amz2 (amz2)


Basic Information

Item Value
gene id amz2
gene name amz2
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035900.1
NCBI id CM008303.1
chromosome length 25652880
location 2050742 ~ 2056963 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU45414
GGTGTTACAGGCGGAGGGACGGGTTTGAGCGCTTTCTGTGTGTTAAGATCTGTCCGCGGATCAGATTACCGTACACTGACAGATCATAAacctgctactgctgctgcaggtgGATATAGAGGCTGTGAGGTTTGTGAGAAATTGTGAGATATAGCTGTATATAAGTGGGGCAGGATTACTCCAGCGGAGCTGCTGTTATgatgtagtttataaaatataaacagaagCTTTTCCGGGCTGATCTCTGAACTGCTGCATTTACCGGAAACGAGGCTTCGCTTCTGCAACAAATTTCACATCTATCTAAGAAGATGAGCCCGGATAATGCTGAAGATCTCTTCTGCTTGTGATGGAGGTGATCGAGCATCCTGTGGAGAAACTGCGCTCGGCTCTCCGCTCCACCCGTAATGACCTGATCCAAACCTATGGGCAGTACAGCCGAGAGGAGCGGAGATTACTGGAGGAGGGTCTTCTTCCCGGCAGCCCACTGTTCAGTCCCATTACAGTTCACTCTGATTCAGACTGGATTCCTTCACACCCTGAATCACCTCAGGACTTTCAGAGCTTCTACAGCAACCCGTACCGCAGCACGCCAAACAACGGCCATAAGACCATTTACATACAGACAATAGGTCAGACTGACAACCAATTTCTGTACTGATAACTGTTCTTTAACAAGAACCCATGTGAATTGGGGAAAGcttcatagaataaaaaaattttaCACCAGCGCAATGTTTAAGTTTGATGGTCTTTATTTGTAGAATATTAGagcatattgtaaaaaaatatatatacatatcttGGTTTTCAAATACAATTCAGTTTTGTTGTGCTTACATAACCACTGTTAACAAGActgttgtatttatatataaaaaaaatcacccttTCAAACTATTGGttcttttacatttgttttttttttgtccgcAGGCTCTTTTGGAGATGGAGCTGGGATCTCTGAGCAGTATGTGGAGTGGCTGAGGGCCTATTGCCAGGCGTTCTACTATGGCCTGAAGGTTAAGCTCCTTCCGCCGGTGACAGTGGCTTCTACAGGCTGTTCCTTCCGTGTCAACAACAATACACACAACCTTCAGCTTCACGCCGGAGAACTGCTTTCATTTCTGAAAAAGAAGAAGCCCAGAGATGCATTTTGCATTGTGGGAATCACAATGATTGATCTGTAcccaaaagactcttggaattTTGTTTTTGGACAAGCTTCCCTCACTGAAGGAATGGGTGTTTTCAGCTTTGCCCGATATGATGATGACTTCTACAAAAGGAGTTATGCAGGACGGCTGAAGAAAGCAATAAAGCTGAAGCCTGGAGACTACAGTGTATTTCAAGGCTACTACACTCCTCCAATCACCAGCACTTTGCTCTTCCGCTCATACACTGACTCATGAGATTGGACACATATTTGGTGTCAAGCACTGCCTGTGGCTCCAGTGTGTTATGCAGGGCTCCAACCATTTAGAGGAATCGGACCGCCGGCCACCAGACGTCTGTCCCATCTGCCTGAGAAAGCTACAGTCCGCCATTGGCTTTAAGATAGCCGACAGGTACAAGGCTTTACTACTCTGGATCGAGGAAGCACCAAGCAGTTCTGCACAGCATTTGAGTAAACCCACTGAAGCTTTCCAAGACTTCAGGCACTGGTTAAGTAAGTGTCTGAGTATACTGGAAGatgaaatattttaattctGCCACATTTTAACAAAGATGATAATTGGAAGGTAATTATTTGATATCCAGAGGATCTGCTTTGTTtgcctttctttttttgcaCCTTGAATGTACAAACTATTTATGCTATggctttaaaacaaaatacattgttgtaaaaatgaacaaaaaacattGTACTGAAAATgacttaagttattttattttagataaaaatgattgtgtgtgtaaaaaaaagtgattgctCTTACAgacaaaatcacaaaaaaagtttgtttctaTACATACAAAATTCAAGTCAAATAATAATGCCCAGAATAATATGAGAATTATAAAAATGAGAATTAACCTGCTGAAAATGTTGACCTTCACTTCACAGttattgtaaatgctttaaCTTAGACTGACCATCTCATTCTTTTGATTACATTCTGGTAAGTTTTTCATTCACATTCTGACACTTAATATGTAAAGAAATATTCACAGTATATTGACATTTTCACAGTATGTTCCACTGATTTGTCATACAGTATATTCTGCATAATTTAATACTTAATATGCAAATTCACTCACTGACACTCGTGATTTTCTGTACAGTAATAGGAACACATGATCCTTAAGGTAAAATGCCTTCTTAAAGCTTCTCCACTTTCCTAAAGTTTCCTAAAGCCTGAGACATTATTTTATGATAACGTTTGTCTAAAGCACATTCTTAAAATCTCTTTACACtaaaacattatataattttaatatcatatcatataatgCCTTACATTGAGAATTTCTCAACATGAAAGCACTTTCATGCGTTTACCAATATGATGATTTAAAGATTTACAAGCAGTAAATAAATAGTCAGTGTcttgaaaacaataaaattaaaataattggtCCAAAATGTTTACATAAAATGAATGCTGCATTGTATATCAAGCTGGTTTTCATTGTTAAATTTTC
