LOC111195849


Basic Information

Item Value
gene id LOC111195849
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035920.1
NCBI id CM008323.1
chromosome length 47266144
location 16026717 ~ 16027163 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_022684348.1
gatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022684348.1 True 447 mRNA 0.33 1 16026717 16027163

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
btk btk coding downstream 2053688 13941252 ~ 13973029 (-)
timm8a timm8a,LOC107593201,LOC107680336,LOC107742474 coding downstream 2095805 13928962 ~ 13930912 (-)
sil1 NA coding downstream 2128004 13889589 ~ 13898713 (-)
csnk1a1 csnk1a1,LOC106611977,LOC107554841,LOC107742481,LOC106604944,LOC107593197 coding downstream 2139631 13859221 ~ 13887086 (-)
hspa9 hspa9,LOC106604950,LOC106611979 coding downstream 2228084 13780145 ~ 13798633 (-)
LOC103026525 LOC108427881 coding upstream 17015 16044178 ~ 16142579 (-)
trnae-uuc_23 NA coding upstream 116125 16143288 ~ 16143359 (-)
cenpi cenpi coding upstream 468193 16495356 ~ 16521829 (-)
tmem35a tmem35a,tmem35,LOC107724834,LOC107688707 coding upstream 495923 16523086 ~ 16527085 (-)
arl13a arl13a coding upstream 508602 16535765 ~ 16545692 (-)
G205795 NA non-coding downstream 12034 16014229 ~ 16014683 (-)
G205778 NA non-coding downstream 88422 15832297 ~ 15938295 (-)
G205782 NA non-coding downstream 144661 15881671 ~ 15882056 (-)
G205667 NA non-coding downstream 226443 15799803 ~ 15800274 (-)
G205663 NA non-coding downstream 297750 15727851 ~ 15728967 (-)
G205799 NA non-coding upstream 26873 16054036 ~ 16091671 (-)
G205800 NA non-coding upstream 38421 16065584 ~ 16066716 (-)
G205812 NA non-coding upstream 168943 16196106 ~ 16200003 (-)
G205814 NA non-coding upstream 316078 16343241 ~ 16347559 (-)
G205859 NA non-coding upstream 373915 16401078 ~ 16403080 (-)
G205670 NA other downstream 194623 15831650 ~ 15832094 (-)
pcdh19 pcdh19,LOC107680972,LOC107740148,LOC107688683 other downstream 459082 15407944 ~ 15567635 (-)
G205640 NA other downstream 481095 15543917 ~ 15545622 (-)
LOC103033354 hnrnpa0b,LOC108269291,LOC107742478,LOC107680980,LOC107740136,LOC108427887,LOC107593198,LOC107554842,LOC107680347 other downstream 1976155 13942723 ~ 14050562 (-)
LOC103035169 LOC108427892,LOC107740141,LOC107554835,LOC107593202,LOC108268827 other downstream 2048267 13974677 ~ 13978450 (-)
drp2 drp2,LOC107724836,LOC107593231 other upstream 176774 16203937 ~ 16365647 (-)
LOC103041988 rnf145,rnf145a,LOC107664350,LOC107669103,LOC107723822,LOC107740095 other upstream 1232623 17259786 ~ 17300993 (-)
LOC103033759 NA other upstream 1816803 17843966 ~ 17852191 (-)
LOC111195732 NA other upstream 2012512 18039675 ~ 18041939 (-)
G206575 NA other upstream 2811206 18838369 ~ 18838916 (-)

Expression


Co-expression Network