pot1


Basic Information

Item Value
gene id pot1
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035904.1
NCBI id CM008307.1
chromosome length 27092187
location 18893227 ~ 18937127 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_015605137.2
GCAGTTTTCCGCGCTCACATTAAACCTGCAGCGGGctgctgctgtcctgctgtcacAGAGTCACACCGCTGTACTGACCTCATCTATGGACCCGTTTACCACTAGTGTTAGCCAGCTAGCTGTGTTGGGTATTTTATACAAATACTGCGCGGACCGTAAAAAATCAGAAACAGCTAGTTAAAATGTCCACGTTAGTTTTGTCTGTCAGCTGAAGTTGGCTGGAGTCTCTTGTTAGCTAACTAAGTGTAGCGGCTAGACGAGCGTTTGTTTTTAGCCGACTAGCAATAGTAGAgtttaactagctagttagttagcttagctaacctagctaactaactaagaTAGCTAGCTTATAAACGCCAAAGGGAATATGGTGTAATTTGAGAGTTTGGGTGTTAAACGTGGCTGTGTTCCGGAGGAGATAAGTTCTGatattgacTGTAAGGCATGCCTGTCCACACAGTGAAAGATGTGAACGACCTGGACACTAAGGTCCCTCCACATCTGCAGCACGTCTCTATATCAAACCTCAAACTCACCTCTGACTGCCTGCACAGGAGTGTTAAGgGTAAAGTGGTTCAGAAGGGCCCTGTAGTATCTTGCAGACAGAGAGAATATCTGCTGAAGGCTGTTATCCAAGGGGAAGACCCCCAACAGAGATCAGCTTCACAGCATGCATCAatcaatgtcattttttttggcACATTGGCCAAGGACTTCTCACAGTCTGTCAGTCAAGGGGACATTATCTTATTGGCCGGCTTCACCATCAGTAAGTCACCATCTGAGCAAACTGACAAGCTGCATCCCTGTCACTTGGAGATGAGTGGCCCTGATGCCTGTGTGCATGTGTGTCCCTCTGCTGGTTCCTCATCCAGTGGATCTACTACTTCTGAGcCCAAGTACACTTATATTCCTTTAAGTGAGCTGAAACCCAGGAGTATAGTGAATGTGTATGGTGTGGTGACATTTTTCAAGCAGCCCTTTCCCACCAAAGGCACAGATTACTGTTCTACACTCAAGATCACAGACCAGTCTAATGCAAAAGTGGGCTGCACTATATTCAGTGAAAAGCTTGAAGACCATCCTAAAATCTTCAGGGTTGGAGACATAATTCGGCTCCACAGAGTGAAGGCACAAATGTTTAATGGCTCCATGACTCTTCTGACCACCCTGGGCTGGTCTACCATCACCTTTGATGGAATGATTGACAGCCCGGTTGAGCCCCGCACATCAAGCCGGACTTTCCACTTTGATGAAGCTGACAAACATACAGTGGAAGCACTCCGCCAGTGGGCAGCGAGCCAGTCACTGCTCACCAGTGAGTCTACTGTCCCCCTGTCCTCAGTGCAGCCCAAGATGTACTTTGATCTGACCTGCCAGCTGTTATCAAAGGCCTGCATGGACAGTAGATGCATACTGCTTAAGGTGTGGGATGGGACAGAATGTGGTCATTCTCTGCTTAATGTGGCTGCGGCACCAGATGCCTTGGAGGGAGAGTCTACTTGTTTTCAGGATCAACAGAACATGACAGCCAATATTCTGGTCTATGACAACCATTTGGAAGTAGCCAGAATGTTGCAGCCTGGCATGTTCCTGAGACTATACAACCTCCACGCAGTACCTCAGACACCTCCTGGCCAGCCCCCTGATGTGCCCCAACACCTCGTTTTCCACCTGCATGGCGGCACTTCATACGGCAGGGGCCTGCGCAGCATCCCATCAGACAGTCCTGATCTACAGTCCCTCAAGAGAGTGTTGGAGAGccatgcagaaaaacaggctgcTGAAGCAGAGGTGAATGATGGCACTCTTCTAGATGTGTGGTACACTCCTCCAGAGACAGTGGTGGAACATACAACTAAAGACCCTGGTGAAGCAGATACCGAAGACTTTTACACAGTTCAGACATGTGACCACAGTCTGCAGCAGGTGTCACTTGCACATGTGAAGACTTCCATACCACCTGTGGTTTGTCACGTTCAAGCCAGAGTGAAGTCTTATCAACCACAGAAACTGTACCAGTGTCTCAAACTCTTCTGTCCGcagtgtaaaacagtAAAAGATGTCCCTGATGATGAGTCCATAGCTCAGGTGTTCGAGGAGGCTCTGAGAAGCAGTAACCAGCCCTGCAGTGAGCACTGGGCGGTCACCTCCTCAGCAGACTCCCACCAGCTGGACCGAACCGTCACCATGCACATGTCCTGTGACATGGTGCTGGACAACACTCACTTACAGATGATCTTTCTTCAGGGTGTGACCCTGGATGAGATGTGCATAATATCTGGTTCTCATAAGAACCTGGTCCCTGTGTGTTCAGGAGAGGACAGGAGAATGAGACTTCTGGATCTCTCTGCCCCATTCCTCTTCTGTGGAGACAAGAGATATTATGGgtgtgAACATTGCTCTCAGTCCTCGTTTGTGGATCCTGTTGTTTCAGGTGTAGACGTATGGGACGAGCAGAATGTAGCTAAAGCTCTTGGGGTGCAGCTTATGCAGTATATGCTTCTGCTGCAGTTCGAGCTGGAGGATGAGACTGGCACACTGGATGCTTTGCTTTGGGAGGATGCTGAGAGATTCTTTAATGTCTCTTCAGCTGAAACATCAGCCAATCAGGAATTGCAAGACAGGGTTCAGAACATCATGGACAGGATTCATCCATCAGGGAGTAGCATGGCTGAACGGCCATGGCTGGCTCTCTGCCTCAGTGTCTACACTGTAGAAGAGAATGGCCGGACTCAAGTGTGCTACCAGATCACTAACACAGAAACCAGGGGAAATCTCTAGGCTCCTCATTCAAGCCATAGAACATTTCCTTTAAGTGAAGGATGCCCGTATAATAGCTTAAGCTAAAAAGACTGCCATATGAAGGTCAACCAAGGTCAGCCAAAAATGTTCAAAGCTTCTGCTGATGTGAAATAGTTTGTCCTGTCAAGGCCTGTGTATGTGTGCAAACATTTGCACAAACATACCAATTGTGTCTTTTTCAGCTAATTCCAGtgtacagtttttatttatttgctgaaattaTAAAGAACAAgacataaaattatatataactgTGCATACCTGCCGTAGTTAACCTCTAGATTTGTCTAAGCAGGCAAGTAAGCTGTAATTttgcatgaaaatattctgaATTGTGTATAAATTGGTGCTTTTTATTAGTGTTAACTACCTTCTGCTCCATCATATCAGGTAATATAACTATTCACTTAATAACCTTAAATCAGTCGTTTGGGGGTAGAGAATGTAAGAAACTGTATAGGGCAGTGGGGTCCCAGAACTAATGCATGTCAGAACTCAAAAACCCTCCATTAGAGATTTATGGTTAGCTTGGTTGTTTATGGAGGAATCTGCTAATATACACCAGCCAGCCCCTTTAATAAACCTCTCACATCACAGGACCACCACACAATAGATGATGTTTGGACATTGGCTCATTCTTAGCACTGCATTGAccctgacatggtggtggtgggtttagtagtgtgtgttgtgctggcatGACTTAATTAGACACAGCAGTgatgtttccactcactgtccactctattagacttttctaccttgtagataaagtaaagtcagggtcagcagctctgaatctgttgctttagtccttcatcagtgaaGATGTTGGGCACATATTCCAGGTTGGTGGTCTATTCTTAATCCAGCAgggacactgaggtgtttaaaaactccagcagcactgctgtgctgagaatGAACCACCACTAAATAATACCCGTCCTGTAGTTTCCTGATAAGATAAAAGGAGGCAATAAAGTGTGCTGAGAAACAGATAATAGTCTGTAATTATACAGCTACAGAATGCCCTATTGGTCTTAATGAAGTGGCTGCTTGGTGTACCAATCTCATGCTCATCATTCATCTAATAAACATGGAATCCCAGATCTGATTAAAAGAATCAAATgtgaaaaaacttaaaaattaattacagGATTCAGAATTTGAACAGTGGGGTCTCTCACTGGACATTATTTACCCACATCTTCCTGATACTTTTTATAGCTCTTCTTTCATAATGTTTGAGCTCGCTGTcttcatatattcatataaaaaCATTAGTACACATTGAAATCTTCATGGAAGCTTTGTTCTCAAGTGTTCTCAGTATTATGGCAGCTACGTAAAGACAAATCTAATATAAAGCTTAGACCTGTAGACAATGGTAAAATGACTATATAAGCTATAtagaaaaaattataaatatgaagTGTTTCCTAATTTGTCTTTTTCACTGAATCGGTTTATAAATCTTGAAACTTGAAATGTGTTATATTTGTGTTCTGTGTCTAAGCTGTCATTgagttttatttctcttttgaatACATGATATCTATTTTTGAATGTCTTTGGCTGCCGTTTGAGTGTGAACCATCTTGGTTTTAGTCCAGtagaagaaaatgaaaattacagaaagtgtgccTTTGCCTCTAATTGAGCAACATGCATCTCTTTTTGGCAGAATTGTCCATTATTATAATTGTTCATACCTCATTGTAATTGTTCATTTTCACAGCAGATGATATGTAATAAGTAACAGTGTCTTGTATAGATTTAAGCTTATTTGCAACTTTTTAAGCATTCAGGCTTCCAGTTTTAACTCTGTGATATAAAATGCTCTTTTTCAACTTA
>XM_015605138.2
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Function

NR:

description
protection of telomeres protein 1 isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0005515 protein binding molecular_function

KEGG:

id description
K11109 POT1; protection of telomeres protein 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_015605137.2 True 4665 mRNA 0.44 21 18893227 18937127
XM_015605138.2 False 4641 mRNA 0.44 20 18893227 18937127

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103034777 wasl,wasla,LOC108275301,LOC107598884,LOC107659464 coding downstream 119660 19056787 ~ 19081399 (+)
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LOC103029914 scamp5,scamp5a,LOC108436905,LOC103363822,LOC107395508,LOC107703195 other upstream 413882 18470704 ~ 18479345 (+)
G74649 NA other upstream 438030 18454851 ~ 18455197 (+)
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LOC103028745 NA other downstream 1266492 20203619 ~ 20207955 (+)

Expression


Co-expression Network