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Basic Information
| Item |
Value |
| gene id |
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| gene name |
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|
| gene type |
misc |
| species |
mexican tetra (Astyanax mexicanus) |
| category of species |
ornamental fish |
Chromosome Information
| Item |
Value |
| chromosome id |
NC_035904.1 |
| NCBI id |
CM008307.1
|
| chromosome length |
27092187 |
| location |
8869128 ~ 9036026 (+) |
| genome version |
Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome |
Sequence
>TU97464
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CAAATGTATCAGTTGGAATAGATAAATCTTCTCCAGATCAAAATCCAATCTCTGAACCAATGCTTTTCAGTGGCAGTGAAGTGATACACTTATACTCTGCTACTACTGTCTCCAGCCTGCCTTCTACCCCACAGCCACACCCCCAAACCCATGGCTAAATCTGATGTCACGTTCGCTCAGCTGTGACTGCTGCATGACCTAATCAGAGGGAAACACTTactatatagagatatatatgaatatagatatagattgctatgattttactatttttgtttatgatttttatCCATTACTCACACAAGAGATTTGTGTATGTACTGTCTCTGCTAAGCCTTTGCATATTGACACCCTCTGCACCCACTCACAATGGACATCTACAATGTAACTAAACCTTCTAGATATTTGTAAATGCTAAATAGTGTGATGCCCTGAAGCTCTTGATCAgtcctttcctttcttttcgCTTTTGTTTTTGAGAACTTAAGgagaggggggaaaaaacaacaaaaaaatatatatatcacttttgTGTCTGGCTTCAACATACTGATCTAACACTGTATTACTGTAACTGAATTATTATGTATTACAGCTCTATCTCTTCTCTTTCACCcctttgaaaaataaaaaaataagcttcaagaaaatgtaaaaaaaaaaa
Function
| symbol |
description |
|
pcdh2ab8
|
Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane.
|
|
pcdh2ab10
|
Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane.
|
|
pcdh2ab12
|
Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules and nervous system development. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane.
|
NR:
| description |
| PREDICTED: protocadherin alpha-C2-like isoform X1 |
GO:
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name |
namespace |
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homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules |
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KEGG:
| id |
description |
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PCDHA; protocadherin alpha |
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Neighbor
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symbol |
gene type |
direction |
distance |
location |
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Expression
Gene
RNA
