LOC103023976 (snx11,LOC103023976,LOC108444262,LOC105888804)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103023976
gene name snx11,LOC103023976,LOC108444262,LOC105888804
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035900.1
NCBI id CM008303.1
chromosome length 25652880
location 2074630 ~ 2087567 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
snx11 Predicted to enable phosphatidylinositol binding activity. Predicted to act upstream of or within intracellular protein transport. Predicted to be located in membrane. Is expressed in artery; vein; and ventral mesoderm. Orthologous to human SNX11 (sorting nexin 11).

NR:

description
sorting nexin-11-like isoform X6

GO:

id name namespace
GO:0035091 phosphatidylinositol binding molecular_function

KEGG:

id description
K17924 SNX10_11; sorting nexin-10/11

RNA

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Neighbor

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LOC103022010 rgs9b,LOC108444257,LOC107660859,LOC107734240,LOC107584086,LOC107709642,LOC107692097,LOC108273767,LOC105888735 other downstream 32327 2022071 ~ 2042303 (-)
G33675 NA other downstream 262008 1810586 ~ 1812622 (-)
LOC111192416 NA other downstream 1673318 389434 ~ 401312 (-)
G33823 srcap other upstream 81456 2169023 ~ 2177059 (-)
G33836 LOC103393566,LOC105888730 other upstream 107190 2194757 ~ 2196095 (-)
G33904 NA other upstream 215695 2303262 ~ 2309329 (-)
G34046 NA other upstream 1093601 3181168 ~ 3194377 (-)
prr15l prr15l other upstream 1695558 3783125 ~ 3789192 (-)

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