carhsp1 (carhsp1,LOC107733846,LOC107576530,LOC107738622,LOC107590589,LOC107690249)


Basic Information

Item Value
gene id carhsp1
gene name carhsp1,LOC107733846,LOC107576530,LOC107738622,LOC107590589,LOC107690249
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035898.1
NCBI id CM008301.1
chromosome length 34292151
location 28749534 ~ 28796458 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU19295
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>TU19296
gtaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatactgtggcTCTTGGTTATATGTGTGGGTGAATGAGagtgttttattaaagttttctgCCATcatcttcagtgtttttttttctgttgtcagtGCTGCACATCTACCAGACATCCCACTTCTTCCGTGACTTGCAGGATTCTCCTGTATATTTTGGTAGTGGCTCCTGTTGCAATACCACACAAATTGGGATATTGAACATATGTTGGGCTTGCTTGTACACTTTTGGGAGTGAAAAATTCagtgtttaattcagtgtttagtcatgaaaaatatcagatttgggcCTAAATTACCTGCTTTGAGGTTGAGGTAAGTCACATGATTAATtcatacatacaacatataattcagGCAaagagaatgtaaaaaaaaaaaaaggcaaactgAAATCGGGACGGGAATGATGCAGGCAGGGttctatttttcttattttccagtttgttgtgctgttttctgtgtgtatatatatatataaaacaggtcTGAAGTGAAAGAAGAGAGCAGAGTGAAGGACGGGAATGCTACAGAGCAAGCAGGTCAGCTTTAGACCTTCAGGAGAATCACCCCAAGCATCGTATTCGTACATTACTGTACGTACATCCACAGAAACATGAACATATGAACACGGCATGCTGCCTATTTCCGTTCGTGGCACTGAATGGGGACGGCAGACGAGGGGACGGACTCTGCAGGGGGTCATGTTCACCTGAGAAGTGACCAGCGCAGCATTAAGAGAAATGAGCTTAGATCTGAGTGGCCTGCAGCAACTCTAGCAACTTCCCATTGGCTTCCCATTCTGTTGTGAGTGAGTCTAGACGACATGTATTCTGGACTTTTCTGTGTTTTGGGAAATGTGCACCAGAACTACGAAGACTCGGAAAGTAGAGACATTTTTACAGGTTAAAAATGAGATATCCTTTAATTGAGAATcagaaaatgtaagaatgtaTTGAGTCCAGCAGCCATTTGTGCTTTTGGAGAAGATGATCTGGGCTGAGGATGTGGACGCAGGTTTAGCCTGGAATTAGGATTATTATCCACTGTACAATTGGACACAGGTCTTATTAAATCAagagaaattaagagaaatTACGACGATTTACCACCAACCTCAAATACAGCCAATCGATAACATAGATAACTGATATCTACAAAGAGCTTCTTTAGTTTCAAATGGAGCTGAGATGCTAGGACAACAATGCTAACAAACGTTGGACTTGGACTGTCCAACCATGTGTAAAACCATGTGTTTCTACCTTGTTTTACAGTAAATTCCAGTAGAAAACATGTCTGTATGACTCCTGTATTAGTAGCTCAACTGGGACTCAAAGGTTTAGTCAGTGATGAAACTAGTAGGTTGTAAAAATGGGACCAATCtttgttagcaatgttagcctAGCATTTCCTACACTTCTACATTACAAAAGCCCACaccaaatatcaaatatcagtGTTTCTAAACcacattttaagtgatttagCTAAATTCATGTGCAAATATTTGGACACCCCTtgcaataaacacaaataagttTGTAATTTACGTTATAAACACTGGTGACGCAGACACACAGTGCAAATGCgtgcatatatacatacatgcatgcCTGTCtaatgtagagaagtattaacaaaagaataggactcgcttgtttgaatcccggtcatgtagcttgccatcagctgccggagccctgaaagagcacaattggccttgcactCTCTcgctgggtgggtacagtagatggcactctttcccctcatcattcctagggtgatgatgatcagcacaaggctgcgtctgtgagctgatgtatcagaaccgagtcgctgtgctttcctctgagtgcgctgtgctgtgatgctactcgacaatgctgcatcagcagcagtttaaaaagaggcagagtctgacttgtATACGTTACTGTGGATTAGagggctgtaaaaaaaaaaccagcagTAAAACATCTTCTTCTCTGTTATGATACCGATCCCAACTAGTGTCTTCACCTCatttgtggctgaatgcaattaaatcctcacaacaatgctGTCCgtgaatctagtagaaagccttctctgGGCAgtaatactcttgatttcataagaaatatactttattttgtctatatagtgtactgtactgtatatgagaCTGTATTGGTATTTGTAATGGTTCCTCGGGAAATGAAATACTGCTTTTATACGGTACACAGCGTGATTAAACTCAGATCAGTGGTCCGCTCCTCGCTGTAAAAACAGTTGGCGTTCTGCGTGCGATTAAGGGCATGCTTTATTTTCCTAATAAAGGACGGTGAGGAAGGCTGGCAGGCAGCCAGCTTTAATACAGCTGCCAGGAATTGATTTGCTCTGACTGACACAGGTCAAAGAACAATACACACAGTAACTGATCCCAGACTGGCTTTCCAAATCCTGCAGCCGAAAAACAAGAGGGAGCTTCTCACTCAGACAGATAACTTAAAGAGCCCatatcctatatatatatatatatttaccctTGCTTTTTCTTCGTTCCAACTTTCGTATGATTTATCTTATTTTGTTCCCTGAGCTCCACTTAAGACTTAATAGTGGTTttgttctatatatatatatatata
>XM_022675872.1
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>XM_022675873.1
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>XM_022675874.1
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Function

symbol description
carhsp1 Predicted to enable mRNA 3'-UTR binding activity. Predicted to be involved in regulation of mRNA stability. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human CARHSP1 (calcium regulated heat stable protein 1).

NR:

description
calcium-regulated heat stable protein 1-like

GO:

id name namespace
GO:0006355 regulation of transcription, DNA-templated biological_process
GO:0003677 DNA binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

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XM_022675874.1 False 1130 mRNA 0.48 4 28753764 28774228

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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fam214b fam214b,LOC102776582,LOC107684984,LOC107595918,LOC107672624 other downstream 1710788 27023495 ~ 27038746 (-)
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Expression


Co-expression Network