G70629


Basic Information

Item Value
gene id G70629
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035904.1
NCBI id CM008307.1
chromosome length 27092187
location 2419559 ~ 2434902 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU95277
taataataatacttatattaataataatagtgatatgCTCTAACTTCGTCTGACACATTAAACGAGTCCTGTTGCGACATAAACGATGCTGCTTTGACTCTTAAAGATTAGTAgactgctaatgctaacccAGAGTAATCTACACTAAACCCGAACAGAGAGTCCACTGAAATAACTACAGCCCCAGAGCCACCTTTTACACCATGTTCATCACTTTAATTACTGCTGCCTGCCCTGCTTATCATCACACATGGATgttcatgcatgcacacacaaacacacacacacaaattaaccATACATTCATGAATgcatctgcacacacacacacctgagccCATGTTTGGGAGGCATCTGAGCATAATATTGCATAATGAAACCCTGAGTTACCtcactttataaaaaaagtctgtaataactgtgtagttacacattaacaatccatgtaataacagtgtaactactggtaaaGTGCATATTGAtacagattaattaattaataagttGCACAGGTTAAGTAATTATACATGTTCTATATATCAGTCTAAGTTAGACATAGCAGAATATTGTGTCCATCTTCCCATGATAAAATACCTCACAAGCTGTTGGAGAAAAggacatttacacacatacgcatgtaaaaaaaaatacattcactCTAtttatataccgtattttttggcACTTTAAGGCAAACGTTTATTTTATGgtatattttcatgcataaggcGCACCGAATAATAAgatgcattatgcgacactagtaaggaacaggggtgtcgccatgttttccttctaattcatcaGGTCTCAATCTTTACtcactgaaaactgtttatttgggtaagtaaagagcattcgtttatttatagtaagcttagatttccagatatccactaaggctgggtgcagcagcattagcggctaaatcTTAGCGGCTAATTGCTAgcgctagctgcggttagcgaCTTATGCTGCGCTACACTGATGAACCCTgtgtgttccggtaagccagggtgatattagctagcggtttgtcccacgtagcttgttttaacatggtgaacacacagactacagtccgaaatactcgcctctgaatggcgaaagggCTAGCGCTTtgcacggttagtggctaatgctaatgctgctccagcagggctagctgggattagcagcaggctacattccgattacactcacctctgaatggcaaaagagctagaacTTAACATGcttaatggctaatgctaataatgctggagaactaaactgaaactcctgtataactctgtacttcagctacatgagagtggttttactgctccttaatacctgactggtagaattcatacggaaggcgcaccggattataaaatgcactgatgatttttgagaaaattaaaggattttaagtgcaccttatagtgtgaaaaatatgagaATTGAGAGACACAAACGATTATTTAACCTATACATCTGTAGTAAAGCTGTATCAGTAGGTACTTCACCAGTAATTACAGtgtacatggattgttaatgtaTAACTGCAGAGTTAAGTTTGGCAGAGTTTACTacattactgttttaaaaaaacttaaaaattgtaGATCCTCTTGAAGCTATTTTAAAACCCAGTTCATActcaaatcaaatcagatttattgtcacatcacagaCTACAGGTGTACAGGCGAGTAAACTACAATTAACATAACAATATAAAATAGTGAAGCTTATTAGTAGAATGGATATTAATAATATGCATcattaacattaaaactaaTCACTGCCAAATCATTGTGAAGTTAAATTTaactatttgtttttaaaacaaattgtgTTGTGTTGATTTCGTATGTATAACAAAAAAGTTGACACAGCATAACTAAACAAGATCAGCTCATCTAAAGCTAGAGCACACTAAGAACATCAACTGTCCAAACATCTCCTCCAATGTGACAAATAATCCCTCCATTCACagcctttttaaataaattaataaacaatctGTAGTCCCTTTACACCCTGTACTCATCATACAgcaaatatacacataaatatacacatataggAACTTTTTAGGTAAAACAGACTCTCAGCTACAAAACATAGACCAGCTTTAATCTCTCTCAGGCAGCTATAATGTACAGGTATTTGTGTGATCAACTGTGAATGATGATACAGCTGATGATGAGGAAGGGTCCAAATTCATTTAACAATTCATGTGTTCACTACTGGTTAGTTAAACAGTTCACACCAAGAATTActaaatacagcgcttttagccgatga
>TU95278
taataataatacttatattaataataatagtgatatgCTCTAACTTCGTCTGACACATTAAACGAGTCCTGTTGCGACATAAACGATGCTGCTTTGACTCTTAAAGATTAGTAgactgctaatgctaacccAGAGTAATCTACACTAAACCCGAACAGAGAGTCCACTGAAATAACTACAGCCCCAGAGCCACCTTTTACACCATGTTCATCACTTTAATTACTGCTGCCTGCCCTGCTTATCATCACACATGGATgttcatgcatgcacacacaaacacacacacacaaattaaccATACATTCATGAATgcatctgcacacacacacacctgagccCATGTTTGGGAGGCATCTGAGCATAATATTGCATAATGAAACCCTGAGTTACCtcactttataaaaaaagtctgtaataactgtgtagttacacattaacaatccatgtaataacagtgtaactactggtaaaGTGCATATTGAtacagattaattaattaataagttGCACAGGTTAAGTAATTATACATGTTCTATATATCAGTCTAAGTTAGACATAGCAGAATATTGTGTCCATCTTCCCATGATAAAATACCTCACAAGCTGTTGGAGAAAAggacatttacacacatacgcatgtaaaaaaaaatacattcactCTAtttatataccgtattttttggcACTTTAAGGCAAACGTTTATTTTATGgtatattttcatgcataaggcGCACCGAATAATAAgatgcattatgcgacactagtaaggaacaggggtgtcgccatgttttccttctaattcatcaGGTCTCAATCTTTACtcactgaaaactgtttatttgggtaagtaaagagcattcgtttatttatagtaagcttagatttccagatatccactaaggctgggtgcagcagcattagcggctaaatcTTAGCGGCTAATTGCTAgcgctagctgcggttagcgaCTTATGCTGCGCTACACTGATGAACCCTgtgtgttccggtaagccagggtgatattagctagcggtttgtcccacgtagcttgttttaacatggtgaacacacagactacagtccgaaatactcgcctctgaatggcgaaagggCTAGCGCTTtgcacggttagtggctaatgctaatgctgctccagcagggctagctgggattagcagcaggctacattccgattacactcacctctgaatggcaaaagagctagaacTTAACATGcttaatggctaatgctaataatgctggagaactaaactgaaactcctgtataactctgtacttcagctacatgagagtggttttactgctccttaatacctgactggtagaattcatacggaaggcgcaccggattataaaatgcactgatgatttttgagaaaattaaaggattttaagtgcaccttatagtgtgaaaaatatgagaATTGAGAGACACAAACGATTATTTAACCTATACATCTGTAGTAAAGCTGTATCAGTAGGTACTTCACCAGTAATTACAGtgtacatggattgttaatgtaTAACTGCAGAGTTAAGTTTGGCAGAGTTTACTacattactgttttaaaaaaacttaaaaattgtaGATCCTCTTGAAGCTATTTTAAAACCCAGTTCATActcaaatcaaatcagatttattgtcacatcacagaCTACAGGTGTACAGGCGAGTAAACTACAATTAACATAACAATATGCataataacttacactatatACATGTTATTGCACTGTGGATGTGAGTTAACTATAACtgaatatgttaatattacagtgctatatatatatatatatatatatatatatatatatat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU95277 True 2295 lncRNA 0.36 2 2432450 2434902
TU95278 False 1841 lncRNA 0.37 2 2419559 2434902

