LOC103023840 (cpeb4,LOC108430986)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103023840
gene name cpeb4,LOC108430986
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035904.1
NCBI id CM008307.1
chromosome length 27092187
location 7139036 ~ 7173548 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007253575.3
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Function

symbol description
cpeb4 Enables RNA binding activity. Predicted to be involved in several processes, including cellular response to glucose starvation; negative regulation of cytoplasmic translation; and response to ischemia. Located in cytoplasm and nucleus. Biomarker of liver cirrhosis; portal hypertension; and primary biliary cholangitis.

NR:

description
cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4 isoform X1

GO:

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KEGG:

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LOC103027052 LOC108430977 coding downstream 439164 7612712 ~ 7652490 (+)
LOC103027348 LOC103027348,LOC108430938 coding downstream 498010 7671558 ~ 7674663 (+)
mars2 mars2 coding downstream 546332 7719880 ~ 7725813 (+)
spock1 spock1,LOC107747099,LOC107655663 coding downstream 1266589 8440137 ~ 8641348 (+)
G71805 NA non-coding upstream 38311 7061692 ~ 7100725 (+)
G71810 NA non-coding upstream 80761 7057734 ~ 7058275 (+)
G71808 NA non-coding upstream 85712 7053023 ~ 7053324 (+)
G71787 NA non-coding upstream 266672 6872148 ~ 6872364 (+)
G71747 adra2da,LOC108430987,LOC105904584 non-coding upstream 270632 6867048 ~ 6868404 (+)
G71858 NA non-coding downstream 132611 7306159 ~ 7306542 (+)
G71859 NA non-coding downstream 136234 7309782 ~ 7311864 (+)
G71878 kif3a,LOC107598362 non-coding downstream 251156 7424704 ~ 7441750 (+)
G71891 NA non-coding downstream 299313 7472861 ~ 7473404 (+)
G71892 NA non-coding downstream 303918 7477466 ~ 7477724 (+)
G71788 LOC105418110,LOC105418502,LOC106676625,LOC102305489,LOC102201812 other upstream 253495 6881587 ~ 6885541 (+)
G71682 LOC108430946,LOC108416517 other upstream 600242 6525641 ~ 6538794 (+)
LOC103043949 ppp3cb,LOC108274683,LOC107660165,LOC107758531,LOC107680292,LOC107589094 other upstream 1182017 5871090 ~ 5957019 (+)
LOC103037414 NA other upstream 1460162 5672718 ~ 5678874 (+)
G71414 gstp1 other upstream 1633398 5499908 ~ 5505638 (+)
LOC103030246 pcdh2ab8,pcdh2ab10,pcdh2ab12,LOC108430950,LOC101884096,LOC108274577,LOC107588388,LOC108430926,LOC108430925,LOC108430922,LOC108275110,LOC108430948,LOC108275111,LOC107588302,LOC107660888,LOC107754492,LOC107655665 other downstream 1695580 8869128 ~ 9036026 (+)
G72281 LOC107754548,LOC108274935,LOC107754545,LOC107754498 other downstream 1969351 9142899 ~ 9149419 (+)
LOC103043718 LOC103043718,LOC108442465 other downstream 2794958 9968506 ~ 9970042 (+)
G72621 NA other downstream 2905031 10078579 ~ 10082140 (+)
LOC103022150 brsk2a,brsk2b,LOC107707552,LOC107675281,LOC107600443 other downstream 3099371 10272919 ~ 10626964 (+)

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