znf385c (znf385c,LOC107590592)



Basic Information


Item Value
gene id znf385c
gene name znf385c,LOC107590592
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035898.1
NCBI id CM008301.1
chromosome length 34292151
location 5539941 ~ 5686852 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


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>XM_022672620.1
CCGGCATCAACACAGCGCGACTGGTTCACACCACAGTTCGCGGGGGCAGCTGAGCGCGAGGAGGAGCGGCAGGAGTATGCTGGGATCGGAGAACCACGCGGAGGAGAGACACGGAACCGtctcAGGAATGAAGCGTCCATTTAGTCCTGTTGAGGAAGGCGGAGCTTTGAGCGAGGGAACTACACTCGAGGACGTGCCTTCCAATGGCGAAGAGTTTACATCACTTGAGGCCTCGCCTCCAGAGATTCGGCCAAAGCGGGAACGCAAACACAGATCGTACACACTCTGCGAAGTGTGTAACATTCAGCTCAACTCCGCCGCACAGGCACAGATACACTACAATGGCAAAACGCATCAAAAGAGACTGAAACACGCCAATAGTGGGAACACAGGTACAGCAGCTCAGGGCAGCCCCCTGCTGGCTGCGTTGCCCATGCAGGGTCGTCCACTGCAGACGCCTCTGGACCTCAAGAACTTCCTGCCATTCAGACTTAATGGCTCCTCCCCTCTCAGCCTGTTCCCCAACTTCAATACTaTGGACCCTGTACAGAAGGCTGTTATTAATCACACCTTTGGCGTTCCCCAGAAGAAGAAACAGGTTATCTCGTGCAATATCTGCCATCTCCGCTTCAACTCCACGAATCAGGCGGAGGCGCATTATAAAGGTCATAAGCACGCTCGTAAACTGAAAGCTTTGGAGGCTCAGAAGAACAAGCAGCACAGACGGCAGCTCGAGCACACGCACGGCCGAGAgcgggagaaagagagagagagggatagagggagaaagagtgcACCTGAGCCTCTTCCTGCCCTTCTGGAGCCCTGCGCTGTGGAAGGACCCACCGTTCTCTGTGATCCAGACCCTGTATTGAAGATGGAAGATGCTCAGTCCAGCTCCGTCATCCTGACTCCAGTATCTGAAGTGTCGTCAGCGGACGTGCCGGTCTCCTCTCCGCCCTCCCAGCACTCAGACGGCCCGCAGGAAACCACTTCCGGACCCAGCGAGGGGGCTGCCCAGCAGGACAGCCCAGCAGGAGAGGCCCCAGCAGAGAAGGAGCCTCGGAGGAACAGACAGCACCTCTACTGTCCCGTCTGCAAAGTGACTGTCAACTCAGTCACTCAGCTGGAGGCCCACAACAGCGGGACCAAGCACAAACTGATGCTGGAGGGTCAGAGCGTTTTGCCACGCCGACGGGGGAAGGCGCTGTCCTCTTGTGCCACGTGCAAAAGCAAGCGGCTGGCTAACAAGGGCAGCATGAGCGTGGCCAACAAGAGCTtccagtgtgaagtgtgtgagaTCCACGTCAACTCTGAGACCCAGCTCAACCAGCACATGAACAGCCGCAGACATAAAGACAGACTGGCAGGAAAGCCCCCAAAGCCCAAATACAGCCCACACAGCAAGAGTCCACCTACCTCAGGAGTATCGCAGAGTGTCAGGTGGAATGGATATGCAGGAGGAGCTGTGTCAGCCATGAAGAAAGTCTTTAACCAGTACAGTCTCACCTCGCTATCTTCACAGACTAAGCTGGCTCTACAGAAGCAGTTGACTAAGAATTTGACGACCAGATTTCTGCCCACCCCTATTACTCCGCCCACTCTTTGCACGGTGGCAGCCAATCCGCTTGCTCTCCGACACCCTGCTGGAGCCACCTTCATTCAGACGCCAATCCTAGGCCCTGCCCTCTTTCGACCCGCTCCGGGACCACTCcgggccacacacacacctgttattTTCTCACCTTATTAAATGatacatgcacacaaacatgCGCTCACAGAATCAAACAAAACACTGCTGTCATAAGAAAGCCTTGGATTTCTGATATAGtatacattaaacattttattcagtttaataATCGGccgtttctattggtctatttacTGTAAGTTGCTCACACTGGGCAAAAAGGTGAAATTACAGATCTTTGTTATGACAGCATTGATAAGTATGacttaaagaaaacacatttaatgcagaTATACTCAGTTCTAATAACAAATGCATACAGCaagcacacttacacacacagtgaaaacAGTATTGCATTGAAATGACAAGATTGAAATGTGTACATTACTTTCTACATGAGTAAGACAGTCACAGACTTCAGACCTGGGTGGTAAGACTTGGAAAGACTTTGTgcttcagagggaacacatctgaccctctaaagaccaatattatactttTGAAAGTCCAGTTAAAAAGTGTACGTCTGAGTGCCAGAAAGTACTTATATCAGACCTTTATTTTTGTGTGCAACATATAGTGCTGTATGTCAAATTTGAAGTCAAATATAGTAATCCGATGCTTTTCAGAGAGgaactattatatatttatgaagTAAAATAGAGAATTCAGgagaaattattgtttttataaagcAATTTGGCAGATTAATACATTACATAAAATCACTGTACAACATGATGAGGGACATCATcacaacaaaacataaacagtGTATTTTGCATTTTGGAACAAGCTGACCAGCTCATTTACTGTAGCTGTAGCCTGGCGTGCTAGATTTGTCCACATCTGTAAAACGGTGTCgtttaaatgaacatttagCATCGTCTTGGCATCTAAATGGTGCTAAAACTGTGTGTGAAGTCATTGACAAAAACACCCTTACCTGCATTTTTCTAATTAAAGATTaataaatctttaataaatgCCATAGAACAGGAAAATGGATATTCTCTTTTAAAAGCAAAACCTATTTGACTTGTTTACTTGATACACAGAAGCCCACAAGTGAAAACACTATGCCATCCGTAACAAACTTTTTTAGCCTCTGAAGTGGCTGAAGAGCTAAAGCTCAACCTAGCAGACTTGCTACAATGGAGTCAGCTAGCTAACTGCAGCCTGTTCTAGGCTGTGGTAAGCTAGGCTATGCTAGGCTACACTAGGCTTCGCTACGCTATGCTTGTCCTAGTGACATAAACATATATAGACAAGCATAATTTCCTGGTTGTAAATATGCTTTGTTTAAATCATGTCATAAGCTTTCATTTTTTGGAAACCAAATAGTAACCAAGCTAAccatttttggttagtagaacattttctgaacattacatttaacattcttttttttttcttgctgttcCTATTTAGCATGTTTAAACAGCATTTTAGCTGGGAATGTTTTTGgcagaaacattctaataatattgtgatgcaaaccattattaacattatttctgtaacattataggctaaccttcctggaacttTTTCAAAACGctgctaaacattcttataacgTTCTTTAAAATTTCTCTGCTAGCTGGGAAGtcactaattactaattatgcattaaaaagagaatatttaataaagacattactttattttgcacacctatataataaaaaaatgctcttaaaagTGTAAATTGATGAATCTGTGCTGATCTAGTGTTTTGGATTGTATTGGATGTAGAAATATTAATGTACACATTTAAATCATCATTTCAGTGATTTTCAATATAATTTCAGTGCAATATAGGAtactcttaaacacacacacacacacacacacaacaacacacatacacacagactcCTTGCACTCTCCTCTGAGACTGTGGCACTTACTGAAGCGTCACTCTTGAACTATGCAGCACAAAGAGGTAGAAAGCAAGAGACAgaaggtgagagagaaagagagagatggacgaCGACtcgagaaagaaaagaaaatggaagCACAAGGAGGAGAGCAAACGCACACCCCCGTCCTCCCCTCCGCTTCCCTCCCCAGACTGTGGGTGGGGCCCCTGGGACCTCATTGACCCACTCACCACGTCTCTCCATTCCTTCAACGAGGGGTTAAATGGTAGGCCACGCCTCCTGGGACATTCATCTTTGGCTTGGCTGGCGAGCGGAGCCTCTGCCTGGGACCTCGTACGATTTTCTAAGACATTAATCGTAGgtttttattgtgtaatttaTTAGAGAACGTTAATATTAGAGACGTAGAGCTAATTTTCAGCGCGGCGAACGCAAACATCCCTTTACGCGAGGCCTCATCAACatgtgaacatgttttttttattattattattattattattattattatcttttgacatttgtttattttaatacgtGTCTATATGCCTTTTCGTCTTGTTTGGTTTTCATTTCCAGTTGACAGTTCTTAAATATGAACAAACATGTTATTGCTCCCCCAGAGAACCTGACCATAGCAGCTGCTGCTTTGCATCATGGGTAATCATCTCAGAGCTGCACTGAGTGCATGTGTAACGGATTGAGATGACAATTTGCAGCCAAATCAGCCCTCTATTGCGAACACCCAAACGCAaaggctcacacacacacacacattcactcaggCACAATCAGTGCTCCAATTTCTTCTGCATAGATTAGGTGATTTTGTGAGtcaggctctctctctcacacacacacacacacatacacagacgtacacacatatacacatagacacacaaagATGATTATGGCGGTAGTCACAATTTGACGTGGCCTTTCATGTCGCTGTCTTTTGCTCTCGCTATTGTCTCATTAAGGCCTCACAAAGGTCAGGCTGTCCGTCAAAATCTGTCTCTCATCCCGCCTTGATTAAGATCTAAACTCTCCCCATGTAATATGTGGGTgtgagagcatgtgtgtgtgtgtatatatgtgtgtgtacacgtgtgtgtgtgtgtttgtgacaaATAACCAGTCAAAGCCTGATCCCAAGACTTCATTCTCTTTTACATGCTCCATTCTGAGTCTATGTAGTTCAGCTGCGCCATCTACTGACCAGAAGCTGCATCACAGTCAAAGCTCCTAATTCAGCCTTCTGTTCCAAAGCTGTTTTTTAATGTGCCCTTGTCAACTTGCCCTtgccttctctttttttctctttttgaggAAATTCCCAAAGCTATCATTACTGTATTAGGATAACTGTATTAGCATAAGTGAGCTTGTTTTGTAGAGACATGAGGGAT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Function


symbol description
znf385c Predicted to enable nucleic acid binding activity and zinc ion binding activity. Located in nucleus. Is expressed in Purkinje cell. Orthologous to human ZNF385C (zinc finger protein 385C).

NR:

description
zinc finger protein 385C-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022672620.1 False 5349 mRNA 0.44 10 5539942 5686852

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103021541 slc25a17,LOC108412891,LOC107666095,LOC107548713,LOC107743042,LOC566378 other downstream 2777264 8464116 ~ 8485936 (+)

Expression



Co-expression Network