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ttgaaaaaaaaaaaaaaaaatcgttatCAGCCATAAAGCGCCGGACAGTACTTAGTGGTGTTACAGGCGGAGGGACGGGTTTGAGCGCTTTCTGTGTGTTAAGATCTGTCCGCGGATCAGATTACCGTACACTGACAGATCATAAacctgctactgctgctgcaggtgGATATAGAGGCTGTGAGGTTTGTGAGAAATTGTGAGATATAGCTGTATATAAGTGGGGCAGGATTACTCCAGCGGAGCTGCTGTTATgatgtagtttataaaatataaacagaagCTTTTCCGGGCTGATCTCTGAACTGCTGCATTTACCGGAAACGAGGCTTCGCTTCTGCAACAAATTTCACATCTATCTAAGAAGATGAGCCCGGATAATGCTGAAGATCTCTTCTGCTTGTGGTGAGGAGAGATGGAGGTGATCGAGCATCCTGTGGAGAAACTGCGCTCGGCTCTCCGCTCCACCCGTAATGACCTGATCCAAACCTATGGGCAGTACAGCCGAGAGGAGCGGAGATTACTGGAGGAGGGTCTTCTTCCCGGCAGCCCACTGTTCAGTCCCATTACAGTTCACTCTGATTCAGACTGGATTCCTTCACACCCTGAATCACCTCAGGACTTTCAGAGCTTCTACAGCAACCCGTACCGCAGCACGCCAAACAACGGCCATAAGACCATTTACATACAGACAATAGGCTCTTTTGGAGATGGAGCTGGGATCTCTGAGCAGTATGTGGAGTGGCTGAGGGCCTATTGCCAGGCGTTCTACTATGGCCTGAAGGTTAAGCTCCTTCCGCCGGTGACAGTGGCTTCTACAGGCTGTTCCTTCCGTGTCAACAACAATACACACAACCTTCAGCTTCACGCCGGAGAACTGCTTTCATTTCTGAAAAAGAAGAAGCCCAGAGATGCATTTTGCATTGTGGGAATCACAATGATTGATCTGTAcccaaaagactcttggaattTTGTTTTTGGACAAGCTTCCCTCACTGAAGGAATGGGTGTTTTCAGCTTTGCCCGATATGATGATGACTTCTACAAAAGGAGTTATGCAGGACGGCTGAAGAAAGCAATAAAGCTGAAGCCTGGAGACTACAGTGTATTTCAAGGCTACTACACTCCTCCAATCACCAGCACTTTGCTCTTCCGCTCATGTAAGACACTGACTCATGAGATTGGACACATATTTGGTGTCAAGCACTGCCTGTGGCTCCAGTGTGTTATGCAGGGCTCCAACCATTTAGAGGAATCGGACCGCCGGCCACCAGACGTCTGTCCCATCTGCCTGAGAAAGCTACAGTCCGCCATTGGCTTTAAGATAGCCGACAGGTACAAGGCTTTACTACTCTGGATCGAGGAAGCACCAAGCAGTTCTGCACAGCATTTGAGTAAACCCACTGAAGCTTTCCAAGACTTCAGGCACTGGTTAAGTAAGTGTCTGAGTATACTGGAAGatgaaatattttaattctGCCACATTTTAACAAAGATGATAATTGGAAGGTAATTATTTGATATCCAGAGGATCTGCTTTGTTtgcctttctttttttgcaCCTTGAATGTACAAACTATTTATGCTATggctttaaaacaaaatacattgttgtaaaaatgaacaaaaaacattGTACTGAAAATgacttaagttattttattttagataaaaatgattgtgtgtgtaaaaaaaagtgattgctCTTACAgacaaaatcacaaaaaaagtttgtttctaTACATACAAAATTCAAGTCAAATAATAATGCCCAGAATAATATGAGAATTATAAAAATGAGAATTAACCTGCTGAAAATGTTGACCTTCACTTCACAGttattgtaaatgctttaaCTTAGACTGACCATCTCATTCTTTTGATTACATTCTGGTAAGTTTTTCATTCACATTCTGACACTTAATATGTAAAGAAATATTCACAGTATATTGACATTTTCACAGTATGTTCCACTGATTTGTCATACAGTATATTCTGCATAATTTAATACTTAATATGCAAATTCACTCACTGACACTCGTGATTTTCTGTACAGTAATAGGAACACATGATCCTTAAGGTAAAATGCCTTCTTAAAGCTTCTCCACTTTCCTAAAGTTTCCTAAAGCCTGAGACATTATTTTATGATAACGTTTGTCTAAAGCACATTCTTAAAATCTCTTTACACtaaaacattatataattttaatatcatatcatataatgCCTTACATTGAGAATTTCTCAACATGAAAGCACTTTCATGCGTTTACCAATATGATGATTTAAAGATTTACAAGCAGTAAATAAATAGTCAGTGTcttgaaaacaataaaattaaaataattggtCCAAAATGTTTACATAAAATGAATGCTGCATTGTATATCAAGCTGGTTTTCATTGTTAAATTTTCTTAGCAGTAAATTAATCACTAAACCGTTTACGAAACATTCTTTATGTACATTTATCtgaagtataaaataaaaatccagtgatttaaaa
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Function

