G73869


Basic Information

Item Value
gene id G73869
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035904.1
NCBI id CM008307.1
chromosome length 27092187
location 15449504 ~ 15454610 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU99603
gTGCTAGCTAATCGTAACAACgagttaactaaaatattaatgttatcggggagagaactaaagttagcaacAAGCTTACTAAAATTCTAATGTTATCAGGGAGTGAACTAAAGTTAGCAACAAGctggctaaccttagcaacaagcttaCTAAAATTCTAATGTTATCAGGGAGTGAACTAAAGTTAGCAACAagcttagcaacgagctagctaaccttagcgatgagctagttaaccttagcaacaagctaacaAAAATATTCATGTTATTGGGGAGAGACCTAAAGTTAgaaatgagctagctaaccttagcgacaagctagctaaccaaaGCAACGAGCAAACTAACTAAAATTTACCGGGGTGAGAACAAAAGCAGCGACAAGCTAGATGATCTAAGTGACGAGCTAGCAAtgatactaatgttaccagtaAGTGAACTGAAGCTAACGAAAAGCTAGCTTACCTTtacgacaagctagctaaccttagtaacAAGCTAtctaaaatgctaatgctacggGGGAGAGAACTACCTTTAGTGATGAGTTAACCTAAGTGATGAGCTGTCTGATTTTTTTGGTCTCTGTCTTGGATTTGGTCTCGTTTtttctggtcttggtcttgactctgacttgaCTGTAGCGGTCTTGACTACAGCACTAGGCTAAATTTCGAAACATTTACAGCAGCAGGTGTAATGTTTAAGATATATCTATCAATTAAAGCACTAGAGGTCACAGCTTcgtaaaaaatgtgttaaataggcaaaaatcttttttttttagttaattttctgTTGGCTTCTTATATtatgaaaatgtttgtttagtccacattttggattaattatttattttctcttttgtttaaaaatttctgtttgttttgttacttaagtacaaaatctgttttacagttgctctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtaagagagagagagatggagtgtgTCTTTTGTAGAGCTAATGAACTGAATGCTGCTAGCATGCTTCTCAGTCTTCTTTACCACCACCCAAGGCAATGTATCTGCTCTCCTCAGGCCCCTGTCTGTGTTTGCAGGCGATAGCAAATCGATAGGTTATTTTCTTAGCTCATAATTAGACCTAAACATGCTTTCTAATCTACATATTTTTGCACTTGCATGGATATTAATGCATACTAGTACATCACTGAGAGGAAGGAGCACTTTAAAAGCATGGCTTGTTTCCCTGTACTGTACctcaacaacacaacacaacacagtagaaaaCAATACAACACATTGCGACACTTACCTGGTTTGGGTCTGGAGCACAATATAGCACAAGCATCTGTTCTGCAGTGAAGGaactttaaaatgtgaaatcatTGCTTTTATTTCCACTTTAAGGTGAAACTGTCacaaagctgtatataataaCTTAAGCATTTAGTTCAACACAAATGTATTCTTTACTTTATAAACACtatagtttttttatgatttgcAACACTTAGTAATGCAATTGCAGGCCTGGTGGTCCTGCAGGGAGCTGTGTCGTTCAGGGGGCGAAAGGCTTCTCCTACCTTTGGCTGAAATGTAAATGAGTGATTTGTAACATGCTAATCTCTTGCcatgatatgtgtgtgtgtgtggtatatcgGCAAACTATGCATGATCTCAGCCATGACAGCTGTGTTCATCTGGAGTACCTTGAGAAACACACGTGTGTATTGGTGCACTTTTACTGTGGAGTCTGCATGGCCCTCATGAGCTTACTGCTGAGAAAATCTGATCTGCGATCAGCGAGCAGCTGTTTCTCATATTCACTCAGAATATCTAATCTCACTCTGGATCTGAGCTGTCTACGCTCCACCCATCAGTTTAGGCTAAGAGTCACTACTTAATGCTGATTTAGTGGTTTAATTAAAGCACTGCTCTGTGGACTGTGCTGTGTTACAGCAGATCAAGACTAATTCAACATAAAGTACTGATACAAGGCTTAGTTACATTTTACTTATAATAAAACAGCACTATAAAAATATGACTTAAAGCAGGATTAGTTAGTTCCTGCGAACATTATCCTCTCTGCTCTACCAAAGATGCATAGTACAGTTATTGGTGAACTGAGCCCAGAGCAGCAACAGCGACACTGTTCTCCATATTGCAAATCAGTGGCGTAtcaaaatgactttaaattgGTTAATTTAAGGTAAACAAATTACATAGGGTTGTTTTAATAggaattgtttttttacatataagAATAGAAgagtttttttactatttaatttcAAAGTTTGCCtttttacataattattatatttcttgGAAAAGGctcaaatgtttaatttcaatatgtttggattaaaaaaataattaatacatttatttcatttatttttttccccattttctccccaatttacacactcattaggactccctctattaATAGTAACGCCCCAActccaggagggtaaagactaacacatgcctcctctgatacatgtgaagtcagagtccgcctctttttgaactgctgttgatgcagcattgtcgagtagcatcacgcAGCttctcggttccgatacatcaacTCACAGATGCCAAGTGCTAAGTGACATTAtccttaggagtgatgtggggaaagagcaccatctacccacacagagagagcaaagccaattgtgttctctcagggctccgttagctgacggcaagctacatgaacagaatTCGAatcggcgatctcctgatcatagtggcagcacataGCCCGCTGAACCACTCAAAGCCCATTTGGAttcaatttttaaatgtaatgattTAAACGTATAAATTGAAAAAGTTGTTTCATGTTTATCCCAAGCATGTTTTATTCAAAACACATACTAAAGCTATATAATTTGAAACAAATAAACCTCAAAATTTCTATAGTGTACTTTGTATTTTCTAATGGATTGAAATAGATTATTGGCAGCACTGGTTAAGCTTGTCTGATCTAAAATCAGACTGTCACTGCTGGGTGGAGCATGGACAGATCAATTGGCCTTGTATTTGTTATTTCACCTGTTTATCAGGGCTGTTTAATGGGTGAATATCATTCTTTAGTATCTGGTGACAACACTGTTTGCTGTATACACATTGTCCATATTGAATATTCTTGGCAAAAGCACACAACAACAGCATCAAAAAGTTATAATGCCGTAAGCAAAGCATGCAATATGCCATAGCGATATGATCAATACTTCAGATCAGTGTTTATTCATTAGGAACAAAAGCACTTGTTATTGTACCAGATGCTTCAGTCTAGCACAgttttctcaaccctgttcttgGAGGCTCACTGTCCTGCACGTTATTGTGTTTCTTctgcttttacacacacactgtaactcAGTAACGAGCTGTTAATGAGCTGAtaagttggatcaggtgtgttttaAACAGGGAAAACACTAAAAAGTGCAGCACAGTGTGCCTCTGGGACCAGGGCTGATAAACGCTGGTCTAGCACACTAGCACATTCAGTTATTTTCAAATCAGGTTTAATCTAAAAAGCAATGTGGGTATGGTTTGATATTCGACACGGGTTAGGGTTAGAGAGAGTTATAAGGCAGAAAGCAGTTTATTGGGAGAGTTTATTAATATGCAAGAATGTGATATGCAACATTGCAATGATGTAATGGTTATTGCATAATGGGTTAGTGGCAATATGTACTCACTCACTTGGGCTGCAATTAatagaattatttaaataacagcCCTCTGACTTCTGATCTTAGAATAGTAGACAGAAGTCCAGCTGAGAGTCGTGTTTGAAGAGGGTAGAGCGTTTCAATAGAACAACACAGCACATTCTGATTTGTACTCAGTACTATTGTGACATTAATGGTATCAGCAATGTGCTTTGTTTACACCATCCCtgtttacatgtaaaaaaaatgaatatgaaaataaaattgtacAAAAACTGTCTGTAACATAA
>TU99604
gggagagaactaaagttagaaatgagctagctaaccttagctatgTGCTAGCTAATCGTAACAACgagttaactaaaatattaatgttatcggggagagaactaaagttagaaatgagctagctaaccttagcgacaagctagctaaccaaaGCAACGAGCAAACTAACTAAAATTTACCGGGGTGAGAACAAAAGCAGCGACAAGCTAGATGATCTAAGTGACGAGCTAGCAAtgatactaatgttaccagtaAGTGAACTGAAGCTAACGAAAAGCTAGCTTACCTTtacgacaagctagctaaccttagtaacAAGCTAtctaaaatgctaatgctacggGGGAGAGAACTACCTTTAGTGATGAGTTAACCTAAGTGATGAGCTGTCTGATTTTTTTGGTCTCTGTCTTGGATTTGGTCTCGTTTtttctggtcttggtcttgactctgacttgaCTGTAGCGGTCTTGACTACAGCACTAGGCTAAATTTCGAAACATTTACAGCAGCAGGTGTAATGTTTAAGATATATCTATCAATTAAAGCACTAGAGGTCACAGCTTcgtaaaaaatgtgttaaataggcaaaaatcttttttttttagttaattttctgTTGGCTTCTTATATtatgaaaatgtttgtttagtccacattttggattaattatttattttctcttttgtttaaaaatttctgtttgttttgttacttaagtacaaaatctgttttacagttgctctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtaagagagagagagatggagtgtgTCTTTTGTAGAGCTAATGAACTGAATGCTGCTAGCATGCTTCTCAGTCTTCTTTACCACCACCCAAGGCAATGTATCTGCTCTCCTCAGGCCCCTGTCTGTGTTTGCAGGCGATAGCAAATCGATAGGTTATTTTCTTAGCTCATAATTAGACCTAAACATGCTTTCTAATCTACATATTTTTGCACTTGCATGGATATTAATGCATACTAGTACATCACTGAGAGGAAGGAGCACTTTAAAAGCATGGCTTGTTTCCCTGTACTGTACctcaacaacacaacacaacacagtagaaaaCAATACAACACATTGCGACACTTACCTGGTTTGGGTCTGGAGCACAATATAGCACAAGCATCTGTTCTGCAGTGAAGGaactttaaaatgtgaaatcatTGCTTTTATTTCCACTTTAAGGTGAAACTGTCacaaagctgtatataataaCTTAAGCATTTAGTTCAACACAAATGTATTCTTTACTTTATAAACACtatagtttttttatgatttgcAACACTTAGTAATGCAATTGCAGGCCTGGTGGTCCTGCAGGGAGCTGTGTCGTTCAGGGGGCGAAAGGCTTCTCCTACCTTTGGCTGAAATGTAAATGAGTGATTTGTAACATGCTAATCTCTTGCcatgatatgtgtgtgtgtgtggtatatcgGCAAACTATGCATGATCTCAGCCATGACAGCTGTGTTCATCTGGAGTACCTTGAGAAACACACGTGTGTATTGGTGCACTTTTACTGTGGAGTCTGCATGGCCCTCATGAGCTTACTGCTGAGAAAATCTGATCTGCGATCAGCGAGCAGCTGTTTCTCATATTCACTCAGAATATCTAATCTCACTCTGGATCTGAGCTGTCTACGCTCCACCCATCAGTTTAGGCTAAGAGTCACTACTTAATGCTGATTTAGTGGTTTAATTAAAGCACTGCTCTGTGGACTGTGCTGTGTTACAGCAGATCAAGACTAATTCAACATAAAGTACTGATACAAGGCTTAGTTACATTTTACTTATAATAAAACAGCACTATAAAAATATGACTTAAAGCAGGATTAGTTAGTTCCTGCGAACATTATCCTCTCTGCTCTACCAAAGATGCATAGTACAGTTATTGGTGAACTGAGCCCAGAGCAGCAACAGCGACACTGTTCTCCATATTGCAAATCAGTGGCGTAtcaaaatgactttaaattgGTTAATTTAAGGTAAACAAATTACATAGGGTTGTTTTAATAggaattgtttttttacatataagAATAGAAgagtttttttactatttaatttcAAAGTTTGCCtttttacataattattatatttcttgGAAAAGGctcaaatgtttaatttcaatatgtttggattaaaaaaataattaatacatttatttcatttatttttttccccattttctccccaatttacacactcattaggactccctctattaATAGTAACGCCCCAActccaggagggtaaagactaacacatgcctcctctgatacatgtgaagtcagagtccgcctctttttgaactgctgttgatgcagcattgtcgagtagcatcacgcAGCttctcggttccgatacatcaacTCACAGATGCCAAGTGCTAAGTGACATTAtccttaggagtgatgtggggaaagagcaccatctacccacacagagagagcaaagccaattgtgttctctcagggctccgttagctgacggcaagctacatgaacagaatTCGAatcggcgatctcctgatcatagtggcagcacataGCCCGCTGAACCACTCAAAGCCCATTTGGAttcaatttttaaatgtaatgattTAAACGTATAAATTGAAAAAGTTGTTTCATGTTTATCCCAAGCATGTTTTATTCAAAACACATACTAAAGCTATATAATTTGAAACAAATAAACCTCAAAATTTCTATAGTGTACTTTGTATTTTCTAATGGATTGAAATAGATTATTGGCAGCACTGGTTAAGCTTGTCTGATCTAAAATCAGACTGTCACTGCTGGGTGGAGCATGGACAGATCAATTGGCCTTGTATTTGTTATTTCACCTGTTTATCAGGGCTGTTTAATGGGTGAATATCATTCTTTAGTATCTGGTGACAACACTGTTTGCTGTATACACATTGTCCATATTGAATATTCTTGGCAAAAGCACACAACAACAGCATCAAAAAGTTATAATGCCGTAAGCAAAGCATGCAATATGCCATAGCGATATGATCAATACTTCAGATCAGTGTTTATTCATTAGGAACAAAAGCACTTGTTATTGTACCAGATGCTTCAGTCTAGCACAgttttctcaaccctgttcttgGAGGCTCACTGTCCTGCACGTTATTGTGTTTCTTctgcttttacacacacactgtaactcAGTAACGAGCTGTTAATGAGCTGAtaagttggatcaggtgtgttttaAACAGGGAAAACACTAAAAAGTGCAGCACAGTGTGCCTCTGGGACCAGGGCTGATAAACGCTGGTCTAGCACACTAGCACATTCAGTTATTTTCAAATCAGGTTTAATCTAAAAAGCAATGTGGGTATGGTTTGATATTCGACACGGGTTAGGGTTAGAGAGAGTTATAAGGCAGAAAGCAGTTTATTGGGAGAGTTTATTAATATGCAAGAATGTGATATGCAACATTGCAATGATGTAATGGTTATTGCATAATGGGTTAGTGGCAATATGTACTCACTCACTTGGGCTGCAATTAatagaattatttaaataacagcCCTCTGACTTCTGATCTTAGAATAGTAGACAGAAGTCCAGCTGAGAGTCGTGTTTGAAGAGGGTAGAGCGTTTCAATAGAACAACACAGCACATTCTGATTTGTACTCAGTACTATTGTGACATTAATGGTATCAGCAATGTGCTTTGTTTACACCATCCCtgtttacatgtaaaaaaaatgaatatgaaaataaaattgtacAAAAACTGTCTGTAACATAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU99603 True 3972 lncRNA 0.38 3 15449504 15453826
