gtpbp1 (gtpbp1,LOC107582974)


Basic Information

Item Value
gene id gtpbp1
gene name gtpbp1,LOC107582974
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035898.1
NCBI id CM008301.1
chromosome length 34292151
location 554179 ~ 571578 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
gtpbp1 Predicted to enable translation elongation factor activity. Predicted to be involved in translational elongation. Is expressed in intermediate cell mass of mesoderm; intermediate mesoderm; lens; solid lens vesicle; and ventral mesoderm. Orthologous to human GTPBP1 (GTP binding protein 1).

NR:

description
PREDICTED: GTP-binding protein 1 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K24887 GTPBP1; GTP-binding protein 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022671653.1 False 4925 mRNA 0.42 12 554179 571578
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XM_022671660.1 True 4928 mRNA 0.42 13 554179 571578

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC111193015 NA coding upstream 4437 540319 ~ 549742 (+)
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carm1 carm1 other downstream 1478705 2050283 ~ 2080541 (+)
G7296 sept9,LOC108411966 other downstream 1959038 2530616 ~ 2558344 (+)

Expression


Co-expression Network