LOC103023530 (LOC103023530,LOC108418701)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103023530
gene name LOC103023530,LOC108418701
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035920.1
NCBI id CM008323.1
chromosome length 47266144
location 39933116 ~ 39940055 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU286210
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>XM_007234329.3
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Function

NR:

description
palmitoyltransferase ZDHHC7-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU286210 True 3734 TUCP 0.40 6 39933138 39940047
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XM_007234330.3 False 2946 mRNA 0.41 8 39933116 39940055

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103024693 LOC103024693,LOC108418564 coding downstream 46279 39882684 ~ 39886837 (-)
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LOC103047731 abhd2,abhd2b,LOC108418794,LOC107753686,LOC107665722 coding upstream 82482 40022537 ~ 40034090 (-)
LOC103029855 NA coding upstream 136782 40076837 ~ 40097960 (-)
LOC103046604 LOC108418995,LOC108268792,LOC107753548,LOC107666287,LOC107716682 coding upstream 225445 40165500 ~ 40220734 (-)
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G210799 grxcr1,si:dkey-109l4.6,LOC102787492 non-coding downstream 119552 39813339 ~ 39813564 (-)
G210772 LOC108418277,LOC108268893 non-coding downstream 428710 39503698 ~ 39504406 (-)
G210764 scyl1,ganab,LOC107741476,LOC107756491,LOC107601512 non-coding downstream 432183 39463107 ~ 39500933 (-)
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bend4 bend4 other downstream 300940 39613715 ~ 39632176 (-)
LOC103035726 LOC103035726,LOC108416673,LOC108268898,LOC107730672,LOC107601515,LOC107550867,LOC107680594,LOC107756447 other downstream 392300 39527633 ~ 39540816 (-)
LOC103033395 arap3,LOC107563596,LOC107717393,LOC106939943 other downstream 2728731 37165034 ~ 37204385 (-)
c24h12orf73 NA other downstream 3122620 36809307 ~ 36810496 (-)
G210991 LOC103042126,LOC108416825 other upstream 421203 40361258 ~ 40363237 (-)
G210995 NA other upstream 432750 40372805 ~ 40378353 (-)
LOC103026726 cnot4,cnot4a,LOC107661486,LOC107753567,LOC107590814 other upstream 618629 40558684 ~ 40570148 (-)
LOC103035761 LOC108419823,LOC103035761,LOC105018411,LOC103373780,LOC104940444 other upstream 1219175 41159230 ~ 41219443 (-)
LOC103037199 tmem60,LOC108416913,LOC107661463,LOC107578479,LOC107753588,LOC107696252 other upstream 1366891 41306946 ~ 41310751 (-)

Expression


Co-expression Network