAGCCACAGTTTACAGCAATCCAGGAACCTACAACTTCAATCCAATGGAGATACACGGCAATAACCTGCAGCTGACGGAGTTTGAGGTCTACAGAGTGGAAGGTGCTGAAGCCCTCATGGAGAAGCCTTGGAGAAACATCCAGTGGGATATTGAGAAGAAAAAAGGTCTGATGGACATGATCACAGAATGGAAGCACGGCGTAAGCTCTGTGAAGAAAGCTCGTATTCTGCTGGTTGGACCTGTTGGCGCTGGGAAGTCCAGCTTCTACAACTCCATCAACTCTGTCTTCAAGGGATACGTGTACAACCAAGCCAACATGGGCTATGCAGGCACCAGTCTGACCACACAGttCCGTGCCTACTCCATTAAGACCGGTGGTGGGAAGGTTTTGCCCTTTACTCTATGTGATACTATGGGATTGGAAGAGGGTATAAACGCTGGACTGGATATCGATGACTTCGTGAGCATTCTGAAAGGCCACATTCAGAACAAGTATCAGTTTAACCCAGCGATGCCTCTACAAACACAATCTCCTTCCTTCTGCAAAGAGCCCGAGCTGAAGGACAAGATCCACACCGTGGTGTACGTGATCGACACCTGCAACGTCAAGCTCCTCTCGGAAAAGGTTTTGGAGAAGTTGGCTGCATTTCGTCGGAAAACCAACCAACTGGGTATCCCACAGATTTTTCTAATGACCAAGGTGGATGAGGCTTGCCCTTCTGTGGCATCCGACCTGAAGAATCTCTATCAAAGCAATTACATCCACAAAATGaTGCAGGAGGTGAGTGCAAACCTGGGAGTCCCTCTCTCTAATTTGATTCCAGTGAAGAACTACAGCCAAGACGTGGATCTGGATCCTCAAACGGACATCCTGCTCCTTAACGCATTCGTTCAGATACTCAGAACCACTGAGGGTTTTTTTGAGGATTTTTCTCTGGAGGAGGAATAGAAGCCAGGCTGCAGATTATCTAGAGCTAGTGGTGATGAATGGTAATGATCAATAAAAAGCCTGAAGACCTGTTTACGTAAAATACAGGGTGGTGGTGCATTGTGCTTccaattcaaatttaaatcgGTCCAATTTTAACTTACCTTCATCTGCAGGACATGAGGGGTAACTCAATCAGATCTCAGTCCAGTTAAAAAGCTATGGAAATATCAACAATTTCCAACTTTACAATTAGAGAAAACCACTTACAGtggtatttttttgcatgtttgtccaACTAAAATCACCCCAAAAGCTCAtggacgactcatccaagaggtcacgaAAGACCCCAAAACAACATCCAAAAGACCTTCAGGCTTCACTTGCCTTAGGTCAGCATTCATGACTCCAATATAAGAGAAAGACTGTctttgtatattatttaaatttgtttgatgatccgAAACATTTACGAGtggcaaacatgcaaaaaaataagaaatcatgaaggggcaaCACTTATTTACACCACTTTAATTGACATGTTACCAGCCCTAGTCTGTGGTGTCTAGGGTGAAGCTATTTAAGTTAGGTGCTCTAAACTTAAATAGTGCTGGACAGTGTAGCCAAAATCTATATACTGATAATTATCATGATAAATATCAGTATTGTCCAGCCCTACCTACCAATAAACTACATCCATGGATGCTCTGATAAAAAAGAGCAGTGCTTCATCTATGCAGTGGAATTCTAAAAAATCTGTCATATCAATTTCAATAACTTTTTATGATGCTTTTGATGCTTTCTTCTTCATATgggttttcttttcatttgtcTCTATATTCCTCTGGTGTAAAGGGGTTTGAGGGTTTAAAGTACATATTTAGGTTAAGTTAGGAGTtaggggttaaggttaagtttaTGGTTTGGTTAAGAATTAGCTTAGAGCTGTTTATCATAATGCTAAgggttatgttttattttgaggTTCTATTATATTTAGGGTTATTTTAGGGTTTGTCTAGATTCTCTTTTGTAAGTATGATTGGATTGTCTGACTGTAAGTCCAAGATTCAAGTCCATAAAGTGTCTGAAAAAGGGTCTTGAGTTTTTagcgaattaaaaaaaaaaagattatgaaCTTTTAAGTGCACTtgcttcttttgttttatttaattccaAATTAAATACATGCATTTAATATGGGTGTGGTCTCATGCCACAAGGTCTTGCAAGattaaatctgtgtttaaaaaatgtgttttgtgagACTTATACAGGTATATTATACAGgcaaccaaaacaaatgttccttctattaaaacttttttctctttaatgatacaacttttacttttacaactTTTAAACTCAActttaattgattaaattaattaataaaattaattgacACTATCTTATTACTTTTGCTAcatctttctttcactttttcatttttgttatatttttcctTATACACATcactgttacatttttttttttaagatttaaagatTTTCCAGGTCCAGCTAAAATATCCAACACAAAGAAAGCTGAAATCGAATCCAGAAAATGGCAATTCTGGCCAGTTTtggaattaaaaatacattctgGGCACAGTGTACGAGATATCACACGGCACAGCATTACAAGATTCAtgataaaatgctttttattagATTAAGGAAGTGGTAAACTTACAGCTATTCTCGTTTTCATTGTCGATGCTACGAGGACTGACAGTATGGAGGTGTGGCAGTGTGATCACATCCCGTCCCATTTatcataaagataaaaaaaaaacagtatatcaGTATTTTTTACACATCGCCAAAGTTTACAGAGGTAAAAAGCAGGATTTAATAAGTCTCTAgtgttacacaaacacacactatagaTACATTCATTTCCATCAATCAAACCGACAGGTAGTGCATTTCTACAGAAGGGTTAGATAAAATCAAATCATTTCATCACTAAAACTCTTTCTACCAGTGTTATCATAACAATATCACACCTCTGTGCAACATTAAAGGGGAAGTCCAATAATATTTAACATCTTTACATCATAGAGAAACTTCCCAAGAGAGAACTGTTTAGAATGGTGGTGAATTGCAGTGAAAGGAGTCTGAACTTCTaaaattatatcatttttttataatatttgggtgaaaaacttgttt
>XM_022677757.1
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Function

