LOC103031044



Basic Information


Item Value
gene id LOC103031044
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035898.1
NCBI id CM008301.1
chromosome length 34292151
location 12451903 ~ 12463253 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>XM_022673764.1
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>XM_022673766.1
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
K11452 CBX4, PC2; E3 SUMO-protein ligase CBX4

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103046201 s1pr5a,LOC108432217,LOC107728470,LOC107658699,LOC107577264,LOC107758128,LOC107703889 coding upstream 701694 11744412 ~ 11750209 (+)
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G9918 NA non-coding upstream 103126 12344620 ~ 12348777 (+)
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G9868 tnpo2,LOC104950577,LOC103360699,LOC108432206 non-coding upstream 175091 12274840 ~ 12276812 (+)
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G10001 slc5a11,LOC107670676,LOC107728787 non-coding downstream 145712 12608965 ~ 12610876 (+)
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tbc1d16 tbc1d16,LOC107559246,LOC107689993,LOC107670685,LOC107562324,LOC107758097 other upstream 70555 12302527 ~ 12381348 (+)
luc7l3 luc7l3,LOC107674472,LOC107726809,LOC107654661 other upstream 1013571 11429073 ~ 11438332 (+)
LOC111193317 gas7,LOC108412615,LOC108260882,LOC107755169,LOC107555645,LOC105910950 other upstream 2422313 9979075 ~ 10029590 (+)
LOC103034760 LOC108412745,LOC108274115,LOC107724740,LOC107713951,LOC107584184,LOC103382335,LOC100706789,LOC102782950,LOC103361753 other upstream 2840091 9499833 ~ 9611812 (+)
bri3 bri3 other upstream 3520898 8919829 ~ 8931005 (+)
arhgap17 LOC108432202,LOC108279379 other downstream 64436 12527689 ~ 12600530 (+)
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Expression



Co-expression Network