G219631


Basic Information

Item Value
gene id G219631
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035921.1
NCBI id CM008324.1
chromosome length 46505145
location 27211709 ~ 27218211 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU298030
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>TU298031
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU298030 False 4361 lncRNA 0.39 3 27213356 27218211
TU298031 True 6008 lncRNA 0.37 3 27211709 27218211

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cep170 cep170 coding upstream 29792 27094098 ~ 27181917 (+)
LOC103024575 akt3,akt3a,LOC103024575,LOC108422057,LOC107666430,LOC106589689 coding upstream 233935 26827348 ~ 26977774 (+)
adss adss,LOC107585249,LOC107666526,LOC107698758,LOC107733748 coding upstream 491404 26692153 ~ 26720305 (+)
atrn atrn coding upstream 742038 26335600 ~ 26469671 (+)
eif2ak3 eif2ak3,LOC107683275 coding upstream 880009 26285777 ~ 26331700 (+)
abcg8 abcg8,LOC107666472 coding downstream 64389 27282600 ~ 27293085 (+)
ppm1b ppm1b,ppm1ba,LOC107747533,LOC107666482,LOC107733761,LOC107585253 coding downstream 214651 27432862 ~ 27467984 (+)
slc3a1 slc3a1,LOC107585281 coding downstream 255698 27473909 ~ 27492416 (+)
camkmt camkmt,si:ch73-54n14.2,LOC107585255,LOC107733780,LOC107602502,LOC107666367 coding downstream 292003 27510214 ~ 27711719 (+)
six3 six3,six3a,LOC107733790 coding downstream 622633 27840844 ~ 27844241 (+)
G219627 NA non-coding upstream 87 27187988 ~ 27211622 (+)
G219630 dync2li1,LOC107666473 non-coding upstream 13120 27196695 ~ 27198589 (+)
G219618 NA non-coding upstream 119533 27090463 ~ 27092176 (+)
G219617 sdccag8 non-coding upstream 123157 27086005 ~ 27088552 (+)
G219565 NA non-coding upstream 138174 26974011 ~ 27073535 (+)
G219639 NA non-coding downstream 44343 27262554 ~ 27263875 (+)
G219620 NA non-coding downstream 46556 27264767 ~ 27342438 (+)
G219643 NA non-coding downstream 77205 27295416 ~ 27304066 (+)
G219651 NA non-coding downstream 94497 27312708 ~ 27330208 (+)
G219657 NA non-coding downstream 155665 27373876 ~ 27408090 (+)
LOC103047652 NA other upstream 1769128 25438719 ~ 25442581 (+)
G219171 cunh4orf32,c3h4orf32 other upstream 1909122 25256950 ~ 25302587 (+)
dapp1 dapp1,LOC107579178,LOC107556904,LOC107667071,LOC107585227,LOC107733757 other upstream 2037001 25161727 ~ 25174708 (+)
G219050 NA other upstream 2369176 24842302 ~ 24842533 (+)
LOC103046104 LOC108441759 other upstream 2744842 24443291 ~ 24466867 (+)
plekhh2 plekhh2 other downstream 1272635 28490846 ~ 28551769 (+)
G220074 NA other downstream 1501045 28719256 ~ 28720661 (+)
G220194 NA other downstream 1923156 29141367 ~ 29142018 (+)
LOC103047316 NA other downstream 2417850 29636061 ~ 29640401 (+)
G220336 NA other downstream 2569728 29787939 ~ 29793496 (+)

Expression


Co-expression Network