man2a2 (man2a2,LOC107750719,LOC107720774,LOC107670215)


Basic Information

Item Value
gene id man2a2
gene name man2a2,LOC107750719,LOC107720774,LOC107670215
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035904.1
NCBI id CM008307.1
chromosome length 27092187
location 12680106 ~ 12715658 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
man2a2 Predicted to enable alpha-mannosidase activity. Predicted to be involved in N-glycan processing and protein deglycosylation. Predicted to act upstream of or within mannose metabolic process. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in Golgi membrane. Used to study schizophrenia. Orthologous to human MAN2A2 (mannosidase alpha class 2A member 2).

NR:

description
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KEGG:

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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fanci fanci,LOC107673243,LOC107670230,LOC107564606 coding upstream 92563 12568837 ~ 12587543 (+)
LOC103039298 NA coding upstream 132428 12490584 ~ 12547678 (+)
LOC103039191 LOC108428816 coding upstream 194697 12458545 ~ 12485409 (+)
znf469 NA coding upstream 262749 12365365 ~ 12417357 (+)
LOC103044030 LOC103044030,LOC108428802,LOC108428756 coding downstream 182127 12897785 ~ 12909061 (+)
rag1 rag1,LOC107750737,LOC107670202 coding downstream 218794 12934452 ~ 12942962 (+)
ehf ehf coding downstream 947151 13662809 ~ 13677076 (+)
pdhx pdhx coding downstream 978770 13694428 ~ 13765050 (+)
cd44 LOC106561308,LOC106573350 coding downstream 1078755 13794413 ~ 13828422 (+)
G73191 NA non-coding upstream 3758 12674986 ~ 12676348 (+)
G73189 unc45a non-coding upstream 10377 12663967 ~ 12669729 (+)
G73177 NA non-coding upstream 38284 12639245 ~ 12641822 (+)
G73146 fbxo31 non-coding upstream 115314 12564133 ~ 12564792 (+)
G73091 NA non-coding upstream 122254 12557634 ~ 12557852 (+)
G73214 NA non-coding downstream 231988 12947646 ~ 12952320 (+)
G73288 NA non-coding downstream 382083 13097741 ~ 13098590 (+)
G73292 NA non-coding downstream 442111 13157769 ~ 13158679 (+)
G73298 NA non-coding downstream 510013 13225671 ~ 13225955 (+)
G73301 NA non-coding downstream 522302 13237960 ~ 13238212 (+)
LOC103022150 brsk2a,brsk2b,LOC107707552,LOC107675281,LOC107600443 other upstream 2053142 10272919 ~ 10626964 (+)
G72621 NA other upstream 2597966 10078579 ~ 10082140 (+)
LOC103043718 LOC103043718,LOC108442465 other upstream 2710064 9968506 ~ 9970042 (+)
G72281 LOC107754548,LOC108274935,LOC107754545,LOC107754498 other upstream 3530687 9142899 ~ 9149419 (+)
LOC103030246 pcdh2ab8,pcdh2ab10,pcdh2ab12,LOC108430950,LOC101884096,LOC108274577,LOC107588388,LOC108430926,LOC108430925,LOC108430922,LOC108275110,LOC108430948,LOC108275111,LOC107588302,LOC107660888,LOC107754492,LOC107655665 other upstream 3644080 8869128 ~ 9036026 (+)
LOC103043719 NA other downstream 155826 12871484 ~ 12897931 (+)
G73533 NA other downstream 1933171 14648829 ~ 14649551 (+)
rpgrip1l rpgrip1l other downstream 2175876 14891534 ~ 14921003 (+)
svip svip other downstream 2856644 15572302 ~ 15577533 (+)
G74169 NA other downstream 3571018 16286676 ~ 16288329 (+)

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