slc25a21 (slc25a21,LOC107679800)


Basic Information

Item Value
gene id slc25a21
gene name slc25a21,LOC107679800
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035905.1
NCBI id CM008308.1
chromosome length 42966623
location 20777438 ~ 20888798 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
slc25a21 Predicted to act upstream of or within transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in mitochondrial DNA depletion syndrome. Orthologous to human SLC25A21 (solute carrier family 25 member 21).

NR:

description
mitochondrial 2-oxodicarboxylate carrier isoform X3

GO:

id name namespace
GO:0055085 transmembrane transport biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG:

id description
K15110 SLC25A21, ODC; solute carrier family 25 (mitochondrial 2-oxodicarboxylate transporter), member 21

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103044638 LOC108425659,LOC108270359,LOC107679799,LOC107752725,LOC107666266 coding upstream 5793 20714423 ~ 20771645 (+)
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G81919 crip1,LOC103034058,LOC106611282,LOC107600860 non-coding upstream 504715 20261599 ~ 20272723 (+)
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LOC103035760 rtkn2,rtkn2a other upstream 2307803 18460123 ~ 18469635 (+)
ralgapa2 ralgapa2,LOC107687934 other downstream 632109 21520907 ~ 21673438 (+)
G82488 NA other downstream 1468846 22357644 ~ 22358135 (+)
G82609 baz1a other downstream 2341632 23230430 ~ 23231318 (+)
timm9 timm9,LOC107729247,LOC107693171,LOC107689314 other downstream 2986641 23875439 ~ 23877770 (+)
G82811 psma3,LOC107729246,LOC107725600 other downstream 3020884 23909682 ~ 23973975 (+)

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