hectd2 (hectd2,LOC107584154,LOC107594154,LOC107758436,LOC107753452)


Basic Information

Item Value
gene id hectd2
gene name hectd2,LOC107584154,LOC107594154,LOC107758436,LOC107753452
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035900.1
NCBI id CM008303.1
chromosome length 25652880
location 181069 ~ 231917 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU44588
GCTTCTATACAGCATTTTGATTGGCTGcataatttttatataaatgttgttaattattttttttttctttaagagtaAATGGGAGTAAAAGTGTATGCCCATCTACTGTGCTTCTGCTTAACTGATACGCGCCATTTAGGACATACTTTCTCAGGGCAGGCCTCCGAGAAGACAATTAATATCATTTTGACCCACATTATTCATTCCTTTTCATTTTCGTCCTAGAGTTTCATTTGCTTGACATCCACCAAATTGCATGCACTCCTTCAGGGCAGGCCTCTGACATCTAATGCACAGTTATACTGACTTGAAAttatctttttgttgttttttcatcgctcattccttttttttgacaccttttaattttctcaaacaCAAAAGCCATAGAGTTCCTGTCTCCTGAGAGTTTACAAACTTCTTGCACTcaccttttgtttttttcttccctcgTTCCTttcatttactttcatttttgttCTATGTTCCTGCCTGGGTCAAtgtttaatgatattaaatCAGATGAGCTGGAGGGCTTTGGGCAACCAGGAGAAATctaaaaacaagtttttttttttgttctcttttcctcttttttattagtttttttaaataatgtgcttATGTGTCTAAAACCTCTGCAGAgtactatatgtatatattttctgtattttattttaacactcaTGTGACACCCATGCCAAGAGAAAGTCCTTGTTTGCTCTGTTCTTGGTGAATGACAAGATTCTGATTGAGGTACAGTAGCTAAAGAAAGCACATTAGGCAACATGAATTCCGCACTGTAGCTAGATTTGAAGTTTAACTAGAATTTAGCCGTTCCATATGactgtggtgtggtgtggtgtggtgtggtgtggtgtgatgtggtgtgtgtatgtatgcatgtatgtgcGTGTTAATAGTTGCGGTTTGTATTTGTAATGAACCAGGATTCCAGGAAGAATCTAGTTAAAGTGTACCGGGTTGCAGGTGTTTGGACTCAGGATATCGTCATcattaagacaaaaaaaaaccttgtatcaaaatcagatgatgatgatgattggaCCAGTAGATGGGCTCAGTTTTGGTCCATTTTACTTGGAGTAAACTTGgagtaaaatcttttttaaaaaactgattcCCATTGAGAGTTAAAGTTTTCTCCTTCTCCTCTAAAGTTGCAATTATgcagatacaaggtttttgtccATTACTGAAGACATATTGGTTTGCCTTATGTACATTAACATACATCTAGGACCAAACCTAGATATgttgcattaaaatattttattgtgttgtgttttgtatgAATGACAGAATATCAGCATTCGATATGTTCAGGACTTCAGTATAGTGAAAGTTTATTTGTGGAGAACTATTTAAACGGTTAGCGCTACTAAAGATTGACAGCTTTGATTTTGCTTGGCTAGCAGGGGGTTGGAGTCTAATGCAATCCCACAGTCCGGCAGTGGAGAGGCTGAAAATAGGCCAGAGAGAGGCTTGGTCTGTGTGAAAATAGCTTTGCTAACAGTCTGTCACTAGCGCTAGTGCTGCTCTGCTCTAAGTgcttaaagtgacagtgttcCGACTCCTTGGTTACAGGCTACAAAGCCTCTTTGTTAGAGTGTAATTGATTCCTGAGATTCTCCACTGTTTGGGAGGTTAAGCCTGTTAAAAATTCTAAAGTTAAAAAGCTGAAACTGTTCTTTGTGCTCAGAAACGGATTTGTTCTGTATATAATTCTGAAAAGTCTTGACGACCCTTTTGTAACCTCTTTGAAGGGAAAGGAACAATGCTAACATGTCTTTTGACTTTTGTGTCGGTTAAAGTGATCCTTGTGATGACTAGCTATAGTGAGTGATGATAGCTTGTATCTCTGTGGtagatattgtgtgtgtgtgttagtactCCCCTTTACTCCTAAAAATAATGGTGCTACAAAGGGTTCTTTAAAATGACAGTCCAGAAGTTTTTTTGCAAGTATGTGTATTGCACTAAGCAAAGCAGAAGAGTACTTTGAAAACATGCATAGTGGTTCAGTATCATTTCAGAGTAGATGAATCAGGTGGGATTCTGCATTCTAGATTCTGTcctgctttcttttattttgccaGTTTGaattctgtgtttgtttagtaTAACAGTGTATGAATAAGCAGGTGAAGGTTAAGTTTGCTGCAGCGCAAAAAAATCAAAAGCTTTCAGAAAGACATGGAAATAATAACTCACAGGAAAACCTACCAGAcccctgtgtgtttttttttttttttttttttagaattaatagaTTGTGACCTTGCAGAAATGTCTACAATAATGCTATTTATGAAAATGTTCTGTCCCCTATCCACTCAGGAAGATTACTGCTTTCAGTTTTAAAGAAGAACATCTTATAGACTTTAACCAAAGCTGTAGAACAGTGGTTCTACGGTGTCTGTAATGTTGTATAAAATACAGGAGAAAACTTTATAGATCAGTCATTTATAATATTCTGCATGCagcaatttagttttttttatgttatatttgttGTACCACTTTGGGatgctttgaatttgatattaGCACATTAACTGTCACATGATATCaaaagagtaaataagtgacACTGTTTTGCTGCCATTACTAAATACCAGTAAATTAATTTTCTGTCCAGTCAGAAAAACAAATGGCTCTTTCTTTAAACCAATTTCTATAATACAGTGGTGCAACATACTGATGccactgtattaaaaataaaaggaaaaatCTGAAATTTGCTGGTGGATAACTAATAATGAATTCTTAAATGTGATGCAGAGGACTTATTTATTCCTGTTCAGATGTTGGACCCCTGTTCTACAGCACTGATCAAAGAACCCTTGTAGAACTATTATTTTGAAGAGATTTGGGTACAGATTGGACGCTGAGGTTTGTGACATCAAACGATGTGgagattaatttattttacaactGTCTGTCTTAAAAACAGATTGGATGAGTACAGTTCTAGAAAATGAGAATCAAAGCTCTGCTGGTAGCTCTTTGATTGAATGGTCAGAAAGATCTGAGTGATCTTGCTAATAGAATAGCTCTTTCTTGCCTTGTCTTTGTAAATGGCTGAACTCTGGTAATGTTATACgaactgttctttttttctttttctttttttcgtcTCTTGTCATCAGCCACAATCTTGCAACTGTTCACTTTATTGCTTCATGTCTTGTATGACTGAATACAAAtgtatttac
>XM_022668844.1
CCCACACTGTTAGAAGCAGCCCAGAAGCCCCATCCTCTTAAACCAATATGGCGCCAGCGTACAGCTGCtccactctctcttctctcactcgcAGGGCAGCGCTTCACTAAACCGCTGAAGTGAGGGGAAATTTCGCCTGCCTCCACCTCGCTGCTTCTCTCCTCGTTTACTTTTCCTTCTCCGAATTTAAGTTCCGTCTCTAGATATCTAAAAATATCTCAGTTTTTCTTGTGTAAACTGCAGAAACTCACCTGCTgatccagactctgctccctctgTTTACTGcgctgctgagagagagagagagtgtgagggcGCTTCTCACAAAACTGAAGAAACTGAAGACCGAGCTTTCAGCTGGACATTATTAACTCTACTAACACCTTTAACACGGAGTTTTCCCTCAAACAACCCGCCGAGCCATGTGAAGGagtgagtttactgagtttactgagtttgggaacagaagaagagaagaggtctTCTCCCTCACAGCCAGGAGGACATGCGTCTGAAGATGAGTGAGAACAACTATCAGCTtgaagagagggacagagacagGCTTCCTCCCATCATAAACCATAGTTTGGACCGTGGACCAAAACTGCCCTTCTCCTCATACGGAAGCTTCATCTCAACCCTGAACCACAAGAGAGATTCAGGCAGTCACAGCTTCTCCACTCATCTCCTCTTACCTGCAGTCAGACAAGtcagaGAACTTCCCCCGATCTGTCCAGATGTTCGACAGAAGCAGCGAATCTCCATTGACGTTTTGCCTCCGGAGGTTAAGGCTCGCTTTGCCTCAGATCCCATCATCCCCATCCGCACCAAAACCGCCAAAGAGTTTCAGGAAGATGTTGAAAAGGCAACTATCTCAGGTGATTGGAAGCAAGTCCATGATTTCTACTTGACCACATTCGACTCCTTCTTGGAACTCAATGCTGCCTTTAAGAAAGAAGCAAACGCTCCATTTAATACTATTGAAGACTCAGGAATAAACACCAAATTTGTAAATGCTGTTTATGACGCCTTACTTCACACGCCCCCAGACACCCAGAAATCAGTCCTGAAGGGAATCATTAATAGCTTATTAAGGGAATGGAAAGGGCCACGGACAAAAGACGACCTGAGGGCATATTTCATTCTAGTTCAGAACCCTCAGTACACCAGCACGGCCACATATGTCATCTATGCACACTTACTGAGGCAGATCGCGGCGCTGGCTGAAGCAGACCACCATTTCCTGATGCACTGGTTTAAGAAACTATCTCAGAAGCGGTTCAAGCAGCTGGTGGAACGCCTACAGCTCTTCATCACCACACGGCTGTTCCCTGCCAAACCAGAGGAGCTGCCGCCCATGGCCAAGTGCTCATGGTGGATCCCGTCTGCCACTAAAGTTCTCTCGCTCCTCAatGCTGCAAACAGCATTTCTTCTCCTCCCATCATTCCTTTCTCCGATTTTTATAATCTCACAGTGGACCACATTGACTTCATGGAAGACTACCAGACGTGGCAAGCGCATGGAAATTCCAACAGGTTTACCTTCTGCCAATTTCCCTTTATTCTGTCCACGGTGGTGAAGAAGGCCATCATCCAGCGAGACTCAGAgcagcagatgatcagcatggCCAGGCAAACCCTGGTGGACAAGGTCTCTCGCAGACAGAGGGTGGATATGAGTCTGCTCTTTCTCAACATTAAAGTGAGGCGTCTGCAGCTGGTCAGTGACTCACTGGATGAGctttcgagaaagagagcagacctaaagaaaaagttaaaagtGACGTTTGTTGGGGAAGCAGGCTTGGACATGGGCGGACTCACAAAGGAGTGGTTTCTTCTCCTGATTCGACAGATTTTTCACACTGACTACGGCATGTTCACATATGTAAAGGACTCCCAGTGTCACTGGTTCAGCAGCTGGAAATGTGACAACTGCTCAGAGTTTCGTCTGGTTGGAGCTCTGATGGGTCTGGCCGTGTATAACAGCATCACCCTGGACATCCGATTCCCACCCTGCGTTTACAAGAAGCTGCTGACCCCTCCCATCATACCGTGTGACCCTGACGCCCCTGTCGGCATGGCGACCCTCACCCTGGACGATCTGCAGCAGATCATGCCTGATCTCGCTCATGGCCTTGGGGAGCTACTCAGTTATGAGGGAAACGTTGAAGAGGACTTCTATACAACCTTTCAGGTTTTCCAGGAAGAACTTGGAGTAGTCAAGTCATATAACCTGAAACCAGGGGGGGATAAGATTCCGGTCACAAACCAGAACAGAAGAGAATATGTCCAGCTGTACATTGATTTCCTGCTGAATAAGTCCATCTACAGGCAGTTTGCAGCCTTCTATCATGGCTTTCATAGCGTGTGTGCCTCCAATGCCCTGATGTTGTTGAGGCCGGAGGAGGTTGAGATCCTGGTCTGTGGGAATCCCAATCTGGACATGAGCTCTCTGCAGAGGGTGGCGCAGTACGAGGGCTACAGCAAGACAGATCCAACCATCCGtgcattctgggatgTAGTCCTGGGCTTTCCTCTGGAGCTGCAGAAGAGGATGCTCCACTTCACCACAGGAAGTGACCGTGTTCCAGTGGGAGGGATGGCTGACCTCAACTTCAAAATCTCCAAGATTGACGTTTCCACGGACTGGTTGCCTGTGTCGCATACGTGCTTTAACCAGATCTGCCTACCTCCATACAAGAGCAAGAAAGAACTGAGGCAAAAGCTGACCATCGCCATTTCTAACGCTGAGGGCTTCGGCTTGGAGTAACGTGTGATGACACCATGGAGGAGGACAGGCCAGGGTGTCATCATTTGTGTCATTCCGTTGAATCAGAATCTTTCTAGCTACCAAGTGCCGGTACAGGGGTGTGTCAGGAACTTCTGCTGGTGTGGGTGTCAATAATGTACcattaacacattaaataaaaaaatacataaaataacatgGATGTAGCTATTTAAACTGCAGTGGTATCTTGACAAAAGTGGCAAGTAAAATCATACTAGGATTAGTCTTGcgtaatctattttttttgttgttgtttcaagatgttgtaattttattattataattataatctatttatagagattttatgtatgttttattccATGGGCAGATTGTttcaagcaacaaaaaaaaactaacttttaaaCCTAAAGCAATTAATCTCAACATATTCCTACATCAAGCTCAAAATTAAATCTTTAATAATTTGACtactacagtgtaaaaaaaaataaaataaaaaaaaaaaagttacatgcCATAATTAAACCTACAGTAtatgaacattttcaaaaaCTTATTACCAACAAGCAGGTGGAATTGTATTAGCATTGACTGGTGCAGATTTTATAGCCACAGAAGCtatttaataagtaaataagccTTTTCAAATGTTTATATAGGTTATATAGGTTTATGGAAGCTTATGCACAGTGTTGCATATCCTTAGAAATGCTGCCCATCAGTAAAGTTTTATTCATAATTATGGTTGCTTTAGTGATATGAGCTTCTATACAGCATTTTGATTGGCTGcataatttttatataaatgttgttaattattttttttttctttaagagtaAATGGGAGTAAAAGTGTATGCCCATCTACTGTGCTTCTGCTTAACTGATACGCGCCATTTAGGACATACTTTCTCAGGGCAGGCCTCCGAGAAGACAATTAATATCATTTTGACCCACATTATTCATTCCTTTTCATTTTCGTCCTAGAGTTTCATTTGCTTGACATCCACCAAATTGCATGCACTCCTTCAGGGCAGGCCTCTGACATCTAATGCACAGTTATACTGACTTGAAAttatctttttgttgttttttcatcgctcattccttttttttgacaccttttaattttctcaaacaCAAAAGCCATAGAGTTCCTGTCTCCTGAGAGTTTACAAACTTCTTGCACTcaccttttgtttttttcttccctcgTTCCTttcatttactttcatttttgttCTATGTTCCTGCCTGGGTCAAtgtttaatgatattaaatCAGATGAGCTGGAGGGCTTTGGGCAACCAGGAGAAATctaaaaacaagtttttttttttgttctcttttcctcttttttattagtttttttaaataatgtgcttATGTGTCTAAAACCTCTGCAGAgtactatatgtatatattttctgtattttattttaacactcaTGTGACACCCATGCCAAGAGAAAGTCCTTGTTTGCTCTGTTCTTGGTGAATGACAAGATTCTGATTGAGGTACAGTAGCTAAAGAAAGCACATTAGGCAACATGAATTCCGCACTGTAGCTAGATTTGAAGTTTAACTAGAATTTAGCCGTTCCATATGactgtggtgtggtgtggtgtggtgtggtgtggtgtgatgtggtgtgtgtatgtatgcatgtatgtgcGTGTTAATAGTTGCGGTTTGTATTTGTAATGAACCAGGATTCCAGGAAGAATCTAGTTAAAGTGTACCGGGTTGCAGGTGTTTGGACTCAGGATATCGTCATcattaagacaaaaaaaaaccttgtatcaaaatcagatgatgatgatgattggaCCAGTAGATGGGCTCAGTTTTGGTCCATTTTACTTGGAGTAAACTTGgagtaaaatcttttttaaaaaactgattcCCATTGAGAGTTAAAGTTTTCTCCTTCTCCTCTAAAGTTGCAATTATgcagatacaaggtttttgtccATTACTGAAGACATATTGGTTTGCCTTATGTACATTAACATACATCTAGGACCAAACCTAGATATgttgcattaaaatattttattgtgttgtgttttgtatgAATGACAGAATATCAGCATTCGATATGTTCAGGACTTCAGTATAGTGAAAGTTTATTTGTGGAGAACTATTTAAACGGTTAGCGCTACTAAAGATTGACAGCTTTGATTTTGCTTGGCTAGCAGGGGGTTGGAGTCTAATGCAATCCCACAGTCCGGCAGTGGAGAGGCTGAAAATAGGCCAGAGAGAGGCTTGGTCTGTGTGAAAATAGCTTTGCTAACAGTCTGTCACTAGCGCTAGTGCTGCTCTGCTCTAAGTgcttaaagtgacagtgttcCGACTCCTTGGTTACAGGCTACAAAGCCTCTTTGTTAGAGTGTAATTGATTCCTGAGATTCTCCACTGTTTGGGAGGTTAAGCCTGTTAAAAATTCTAAAGTTAAAAAGCTGAAACTGTTCTTTGTGCTCAGAAACGGATTTGTTCTGTATATAATTCTGAAAAGTCTTGACGACCCTTTTGTAACCTCTTTGAAGGGAAAGGAACAATGCTAACATGTCTTTTGACTTTTGTGTCGGTTAAAGTGATCCTTGTGATGACTAGCTATAGTGAGTGATGATAGCTTGTATCTCTGTGGtagatattgtgtgtgtgtgttagtactCCCCTTTACTCCTAAAAATAATGGTGCTACAAAGGGTTCTTTAAAATGACAGTCCAGAAGTTTTTTTGCAAGTATGTGTATTGCACTAAGCAAAGCAGAAGAGTACTTTGAAAACATGCATAGTGGTTCAGTATCATTTCAGAGTAGATGAATCAGGTGGGATTCTGCATTCTAGATTCTGTcctgctttcttttattttgccaGTTTGaattctgtgtttgtttagtaTAACAGTGTATGAATAAGCAGGTGAAGGTTAAGTTTGCTGCAGCGCAAAAAAATCAAAAGCTTTCAGAAAGACATGGAAATAATAACTCACAGGAAAACCTACCAGAcccctgtgtgtttttttttttttttttt

