dnajc24 (dnajc24)



Basic Information


Item Value
gene id dnajc24
gene name dnajc24
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035920.1
NCBI id CM008323.1
chromosome length 47266144
location 23938925 ~ 24020314 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU281753
aaaaaaaaacacactttggTATTCggctaaattaattaaaagacagaataatttatactgaGCAATGATTTATTTTGATGATGCAGTCAGATAACAACCATCATGGAGGCGGTCTTTATAACTGCAACAATGAAAAGAGAAACGGcgaaatgaatgaaaacctgcTAAACATATTCTGTCCTCTGCCTTcagccaaatgttttatttgttcagttttagttaaaaaaaatccttaattgCAACCTTACTTTATCCTGTTCAGATTTTTAGGTTGTCACAAATTTCCACTTTTTTTGATTTACTTTCTGTTTTTATGGCAGCATTCAGTGAAAGAAGTGAATCATTCAAATTGAAATGCCGTTATATGTCATAActataaaaatgaatttttgtgcgccaagtggtccagaggtctaaagtgctgccactatgataggGTGATTGCTGGGTGATTCGAAtcctagtcatgcagcttgccatcagctgccggagccctgagagagtacaaatggccttgctccctctgggcGGGTCGATGGTGCTCTTTTTCTATATCACTTCTTGGGTGATGTTAATCAGCAcaaaggcatctgtgagctcaTGTATCGGAACCGATAAAAAAGGTGAACTTTTCAGATGTgaccatttaaaaaagtaactatGTTTCCGGTGCATTTGAAGATCAGCCattgtttttcctcttttcaTAGAgcatattttgatatttatttgcaattttATGTACAGTGGTGTCAAATGGTGCAGCTTAAACTTGTATGATACTGTATTAtacaacattaaaaatgaaattccACGTTCATTTCTAATAATTGTTTCTTAAAAGTTGTGTACATTTCCTGTAATAAAAAGACAACAGcagacaaga
>XM_007228311.3
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>XR_002651784.1
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>XR_452611.3
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>XR_452612.3
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>XR_452613.3
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Function


symbol description
dnajc24 Predicted to enable ATPase activator activity and ferrous iron binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of ATPase activity. Orthologous to human DNAJC24 (DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24).

NR:

description
dnaJ homolog subfamily C member 24

GO: NA

KEGG:

id description
K17867 DPH4, DNAJC24; diphthamide biosynthesis protein 4

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU281753 False 886 lncRNA 0.35 1 23986094 23986979
XM_007228311.3 False 1208 mRNA 0.40 5 23986580 24020313
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XR_452612.3 False 730 misc_RNA 0.53 7 23938925 24020314
XR_452613.3 False 2460 misc_RNA 0.40 6 23983349 24020314

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
tcp11l1 tcp11l1 coding downstream 273045 23657234 ~ 23665880 (-)
LOC103046977 LOC108410746 coding downstream 283822 23612063 ~ 23655103 (-)
LOC103047696 kiaa1549l coding downstream 336580 23506008 ~ 23602345 (-)
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G207705 coq9,LOC107707431,LOC107099699,LOC107589199 non-coding upstream 497149 24517463 ~ 24520749 (-)
LOC103033401 spon1b,LOC108413171,LOC107701107,LOC108269023,LOC107745929,LOC107686649 other downstream 525971 23220469 ~ 23412954 (-)
LOC103035944 mical3 other downstream 982901 22885432 ~ 22956024 (-)
LOC103034681 LOC108436714 other downstream 1691812 21764104 ~ 22247113 (-)
LOC111195740 vma21,LOC108436707,LOC106604103 other downstream 1956195 21979799 ~ 21982730 (-)
LOC103039395 rps6ka6,rps6kal,LOC107572332,LOC107674878,LOC102207076 other downstream 3155941 20677453 ~ 20782984 (-)
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G207772 NA other upstream 927817 24948131 ~ 24948851 (-)
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G207903 NA other upstream 1296688 25317002 ~ 25352674 (-)
G207940 NA other upstream 1572317 25592631 ~ 25733304 (-)

Expression



Co-expression Network