symbol description
amz2 Predicted to enable metal ion binding activity and metallopeptidase activity. Predicted to be involved in proteolysis.

NR:

description
PREDICTED: archaemetzincin-2 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU45414 True 2649 TUCP 0.51 6 2050798 2056874
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XM_007259098.3 False 2251 mRNA 0.39 7 2050766 2056963

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103044365 LOC108273944,LOC108413510 coding upstream 182091 1846203 ~ 1868651 (+)
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G33611 map2k4,LOC108424869,LOC108274195,LOC103366173,LOC107719678,LOC107556463 non-coding upstream 314765 1732926 ~ 1735977 (+)
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G33791 chmp2a,bc2,LOC107552765,LOC107727322,LOC107582752,LOC106589279 non-coding downstream 73711 2130674 ~ 2134078 (+)
LOC111192342 dnah9 other upstream 662723 1369173 ~ 1388019 (+)
trnal-aag NA other upstream 1058224 992312 ~ 992518 (+)
LOC103023950 LOC103023950,LOC108424882,LOC108273447,LOC103382057,LOC106536190 other upstream 1065361 983167 ~ 985381 (+)
LOC111192417 NA other upstream 1626271 419010 ~ 424471 (+)
hectd2 hectd2,LOC107584154,LOC107594154,LOC107758436,LOC107753452 other upstream 1818825 181069 ~ 231917 (+)
tbkbp1 tbkbp1,LOC107565677,LOC107754096,LOC107677885,LOC107743771 other downstream 1507067 3564030 ~ 3659132 (+)
G34309 NA other downstream 2114088 4171051 ~ 4178083 (+)
LOC103025551 sema4g other downstream 2825593 4882556 ~ 4924766 (+)
dnmbp dnmbp,LOC107722208,LOC107684043 other downstream 3635559 5692522 ~ 5756116 (+)
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Expression


Co-expression Network