G221419


Basic Information

Item Value
gene id G221419
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035921.1
NCBI id CM008324.1
chromosome length 46505145
location 34830093 ~ 34835860 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU300391
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>TU300392
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Function

GO:

id name namespace
GO:0015085 calcium ion transmembrane transporter activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU300391 True 5768 lncRNA 0.37 1 34830093 34835860
TU300392 False 5344 lncRNA 0.38 1 34830517 34835860

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103035102 LOC103035102,LOC108411051,LOC794838,LOC107705434,LOC107654921,LOC107553207,LOC105890990,LOC107602927 coding downstream 166345 35002205 ~ 35014129 (+)
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G221369 NA non-coding upstream 887542 33942227 ~ 33942551 (+)
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G221351 NA non-coding upstream 997799 33830497 ~ 33832294 (+)
G221354 NA non-coding upstream 999907 33829879 ~ 33830186 (+)
G221422 NA non-coding downstream 1101 34836961 ~ 34837352 (+)
G221438 NA non-coding downstream 59601 34895461 ~ 34898316 (+)
G221420 NA non-coding downstream 68918 34904778 ~ 34905637 (+)
G221441 LOC108411061 non-coding downstream 70913 34906773 ~ 34907405 (+)
G221445 NA non-coding downstream 82711 34918571 ~ 34918853 (+)
G221390 ate1 other upstream 646856 34162581 ~ 34183237 (+)
G221292 NA other upstream 1385372 33444117 ~ 33444721 (+)
bcl2l11 bcl2l11 other upstream 1597302 33213628 ~ 33232791 (+)
LOC103038412 LOC108430255,LOC107679129,LOC107585442,LOC107688640 other upstream 2152808 32613474 ~ 32677285 (+)
LOC103027057 fbxo11a,msh6,LOC108413220,LOC107725019,LOC107588452,LOC107679165,LOC107733352,LOC108430631 other upstream 2251541 32502774 ~ 32578552 (+)
synj2bp synj2bp,LOC108411060 other downstream 151139 34986999 ~ 34997044 (+)
srsf5 srsf5,srsf5a,LOC107553206,LOC107736490,LOC108411053,LOC107602962 other downstream 182582 35018442 ~ 35025598 (+)
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G221728 fbxo9 other downstream 1134129 35969989 ~ 35972354 (+)

Expression


Co-expression Network