GO:

id name namespace
GO:0008237 metallopeptidase activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_015604027.2 False 3534 mRNA 0.39 7 1084808 1089511
XM_022677757.1 True 3537 mRNA 0.39 7 1084808 1089511

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103047582 apol1,LOC107103896 coding upstream 2487 1070007 ~ 1082321 (+)
plk3 plk3,LOC107722069,LOC107563563,LOC107658359,LOC107726922 coding upstream 27283 1046267 ~ 1057525 (+)
cacybp NA coding upstream 40091 1040890 ~ 1044717 (+)
kiaa0040 kiaa0040 coding upstream 97102 986421 ~ 987706 (+)
tnr tnr,LOC107658355 coding upstream 115474 814838 ~ 969334 (+)
htr5a htr5a,htr5ab,LOC103024346,LOC108412811,LOC107684958,LOC107659435,LOC107591053,LOC107742155,LOC107598724 coding downstream 38566 1128077 ~ 1166419 (+)
insig1 LOC108412812 coding downstream 127999 1217510 ~ 1223829 (+)
LOC103046777 NA coding downstream 151724 1241235 ~ 1245769 (+)
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LOC103021626 NA non-coding upstream 98654 980933 ~ 986154 (+)
G137737 NA non-coding upstream 334398 749841 ~ 750410 (+)
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G137850 NA non-coding downstream 350752 1440263 ~ 1440805 (+)
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G137857 NA non-coding downstream 420142 1509653 ~ 1512939 (+)
mrps14 mrps14 other upstream 44838 1037861 ~ 1039970 (+)
G137756 kiaa0040 other upstream 96170 980980 ~ 988638 (+)
rfwd2 rfwd2,LOC107658354 other upstream 303612 762715 ~ 781196 (+)
G137614 NA other upstream 990235 93285 ~ 94573 (+)
G137826 LOC108430781,LOC108267757 other downstream 402305 1491816 ~ 1499956 (+)
LOC103042893 vps4b,LOC107727524,LOC107681797,LOC107710065 other downstream 745966 1835477 ~ 1851313 (+)
G137929 NA other downstream 933244 2022755 ~ 2024386 (+)
LOC103045052 cfap57,LOC106594647 other downstream 1810964 2900475 ~ 2936129 (+)
LOC103024858 NA other downstream 1992545 3082056 ~ 3084865 (+)

Expression


Co-expression Network