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103026956 ctnna1 coding downstream 199195 1998156 ~ 2220364 (-)
LOC103041113 ppt2 coding downstream 1413682 988446 ~ 1005877 (-)
rps5 rps5 coding downstream 1436956 975095 ~ 982603 (-)
LOC111193040 NA coding downstream 1481375 932017 ~ 938184 (-)
LOC103044579 NA coding downstream 2223276 178319 ~ 196283 (-)
LOC103026657 tspan17,LOC108436843,LOC107749748,LOC107680656 coding upstream 778 2435680 ~ 2488996 (-)
LOC103022920 NA coding upstream 66086 2500988 ~ 2535981 (-)
dctn4 dctn4,LOC107749746 coding upstream 226609 2661511 ~ 2678905 (-)
anxa6 anxa6,LOC107750364,LOC107594885 coding upstream 329243 2764145 ~ 2816535 (-)
rmnd5b rmnd5b,LOC105026275,LOC100306854,LOC106612137 coding upstream 523747 2958649 ~ 2982646 (-)
G70628 NA non-coding downstream 15694 2403411 ~ 2403865 (-)
G70624 NA non-coding downstream 35392 2381317 ~ 2384167 (-)
G70605 LOC108436838 non-coding downstream 60330 2358811 ~ 2359229 (-)
G70597 NA non-coding downstream 72707 2311285 ~ 2346852 (-)
G70662 NA non-coding upstream 134985 2569887 ~ 2616400 (-)
G70666 NA non-coding upstream 203660 2638562 ~ 2703705 (-)
G70672 LOC108415088 non-coding upstream 238237 2673139 ~ 2701134 (-)
G70673 NA non-coding upstream 322241 2757143 ~ 2757834 (-)
G70691 NA non-coding upstream 331703 2766605 ~ 2766880 (-)
LOC103042850 cratb,LOC108435838,LOC108274804,LOC107561339,LOC107758403,LOC105903715,LOC107563340,LOC107679039 other downstream 1384543 1009886 ~ 1035016 (-)
tnip1 tnip1,LOC107594924,LOC107750363 other upstream 269293 2704195 ~ 2745072 (-)
G70924 ndufb9 other upstream 845254 3280156 ~ 3353599 (-)
LOC111193045 LOC108442482,LOC102793828 other upstream 1009193 3444095 ~ 3458810 (-)
LOC103023864 NA other upstream 1140659 3575561 ~ 3703751 (-)
LOC103042226 LOC108274609,LOC107701883,LOC100536156,LOC107747745,LOC107574915,LOC108442488 other upstream 1301724 3736626 ~ 3848624 (-)

Expression


Co-expression Network