LOC103042380 (LOC108437745)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103042380
gene name LOC108437745
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035905.1
NCBI id CM008308.1
chromosome length 42966623
location 35667700 ~ 35686642 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_022673219.1
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>XM_022673220.1
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Function

NR:

description
PREDICTED: zinc finger protein 395-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0046872 metal ion binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022673219.1 True 4993 mRNA 0.43 10 35667700 35686642
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103042687 kif13b,LOC107751739,LOC107583481,LOC107755780 coding downstream 109508 35796150 ~ 35873071 (+)
efcab11 efcab11,LOC107755768,LOC107680765,LOC107588272,LOC107693110 coding downstream 373208 36059850 ~ 36139729 (+)
foxn3 foxn3,LOC107751738,LOC107680774,LOC107583483,LOC107755777,LOC107693108 coding downstream 384670 36071312 ~ 36379111 (+)
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dio2 dio2,LOC107751736,LOC107588276,LOC107680786 coding downstream 857448 36544090 ~ 36554039 (+)
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G85936 NA non-coding upstream 55764 35611012 ~ 35611936 (+)
G85932 NA non-coding upstream 61881 35604483 ~ 35605819 (+)
G85878 scaf8,LOC107680102,LOC107728963,LOC107749595 non-coding upstream 72563 35572718 ~ 35595137 (+)
G85882 NA non-coding upstream 88841 35578015 ~ 35578859 (+)
G85978 NA non-coding downstream 39261 35725903 ~ 35726664 (+)
G85986 NA non-coding downstream 190590 35877232 ~ 35877847 (+)
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G85995 NA non-coding downstream 207906 35894548 ~ 35986680 (+)
G86000 NA non-coding downstream 279429 35966071 ~ 35966372 (+)
LOC111193254 NA other upstream 9613 35636810 ~ 35658087 (+)
tfb1m tfb1m,cldn20,LOC101886267,LOC107571061,LOC107675320,LOC107573130,LOC107728965,LOC108443299 other upstream 327868 35288215 ~ 35339832 (+)
G85740 zdhhc14 other upstream 867323 34746814 ~ 34800377 (+)
LOC103037843 pnrc2,LOC108441235 other upstream 3226382 32436217 ~ 32441318 (+)
LOC103035447 vegfa,vegf,LOC106584182 other upstream 3448938 32199183 ~ 32218762 (+)
LOC111193255 NA other downstream 1797379 37484021 ~ 37503882 (+)
bcl11b bcl11b,bcl11ba,LOC108270293,LOC107588284 other downstream 2143113 37829755 ~ 37933289 (+)
G86497 vrk1,LOC106602366 other downstream 2978525 38665167 ~ 38698313 (+)
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LOC111193159 NA other downstream 3513575 39200217 ~ 39251958 (+)

Expression


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