eps15l1 (eps15l1)



Basic Information


Item Value
gene id eps15l1
gene name eps15l1
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035901.1
NCBI id CM008304.1
chromosome length 40584741
location 14070423 ~ 14134546 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU57157
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Function


symbol description
eps15l1 Enables cadherin binding activity. Predicted to be involved in endocytosis and endosomal transport. Located in membrane.

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU57161 False 2209 lncRNA 0.37 2 14125694 14134546
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
zbtb37 zbtb37,LOC107592717,LOC107669813,LOC107715094,LOC107588062,LOC107757485 coding upstream 71998 13989840 ~ 13998425 (+)
s1pr1 s1pr1,LOC107715096,LOC107592715,LOC107669844 coding upstream 85942 13981191 ~ 13984481 (+)
slc30a7 slc30a7,LOC107588064 coding upstream 179291 13861717 ~ 13891132 (+)
gpr88 gpr88 coding upstream 265317 13801468 ~ 13805106 (+)
cdc14a cdc14a coding upstream 276704 13710046 ~ 13793719 (+)
mrpl54 mrpl54,LOC102788358 coding downstream 172177 14306723 ~ 14309631 (+)
LOC103040508 LOC108414270 coding downstream 177952 14312498 ~ 14333039 (+)
LOC103042131 LOC108424984 coding downstream 199549 14334095 ~ 14345180 (+)
LOC103041829 NA coding downstream 224663 14359209 ~ 14412035 (+)
bsg NA coding downstream 328104 14462650 ~ 14480454 (+)
G42386 NA non-coding upstream 45027 14021643 ~ 14025396 (+)
G42389 NA non-coding upstream 67726 13998920 ~ 14002697 (+)
G42220 LOC108429511,LOC100711005,LOC101481666,LOC102215641,LOC107731533,LOC103137085,LOC107715111 non-coding upstream 534397 13530352 ~ 13536026 (+)
G42209 NA non-coding upstream 594587 13472627 ~ 13475836 (+)
G42195 NA non-coding upstream 698618 13369304 ~ 13371805 (+)
G42469 NA non-coding downstream 25859 14160405 ~ 14160711 (+)
G42496 fam32a,LOC107757479 non-coding downstream 168872 14303418 ~ 14306941 (+)
G42527 NA non-coding downstream 242932 14377478 ~ 14378030 (+)
G42521 NA non-coding downstream 277743 14412289 ~ 14413746 (+)
LOC111192557 NA non-coding downstream 403775 14538321 ~ 14560369 (+)
LOC103037142 LOC108429501 other upstream 213062 13810833 ~ 13857361 (+)
LOC103034435 NA other upstream 448381 13617083 ~ 13622042 (+)
LOC103032215 NA other upstream 548166 13509020 ~ 13522257 (+)
G42208 ier5 other upstream 619946 13448592 ~ 13450477 (+)
G42096 LOC108429524,LOC108271269,LOC103369106,LOC106613566,LOC106574586 other upstream 1355395 12705559 ~ 12715028 (+)
G42605 NA other downstream 760516 14895062 ~ 14899248 (+)
LOC103036127 cunh19orf24 other downstream 1843940 15978486 ~ 15984632 (+)
LOC103040819 reep6,LOC107698004,LOC107745351,LOC107658751 other downstream 2306385 16440931 ~ 16446287 (+)
LOC103044285 NA other downstream 2682055 16816601 ~ 16819251 (+)
LOC111192574 NA other downstream 2813834 16948380 ~ 16950360 (+)

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