TU99604 False 3791 lncRNA 0.38 3 15449504 15454610

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
fibin LOC108442682 coding downstream 15479 15431473 ~ 15434025 (-)
LOC103038669 kif21a coding downstream 158792 15228039 ~ 15290712 (-)
LOC103035545 LOC108428749,LOC105908727 coding downstream 374735 15001175 ~ 15074769 (-)
irx3 LOC103035229,LOC108428748 coding downstream 482203 14964498 ~ 14967301 (-)
rbl2 rbl2 coding downstream 559749 14868932 ~ 14889755 (-)
ano3 ano3,LOC107677449 coding upstream 6077 15460687 ~ 15543780 (-)
LOC103042382 LOC108442690 coding upstream 109361 15563971 ~ 15571540 (-)
gas2 gas2,LOC107677431,LOC107728426 coding upstream 126426 15581036 ~ 15621857 (-)
LOC111193057 NA coding upstream 167371 15621981 ~ 15624917 (-)
slc17a6 slc17a6,slc17a6a,LOC107555703,LOC107570095,LOC107677426 coding upstream 190469 15645079 ~ 15660833 (-)
G73862 NA non-coding downstream 18197 15430147 ~ 15431307 (-)
LOC111193098 NA non-coding downstream 131417 15314637 ~ 15318087 (-)
G73760 NA non-coding downstream 260169 15188594 ~ 15189335 (-)
LOC103036159 NA non-coding downstream 338140 15085780 ~ 15111364 (-)
G73697 NA non-coding downstream 363780 15085494 ~ 15085724 (-)
G73877 svip non-coding upstream 117724 15572334 ~ 15577498 (-)
G73910 NA non-coding upstream 189211 15643821 ~ 15644252 (-)
LOC111193099 NA non-coding upstream 398692 15853302 ~ 15953813 (-)
G74091 usp3,LOC107659494 non-coding upstream 649006 16103616 ~ 16108725 (-)
G74199 NA non-coding upstream 747914 16202524 ~ 16215525 (-)
LOC103040324 NA other downstream 34891 15381329 ~ 15414613 (-)
LOC103037068 cpne8,LOC108274474,LOC107679956,LOC107752477,LOC107723993,LOC105026415,LOC106561599,LOC105028206 other downstream 235220 15123814 ~ 15214284 (-)
hbp1 hbp1,LOC107732286,LOC107701066 other downstream 652221 14709058 ~ 14797283 (-)
LOC103025073 dynlrb2,LOC103025073,LOC106573385 other downstream 903968 14542196 ~ 14545536 (-)
G73172 NA other downstream 2828148 12610834 ~ 12621356 (-)
LOC103046265 pkp3 other upstream 303693 15758303 ~ 15780678 (-)
LOC103041134 rps27l,zgc:136826,LOC107752326,LOC107598918,LOC101156845 other upstream 1012479 16467089 ~ 16470323 (-)
nrg4 NA other upstream 2422416 17877026 ~ 17885395 (-)
G74591 isl2,LOC105022634 other upstream 2528137 17982747 ~ 18029747 (-)
G74791 NA other upstream 3484564 18939174 ~ 18940464 (-)

Expression


Co-expression Network