Function

symbol description
hectd2 Predicted to enable ubiquitin-protein transferase activity. Orthologous to human HECTD2 (HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2).

NR:

description
PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2

GO: NA

KEGG:

id description
K12232 HECTD2; E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU44588 False 3239 lncRNA 0.37 2 226800 231917
XM_022668844.1 True 5799 mRNA 0.42 21 181069 229078

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
htr7 htr7,LOC107758424,LOC107669182,LOC107594208,LOC107584235,LOC107753458,LOC107683721 coding upstream 133506 42719 ~ 47563 (+)
LOC103045384 si:dkey-100n10.2,LOC108424892,LOC107758432,LOC107584158,LOC107661094,LOC108273498,LOC107727700 coding downstream 225254 457171 ~ 483231 (+)
acbd4 LOC107662569 coding downstream 503911 735828 ~ 745143 (+)
LOC103047415 LOC103469343 coding downstream 520671 752588 ~ 754996 (+)
LOC103022594 LOC108424886 coding downstream 606388 838305 ~ 850262 (+)
trnac-gca_9 NA coding downstream 649450 881367 ~ 881438 (+)
G33160 NA non-coding upstream 122881 57629 ~ 58188 (+)
G33147 NA non-coding upstream 142053 38493 ~ 39016 (+)
G33141 NA non-coding upstream 157207 21445 ~ 23862 (+)
G33211 NA non-coding downstream 38733 270650 ~ 306318 (+)
G33206 NA non-coding downstream 56115 288032 ~ 324053 (+)
G33231 NA non-coding downstream 129510 361427 ~ 362460 (+)
G33235 NA non-coding downstream 137748 369665 ~ 372776 (+)
G33246 NA non-coding downstream 164194 396111 ~ 401312 (+)
LOC103039306 pcgf5,LOC108410714,LOC106589380 other upstream 14679 128356 ~ 166390 (+)
rpp30 rpp30 other upstream 80018 96303 ~ 101051 (+)
LOC111192417 NA other downstream 187093 419010 ~ 424471 (+)
LOC103023950 LOC103023950,LOC108424882,LOC108273447,LOC103382057,LOC106536190 other downstream 751250 983167 ~ 985381 (+)
trnal-aag NA other downstream 760395 992312 ~ 992518 (+)
LOC111192342 dnah9 other downstream 1137256 1369173 ~ 1388019 (+)
amz2 amz2 other downstream 1818825 2050742 ~ 2056963 (+)

Expression


Co-expression Network