G46524


Basic Information

Item Value
gene id G46524
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000006
NCBI id null
chromosome length 13024002
location 9595654 ~ 9602520 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU52901
AATAAATGACATTATTTTTATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTAATGTGGGTTTTTGGAGAGTTAACATCATGGTGACAAGTGGTGTATGCGGCTTGGTTTGAAAGTTTCATATTGCTGTAATCATTCAGCAAGTGCTATACCATGCTATTGTTAACATCTTAGCAAATTAGCAAGTTAGCATTTTCTGAATTAGCTTGTTATAGCTAGCTAAGTTTATGCTAATAAAAATGTTTACGTTGAGATTACATGATTATTTTAAGTTGAATGTATGTATTAGTGTACTTAAATATTTCAAGTTAAACAATTAAAATGTATGAGTACAAAATAAAAATCTGCCAGTTCTGCTTACTTAAACTTTGAATTTCATGTAACTGATTTCCTTAGATTTTTTGAGTTTTGCCAACTTATTCAGGTTTACAGTGTTGCACATTCAAAGAAAATAGCTTACTTCCGTATTGCAAAATAAAGTGGATACTACCGAACAAATATGTTCTAATTGGCCATTTTTGCATCATTTGGGACAGCTGTTTCTCATTCAGTTTGGACAGACAAATGGAAAACGTGGTAACACTTTTTAGATTTCATGCATATTTTATTTGTTAATTAATGTTCAGCTGTTCTTTTAATAGTCAACTTATTTTCAGATCATCAGCCATCAAAGCTCGGTAAACACTGCAAGTGTCATGATGGTCACAGACATGGAGATGTAGCTTTAATTTCACCTAACTGAAAATCCTCAAAGATCATGTCATTTCAAATTTGAATGAGATGACACACAAGACAGTGGGTGATAGCAAGTTGGTGAGTTATTTACTTACTTTTTAATGAGTCTTCTTATTAACACAATTATGTAATCATATAAACCATTTTGCGGATGTGGAATGTGCACAAAAAAATGAGAGGCATGATTTATCACATGTTCACTGCAATAGTCAATCATAGCATGATCTCTCACCTGACATTTCGTCATTCATTCTCATTCTCAGTCTCATTCCCAAGCATTCTATCTGACACCCAAAGGAAATTAAATGCTGAGACTCAACTGGCTCACAAGGCTTGATTCATATATAATTTTTTCTGCTTTCATTTTACCAAATCTATGAATATTCATTCAAATTCATGATCATTAAAATTCTGCATGTACGTATGCTCTCTTGACATCTTAAATGGTGTTGGTTGAAAAATTGATCAATTATGTTTTCCATCACAGACCCGAAGTGTCTGAACAGAAGAAAAAGAAAATGGAAAAAAGGGTGTTTATTTTTTTATTTCACTTTTATTTTAAATTCACTTTTATGGACAAATATTAGACAGCCATGGCAGCAGAGCTCCATACAGTAGATGCAGCATTTAACTTCTAAAGTACAGTGTAGAATTTACGCCTCATGAAACAGAATTGTAAAAATAATATTTCTGGTTTTCCTTCCATTTTTGGAATATTGGCAGCTCCATAGGGCCACAGTGTTTACAGTTTTTGGGACAGTCAGCCTACGAATGGCTTACTTGCAGCTGTCTCTGCACAGTAGGCCATAAAAAGTATTTTAACATTGAAAAAGTGACACACACATCACCTTAAAACATTCCCTGATTCATGAAAATCTGCTTCTGTCTTTGGGTCTTTTTTAGGCTTTTCTTAACATGAAAACTCTGCATTTTTTTGTTACATACTGTACATAACTCCACAGCTAAATTTTAGGCTGATGCTCAGCAACTTTACTCTGTACTTTATGTCTAGCTCAGATGTAACTGAAATTCCCTGTCTGCACAGTTTTTACTCAGCCAATCACTGTCTGCTGGAGGCATTTCAGCTTATAATGACAAGAAGCAAAGGAATCGAAAACAATTATTGAAAGAAGAACAGCAACAAGGGCTGCTGCCGGCGAGGACGCTATAACTGATGCCGCTATATGGCATCATCTGTCCCGTAACTGAGCTATCTAACTGCATTAGAGAAAGTGCAGATTACCACAATCAGGGTTGTGATAATAGCAGAATGGCCATGATGTTTATACTGTATGATGATTGTAATCGGGGTGCATGATGATGCGGTTTACCAAGGAATTGGACATAAATTTTATGCAATCAAACCACATCAAAGCAACAATTGCAAGAGATAAATACCCTCCCTCTGTGTGTCAGTGTTGCTCAGTGTGTGCCTCTAACATTGCAGCCTGTTCCTGCCATCTCAGATTGGATGTCATTATTGGATTGAATGAAGGGGTTTTCAAGGGGACATATATTACCATCTTTACCAATGCACCTAAATAACCTACACTTATCATTTACAATATAATGTAAATGGTAAGTGTAGCTTGTTAGGTGCGTTAGTAAAGATGGTAATTTAAGATTGGATTACTTTGGTGGAATGCAAATTCCTTATTATGGATTTTATATGTGGGTGAGGAGACTTGATTAATTGTGGTATTTTTTCCATGTTGTTTTTTTATAATTAATTGCACTAAATTAATGTGTTTAATTTACATCCCTAATTAGAAAAATGCAAAATAAGAACATTTTCAGTAGTGTTCTCAGACTAGACCCCACTGTATTTTCAAAAGAAGCAGTACCCATTGCTCTGTGACACATTTATACCTTAAACTCACAATTTTCCTCACTTGCTCTTTTTCACACCTTCTTAAACATTCTTCCCTCTAACTCACTTTTTCTTTTGTACACATACATCCCCCACTCATGGATTTGGTTCTTTTTTGATGACACATTGGAGTTTCTTGTTTCTTTTCTTTGATTAATCACAGTTCTGCCTTTTTTCTCTCTGTCTGTTTGTTTGGCGTATATCTACAATTTGCTTTGTCATTCTGTCATTTATCCACAGTTTTCTTGGTTTGTCATTTCAGTGCATAGGATGCTAAGGATCTGTATGGCTCCTTAACTCACTGGTTGAGGACATTTTCGACAAACATGCAGATTTTTTTATTTTTTTTTACTCTCAGCCCTCCTCTGTCCTGTCTAAAAAATATTTTGTGTAACTGTCCCTTTAGCACAGACCTGCTCTGAGTCAAAGAGAAAGTGATAAATCATTTGTGAAGTAATGTTTGCGTGTTATAGGCTATTCTCTGAGGACACCATCAGGCAGAAAACATGGAGCAACATATGTGCGCCTGAGTCTTCACCAGCAGTGAGCATGTCCTTAAGTCCTTTGCTGAGTAAAGCATTAATGCATTTATTTATTTATTCATGCATTTATTCATTTACACACTCTGTTAGTCTATACGCATTTACTTTGACCATTGCAAATGAGAATAGTTTACAGAAAAGTGGAAATAAATATTCAGTTTCTGTATTCTATCCTGTTCTACCCTTTCCTATTCTATGATTTATTTTTATACATCAGTTGTTACTTCACGCCATGTTTGAATTACTGTAATTATGCATTTCTGACTTGTAAAAAGCGTTCACAAACTTGTAAAGTTCCGACTTGTACCACCTGTCGAAACACTTGTCTACAGCTTCAGTAAAATGTAGTTCATTTAATATTTCTGTTTAACAATTCCTGAAATTCTTGGAATTGTTAATATCTGAGATTAATCTGAAAATAACCCAAACAAACCAATGTATCTAGCATAGATATATAACATGTCTAATGTCCTGATAAATAAGATAAATAAACTTTTAAGTTTATAAATTTGCAAAATGACCGTTCTAATGTGGTTATGGCAGTTGGTTGCTCAAATTACAGAGATTCATTTTGCCGTTAATAGTCTTGCCAAAGAAATGCGTAATTTGAGTCAGAGAGCTCTGAGAATGTCCGGTTTTTCATCTGTTAATTATTGTAATTATGTGATGCCTTGAACACATGTTTAGTTCCAGTCCTTGAATTTGATTGGCTGAGGATGTTGATCACTCTGCTTGACTGTGTTCAGACAAGAGTATGTGAGCGGTACAGAGTGGAAATTAAAGTCACAATGAAATCAAAATGGACAATTCCTATTTTTTTATGGAATATTGCAGTATATTAGGATTTATATATTTATTTATTATTTTTTTTAACTCATGTGTCCTTGTAATCTTTTATCAAAATAAGGGTGGGAAAACCTGTCACTCAAATGAGATCACAACAATAGTCTTGCATAGCCAGGCCTTCAGACTGACGGCAAAGGTCTGGACTCAATAGTAGCTTTCATTGGACCATCCAAGGACCATCCAGAGGCCGTCTGACTGGCATGTAGAGCAACCAATCACGGTTTGTTTTGTTCCGCGTCATGTTTAGGGGTGTGAAAATTGAACGTCTATGTCCCTATAATAACAGACCGGTGTGTAAAACTCTTGGACGTATTTTAAAGAGTCTATTCTGTGAACTTTGCATACTTTTGAAATTCCAGCATTTAGTTGATCCTGATAAGCGCTCATTGTCACAGTTGTAAACATGACGGCATTATTCTTCCATGAGGGGGTTTGGTGTCACAGCATCTTTGTTTCCAGGTGGTCCAAACTGTTTAGGTTATGAAAATTTATTAAAGGTGGACTCAGTAGAATTTCAAAAACACTGTTTGGAAGTTAGTCGGCCGACACCAACAACAAACGTCTAACCAATCAGCATTAGGTCGTATGATGGTCGAGGAGACAGAACAAGCAAGAGGAAGATTTGAAAATAAGAAAAAAAACTGCAGAACGAGAGATGGGACACAATACAAAAGCTCAAAAGAATATCACTGGAATGAAGGTTTATGACTGGGCAAGCGCTTTAGGACCCACATTTATATTAGAAAAGCTTTCCAGCACTGGAGAGAGCTAAGTGGGAAGGCCTGAAAACAGATGTGGAGGCTGCTTTGATTCCTTCTCATGTAAGTAACACTGGGTTTTGATTGTCTGGAGCTGCTGTGCTGTTGGCGACTAACAACGAACACTTGTTTGTATTTACTTTTGTGTACTGTACATTCATTTTTTGTGCTTCCTTGTCGTTCGTTCATCAACTGCGCTTTATTTTTCGTGAAGCATTTTGTTGCGTGTCAGCTGTGATAAACAGACATCCACTCTCGCA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU52901 True 6834 lncRNA 0.35 2 9595654 9602520

