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Basic Information


Item Value
gene id LOC103034755
gene name asmt2,LOC108438736,LOC108270049,LOC107654826,LOC105908292,LOC106611414,LOC107721495,LOC107668509
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035905.1
NCBI id CM008308.1
chromosome length 42966623
location 12290397 ~ 12312938 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


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Function


symbol description
asmt2 Predicted to enable acetylserotonin O-methyltransferase activity. Predicted to be involved in melatonin biosynthetic process and methylation. Orthologous to human ASMT (acetylserotonin O-methyltransferase).

NR:

description
PREDICTED: acetylserotonin O-methyltransferase-like

GO:

id name namespace
GO:0030187 melatonin biosynthetic process biological_process
GO:0032259 methylation biological_process
GO:0008171 O-methyltransferase activity molecular_function

KEGG:

id description
K00543 ASMT; acetylserotonin O-methyltransferase

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


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LOC103044397 pgrmc2,LOC108438735,LOC107711856,LOC107721516,LOC107654846,LOC107668512 other upstream 10891 12223277 ~ 12279506 (+)
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LOC103029370 pygb,LOC107553065,LOC107663289,LOC107671137,LOC107717055,LOC107583638 other downstream 2417570 14730508 ~ 14798604 (+)

Expression



Co-expression Network