prkacb (prkacb,LOC108411205,LOC108267323,LOC103034112,LOC107745335,LOC107669012)


Basic Information

Item Value
gene id prkacb
gene name prkacb,LOC108411205,LOC108267323,LOC103034112,LOC107745335,LOC107669012
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035901.1
NCBI id CM008304.1
chromosome length 40584741
location 18123746 ~ 18143539 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU58785
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Function

symbol description
prkacb Enables several functions, including ATP binding activity; cAMP-dependent protein kinase activity; and magnesium ion binding activity. Involved in protein phosphorylation. Located in centrosome.

NR:

description
cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta isoform X2

GO:

id name namespace
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GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity molecular_function

KEGG:

id description
K04345 PKA; protein kinase A

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103045882 NA coding downstream 95715 18239254 ~ 18246244 (+)
G43483 NA non-coding upstream 367589 17755308 ~ 17756157 (+)
G43414 NA non-coding upstream 636935 17483676 ~ 17486811 (+)
LOC111192514 NA non-coding upstream 645702 17451040 ~ 17478044 (+)
G43382 NA non-coding upstream 848381 17272299 ~ 17275365 (+)
G43363 pex11g non-coding upstream 920906 17200297 ~ 17202840 (+)
G43561 uric,LOC103030682,LOC108430123,LOC100136464,LOC105895190,LOC103392251,LOC102300275,LOC102208991 non-coding downstream 9321 18152860 ~ 18157853 (+)
G43564 NA non-coding downstream 23344 18166883 ~ 18167890 (+)
G43567 NA non-coding downstream 39651 18183190 ~ 18183786 (+)
G43574 ssx2ip non-coding downstream 105915 18249454 ~ 18251731 (+)
G43638 clcc1 non-coding downstream 169234 18312773 ~ 18313342 (+)
G43537 NA other upstream 109247 18012173 ~ 18014499 (+)
adgrl2 adgrl2 other upstream 354792 17633096 ~ 17768954 (+)
G43360 apba3,si:ch73-40i7.5,LOC108271288,LOC105910839,LOC107750992 other upstream 927630 17193538 ~ 17196116 (+)
dda1 dda1,LOC105913185,LOC107685208,LOC105012003 other upstream 1105890 17012467 ~ 17017856 (+)
LOC111192574 NA other upstream 1173386 16948380 ~ 16950360 (+)
samd13 samd13,LOC107592550 other downstream 1660 18145199 ~ 18152349 (+)
G43568 LOC108270632,LOC108261872 other downstream 43500 18187039 ~ 18240232 (+)
p3h2 p3h2,LOC107560692,LOC107564922,LOC107664742 other downstream 1579063 19722602 ~ 19790148 (+)
G43923 NA other downstream 1665203 19808742 ~ 19864143 (+)
LOC103046190 LOC103046190,LOC108438766 other downstream 1729759 19873298 ~ 19904344 (+)

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