unc5b (unc5b,LOC107588651,LOC107707543,LOC107688303)


Basic Information

Item Value
gene id unc5b
gene name unc5b,LOC107588651,LOC107707543,LOC107688303
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035921.1
NCBI id CM008324.1
chromosome length 46505145
location 17480411 ~ 17575186 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007249477.3
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Function

symbol description
unc5b Predicted to enable netrin receptor activity. Acts upstream of or within branching involved in blood vessel morphogenesis and negative regulation of angiogenesis. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Is expressed in several structures, including immature eye; nervous system; neural keel; pectoral fin bud; and trunk vasculature. Orthologous to human UNC5B (unc-5 netrin receptor B).

NR:

description
PREDICTED: netrin receptor UNC5B isoform X1

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KEGG:

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gene id symbol gene type direction distance location
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nsmce4a nsmce4a,LOC108262367,LOC107716332,LOC107688307,LOC107707575,LOC107585317 coding upstream 334523 17140671 ~ 17145888 (+)
LOC103040130 NA coding upstream 350305 17109263 ~ 17130106 (+)
ldb1 ldb1,ldb1a,LOC108442788,LOC108444470,LOC107585322,LOC107673939,LOC107707596 coding upstream 372704 17077039 ~ 17107707 (+)
polr1c polr1c coding upstream 412770 17063896 ~ 17067641 (+)
LOC103043107 LOC108442891,LOC108263542 coding downstream 4012 17579198 ~ 17632034 (+)
parg LOC107683745 coding downstream 58590 17633776 ~ 17672861 (+)
LOC103043721 ogdhl,LOC108442924,LOC107683740,LOC108263326,LOC107707496 coding downstream 101968 17677154 ~ 17700496 (+)
LOC103045248 lrit1a,LOC108442250,LOC107585312,LOC107673966,LOC107716298,LOC107707479,LOC107588643 coding downstream 180782 17755968 ~ 17760796 (+)
LOC103045557 LOC108442258 coding downstream 186140 17761326 ~ 17766791 (+)
G217222 NA non-coding upstream 85162 17395039 ~ 17395249 (+)
G217140 NA non-coding upstream 215980 17264130 ~ 17264431 (+)
G217122 pcgf6 non-coding upstream 419830 17058330 ~ 17060581 (+)
G217109 NA non-coding upstream 470613 17009574 ~ 17009798 (+)
LOC111196035 NA non-coding upstream 582017 16883025 ~ 16898394 (+)
G217313 NA non-coding downstream 201580 17776766 ~ 17777086 (+)
G217359 NA non-coding downstream 524768 18099954 ~ 18161772 (+)
G217362 NA non-coding downstream 542016 18117202 ~ 18124261 (+)
G217368 NA non-coding downstream 577015 18152201 ~ 18154348 (+)
G217369 NA non-coding downstream 579219 18154405 ~ 18158027 (+)
LOC111195981 tacc2 other upstream 296160 17149342 ~ 17184251 (+)
borcs7 borcs7 other upstream 472874 17004541 ~ 17007537 (+)
bcl11a bcl11a,bcl11aa,LOC107666449,LOC107601892,LOC107743494,LOC107655449,LOC107559339 other upstream 2700098 14722400 ~ 14780313 (+)
gsto1 gsto1 other upstream 3133078 14342232 ~ 14347333 (+)
spef1 spef1 other upstream 3730105 13740513 ~ 13750306 (+)
pax2 pax2,pax2a,LOC107668824,LOC101463634,LOC107588637,LOC107716343,LOC107585307 other downstream 429067 18004253 ~ 18039352 (+)
eif4ebp2 eif4ebp2,LOC107564345,LOC107716353,LOC107668794,LOC107673927 other downstream 736707 18311893 ~ 18317228 (+)
LOC103030769 LOC103030769 other downstream 1168020 18743206 ~ 18744327 (+)
cxcl12 cxcl12,cxcl12a,LOC107707253,LOC107673912,LOC106604225,LOC107588617,LOC107548639 other downstream 1262158 18837344 ~ 18847028 (+)
LOC103040131 ptpn20,LOC108443401,LOC102205930,LOC108262844 other downstream 1585467 19160653 ~ 19216989 (+)

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