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000006_09569228_09574340 NA coding upstream 20593 9568280 ~ 9575061 (+)
CI01000006_09497508_09511925 NA coding upstream 82934 9496806 ~ 9512720 (+)
CI01000006_09334843_09337295 FAM216A coding upstream 258251 9334801 ~ 9337403 (+)
CI01000006_09320331_09321778 UB2G1, UBE2G1A, UBE2G1, UBE2G1B coding upstream 273876 9320331 ~ 9321778 (+)
CI01000006_09192219_09195918 NA coding upstream 399670 9191897 ~ 9195984 (+)
CI01000006_09712289_09783579 UNC5DA coding downstream 109769 9712289 ~ 9783579 (+)
CI01000006_09836923_09844045 NA coding downstream 234403 9836923 ~ 9846207 (+)
CI01000006_09884959_09889794 NA coding downstream 281919 9884439 ~ 9890289 (+)
CI01000006_09891107_09897750 NA coding downstream 288587 9891107 ~ 9897763 (+)
CI01000006_09910027_09913958 NA coding downstream 306850 9909370 ~ 9914104 (+)
G46525 NA non-coding upstream 7855 9575315 ~ 9587799 (+)
G46530 NA non-coding upstream 49581 9545862 ~ 9546073 (+)
G46519 NA non-coding upstream 58169 9536933 ~ 9537485 (+)
G46507 NA non-coding upstream 84985 9510424 ~ 9510669 (+)
G46483 NA non-coding upstream 110838 9470382 ~ 9484816 (+)
G46541 NA non-coding downstream 51786 9654306 ~ 9655184 (+)
G46526 NA non-coding downstream 216841 9819361 ~ 9829574 (+)
G46565 NA non-coding downstream 248615 9851135 ~ 9851458 (+)
G46566 NA non-coding downstream 249109 9851629 ~ 9851834 (+)
G45416 NA other upstream 760957 8818814 ~ 8834697 (+)
G45355 NA other upstream 1383266 8209555 ~ 8212388 (+)
CI01000006_08198328_08199463 NA other upstream 1395509 8197881 ~ 8200145 (+)
G45336 NA other upstream 1573703 8019342 ~ 8021951 (+)
G45265 NA other upstream 1675299 7883867 ~ 7920355 (+)
G46652 NA other downstream 554059 10156579 ~ 10159251 (+)
G47145 NA other downstream 882838 10485358 ~ 10511806 (+)
G47159 NA other downstream 1813709 11416229 ~ 11521703 (+)
G47318 NA other downstream 2021747 11624267 ~ 11638252 (+)
G48094 NA other downstream 2675100 12277620 ~ 12279541 (+)

Expression


Co-expression Network