LOC103024156


Basic Information

Item Value
gene id LOC103024156
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035900.1
NCBI id CM008303.1
chromosome length 25652880
location 15746284 ~ 15769469 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_022669182.1
TGGTTTCTGATATATATAAGCATAATCACTAACACTTTTTTCATCTTTGCAGGCAGGGAACTGCACTAGACACAAAACTGGTGGCTTGCAACCTGGTTTGATTCTCAGGATGGGGTATCCACCTTCACTGTGTTTGGCTGCCCTGCTCTTCCTGAACATAGTCACCACAAATGGACTCCCCGCAACCACAGTTCAAACCACAAATTTGATGGGTACCACCACTGGAAACCGCACAACCACAGTTCAATCCACAGGGTTAACAGGCACCACACCTGGAAGCCCCACAACCACAGTTCCATCCACAGTTTTTACAGGCCCCACAACTGGACGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTAACAAGCCCCACAACTGGGCGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCACCACAACTGGACGCCCCACAACCACAGTTCAAACCACAGGTTTGACGaGCACCACAACTGGGCGACCCACAACTACAGTTCAATCCACTGGTTTGACaaGCACCACAACTGGACGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCACCACATCTGGAAGCCCCACAAGCACAGTTCAATCCACAGTTTTTACAGGCACCACAACTGGGCGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACaaGCACCACAACTGGACGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCACCACATCTGGAAGCCCCACAAGCACAGTTCAATCCACAGTTTTTACAGGCACCACAACTGGACGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGGTTTGACGaGCACCACAACTGGACGCCCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCCCGACAACTGGAAGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGTTTTTACAGACACCACAACTGGACGCCCCACAACTACAGATCAATCTACAGTTTTTACAGCCTGTTCAGCTTTGAACTGCACTGCCAGAGAAGAGTGCAAGGCGAGAAGTGGAATTTATGGCTGTGCCTGTGCGAACAACAATCCAAGATTTAATGCTGCcacttttgATGCCTACAACTACTGTAACAGCAGTTCTGGGGTGCTGTCACTCTCTCGCTGTGAGCTCTTCGAGGCTGGATTTCCTTCAGACTTCCTTCACCTCAATGATCCTAGTTGTGGAGGGGATATCCAAGATGACAGAGTGGTGTTCACTTTCGACAACAGGTTTAGGATCTGTGGCACAACAATGAAGAGTAACGCAACACACTTAATCTACGAGAACACTGTTCGGATGGCAGAAGGTGTTTATTCAGGTAGTGTGATCAGTCGTGACAGCTGGCTGGACGTGAAATTCTCCTGTGTGTATCCACTCATCCAGAGCATCTCTATGTCCATGTCTATTTACTCCAAGGAAAGtgttgtgtCCAAAATACTGCCAGGTACTGAGAGCGCATATCAGCTCCGTCTAGTGACCTACCCCAATTCTTCATTCATTACTCCCTATTCCGGAAATATTACGATTGAAGTGAACCAGCAGGTCTTCATAGCTGTGGAGGCTGATGGAATTGACAGTTCACAGTTTGCTACTGTGCTGGACAGCTGCTGGGCCACTCCCTACAACAACATCAACTATCCTGTTCGCTGGGATCTGATCATTAATGAGTGTCCCAACGAGAAAGATGGCACAGTGGAGGTGCTGCAGAATGGAATCTGGACAGCCAGTCACTTCTCTTTCAGGATGTTCACCTTCACTAACCTATCTAACAGAATCTTCCTGCACTGTCAGGTGCACCTGTGCCCGCGGATGAGTGGTCAGTGCTCTCAGccatgtaataaaaatgatgacgATGATCAATTCAGAGGAAGACGTCGCAGATCTGTGGACTTCCACGACAAAGCTTCTATCAGCATGAGCTTCTAACTCTCTGGCCCTTTGAAACCTCTGTTTGTGTAACATGGCCTAGACTGTTTATTCTGTATGTAATTAAAGTGCTGTATTTACTAATGAACACaactatacaatatttttcatgATTAAGCTACAGGTGCAGATTAGTTTTTACAGATTAGGCgaacaatgaaaaacatttagattgattattgattatattttcacttattttcttctttagtaaaaataaatcttcTTAAGCACTTTATTTCACAGATTCAGTTTTCTTTACtgtattatcttattattattttatgttatactGAAGTTTGCCTTTTGGGTGCTTCTGTTTGCataatttttaatgttattactTTTTACTCAGAATTATTAGCTCTACTGTAACAGCACAGCAAAAAATTGGTTGTGCAGCAGATTGGGTGGAACGGTAGATAAAAAACTATAATTGTGTGCAGATTATTTGGACTGTGGATTATAAATGATGACCCTGCTTTAAAGGAGTATATGCTAGTGATCAAccgatatgtttttttttctctactctttttttttaaagcaattttttgttttgatacATAGGAATCACAAAAgtagagaaaacaaaacaaaaggcaaagaaaagaaagaacttcAAAGTACAATCACAAATATgcacacacaaaaagaaaagaaaacctgCACAGTGGGGTGACGGTTCCCATAATTATAAGTCTTTTGCATTAGAGTTCTTGTAGAATGTCCATTTCTGCCAGCTCTGCTCAGCCGCATTTTTTTGGATACGCAGAAGGAATGTAATTTTTTCCATGTTATATATCTCTTCCATTATTTCCatccattgttttatttttggtgaCTCTTTTTTCAACCAGTTCTTTGTAATAACTTTCTTTACTGccataatcattattttaaagatataaaCATCCGCTTTTTCAATCGATCCTTCCGGAATCAGGCCAAGATATAAAATCCTTGGATCTCTCGGAACTTCATATTGGAGGACTTCCTCTATTATTTCTAATACTTCCGACCAGAGTGGTTGTAATTTCACACATGACCAAAAAACATGCAGGTGATTGGGATTGATATGGCCACATTCTCTCCAACAAATCTGGTTTCCGATATGGGTTTTTTGATGGCCGATGCCGATATTTAGACAAAAGTAGTGGCCGATACAAAGCCGAtaatcccattttttttttctgatatctTTGTAAGTGTTTGAAgtttgttcattttgtgttcTTAGTGTTATTCTAGTTATTCAATTTCTTGTTTGTGTAGTCAAGCttagttttggttttagttttcttatttat
>XM_022669183.1
GGTTTCTGATATATATAAGCATAATCACTAACACTTTTTTCATCTTTGCAGGCAGGGAACTGCACTAGACACAAAACTGGTGGCTTGCAACCTGGTTTGATTCTCAGGATGGGGTATCCACCTTCACTGTGTTTGGCTGCCCTGCTCTTCCTGAACATAGTCACCACAAATGGACTCCCCGCAACCACAGTTCAAACCACAAATTTGATGGGTACCACCACTGGAAACCGCACAACCACAGTTCAATCCACAGGGTTAACAGGCACCACACCTGGAAGCCCCACAACCACAGTTCCATCCACAGTTTTTACAGGCCCCACAACTGGACGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTAACAAGCCCCACAACTGGGCGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCACCACATCTGGAAGCCCCACAAGCACAGTTCAATCCACAGTTTTTACAGGCACCACAACTGGGCGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACaaGCACCACAACTGGACGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCACCACATCTGGAAGCCCCACAAGCACAGTTCAATCCACAGTTTTTACAGGCACCACAACTGGACGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGGTTTGACGaGCACCACAACTGGACGCCCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCCCGACAACTGGAAGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGTTTTTACAGACACCACAACTGGACGCCCCACAACTACAGATCAATCTACAGTTTTTACAGCCTGTTCAGCTTTGAACTGCACTGCCAGAGAAGAGTGCAAGGCGAGAAGTGGAATTTATGGCTGTGCCTGTGCGAACAACAATCCAAGATTTAATGCTGCcacttttgATGCCTACAACTACTGTAACAGCAGTTCTGGGGTGCTGTCACTCTCTCGCTGTGAGCTCTTCGAGGCTGGATTTCCTTCAGACTTCCTTCACCTCAATGATCCTAGTTGTGGAGGGGATATCCAAGATGACAGAGTGGTGTTCACTTTCGACAACAGGTTTAGGATCTGTGGCACAACAATGAAGAGTAACGCAACACACTTAATCTACGAGAACACTGTTCGGATGGCAGAAGGTGTTTATTCAGGTAGTGTGATCAGTCGTGACAGCTGGCTGGACGTGAAATTCTCCTGTGTGTATCCACTCATCCAGAGCATCTCTATGTCCATGTCTATTTACTCCAAGGAAAGtgttgtgtCCAAAATACTGCCAGGTACTGAGAGCGCATATCAGCTCCGTCTAGTGACCTACCCCAATTCTTCATTCATTACTCCCTATTCCGGAAATATTACGATTGAAGTGAACCAGCAGGTCTTCATAGCTGTGGAGGCTGATGGAATTGACAGTTCACAGTTTGCTACTGTGCTGGACAGCTGCTGGGCCACTCCCTACAACAACATCAACTATCCTGTTCGCTGGGATCTGATCATTAATGAGTGTCCCAACGAGAAAGATGGCACAGTGGAGGTGCTGCAGAATGGAATCTGGACAGCCAGTCACTTCTCTTTCAGGATGTTCACCTTCACTAACCTATCTAACAGAATCTTCCTGCACTGTCAGGTGCACCTGTGCCCGCGGATGAGTGGTCAGTGCTCTCAGccatgtaataaaaatgatgacgATGATCAATTCAGAGGAAGACGTCGCAGATCTGTGGACTTCCACGACAAAGCTTCTATCAGCATGAGCTTCTAACTCTCTGGCCCTTTGAAACCTCTGTTTGTGTAACATGGCCTAGACTGTTTATTCTGTATGTAATTAAAGTGCTGTATTTACTAATGAACACaactatacaatatttttcatgATTAAGCTACAGGTGCAGATTAGTTTTTACAGATTAGGCgaacaatgaaaaacatttagattgattattgattatattttcacttattttcttctttagtaaaaataaatcttcTTAAGCACTTTATTTCACAGATTCAGTTTTCTTTACtgtattatcttattattattttatgttatactGAAGTTTGCCTTTTGGGTGCTTCTGTTTGCataatttttaatgttattactTTTTACTCAGAATTATTAGCTCTACTGTAACAGCACAGCAAAAAATTGGTTGTGCAGCAGATTGGGTGGAACGGTAGATAAAAAACTATAATTGTGTGCAGATTATTTGGACTGTGGATTATAAATGATGACCCTGCTTTAAAGGAGTATATGCTAGTGATCAAccgatatgtttttttttctctactctttttttttaaagcaattttttgttttgatacATAGGAATCACAAAAgtagagaaaacaaaacaaaaggcaaagaaaagaaagaacttcAAAGTACAATCACAAATATgcacacacaaaaagaaaagaaaacctgCACAGTGGGGTGACGGTTCCCATAATTATAAGTCTTTTGCATTAGAGTTCTTGTAGAATGTCCATTTCTGCCAGCTCTGCTCAGCCGCATTTTTTTGGATACGCAGAAGGAATGTAATTTTTTCCATGTTATATATCTCTTCCATTATTTCCatccattgttttatttttggtgaCTCTTTTTTCAACCAGTTCTTTGTAATAACTTTCTTTACTGccataatcattattttaaagatataaaCATCCGCTTTTTCAATCGATCCTTCCGGAATCAGGCCAAGATATAAAATCCTTGGATCTCTCGGAACTTCATATTGGAGGACTTCCTCTATTATTTCTAATACTTCCGACCAGAGTGGTTGTAATTTCACACATGACCAAAAAACATGCAGGTGATTGGGATTGATATGGCCACATTCTCTCCAACAAATCTGGTTTCCGATATGGGTTTTTTGATGGCCGATGCCGATATTTAGACAAAAGTAGTGGCCGATACAAAGCCGAtaatcccattttttttttctgatatctTTGTAAGTGTTTGAAgtttgttcattttgtgttcTTAGTGTTATTCTAGTTATTCAATTTCTTGTTTGTGTAGTCAAGCttagttttggttttagttttcttatttat
>XM_022669184.1
GGTTTCTGATATATATAAGCATAATCACTAACACTTTTTTCATCTTTGCAGGCAGGGAACTGCACTAGACACAAAACTGGTGGCTTGCAACCTGGTTTGATTCTCAGGATGGGGTATCCACCTTCACTGTGTTTGGCTGCCCTGCTCTTCCTGAACATAGTCACCACAAATGGACTCCCCGCAACCACAGTTCAAACCACAAATTTGATGGGTACCACCACTGGAAACCGCACAACCACAGTTCAATCCACAGGGTTAACAGGCACCACACCTGGAAGCCCCACAACCACAGTTCCATCCACAGTTTTTACAGGCCCCACAACTGGACGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTAACAAGCCCCACAACTGGGCGACCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCACCACAACTGGACGCCCCACAACCACAGTTCAAACCACAGGTTTGACGaGCACCACAACTGGACGCCCCACAACTACAGTTCAATCCACAGGTTTGACAAGCCCGACAACTGGAAGCCCCACAACCACAGTTCAATCCACAGTTTTTACAGACACCACAACTGGACGCCCCACAACTACAGATCAATCTACAGTTTTTACAGCCTGTTCAGCTTTGAACTGCACTGCCAGAGAAGAGTGCAAGGCGAGAAGTGGAATTTATGGCTGTGCCTGTGCGAACAACAATCCAAGATTTAATGCTGCcacttttgATGCCTACAACTACTGTAACAGCAGTTCTGGGGTGCTGTCACTCTCTCGCTGTGAGCTCTTCGAGGCTGGATTTCCTTCAGACTTCCTTCACCTCAATGATCCTAGTTGTGGAGGGGATATCCAAGATGACAGAGTGGTGTTCACTTTCGACAACAGGTTTAGGATCTGTGGCACAACAATGAAGAGTAACGCAACACACTTAATCTACGAGAACACTGTTCGGATGGCAGAAGGTGTTTATTCAGGTAGTGTGATCAGTCGTGACAGCTGGCTGGACGTGAAATTCTCCTGTGTGTATCCACTCATCCAGAGCATCTCTATGTCCATGTCTATTTACTCCAAGGAAAGtgttgtgtCCAAAATACTGCCAGGTACTGAGAGCGCATATCAGCTCCGTCTAGTGACCTACCCCAATTCTTCATTCATTACTCCCTATTCCGGAAATATTACGATTGAAGTGAACCAGCAGGTCTTCATAGCTGTGGAGGCTGATGGAATTGACAGTTCACAGTTTGCTACTGTGCTGGACAGCTGCTGGGCCACTCCCTACAACAACATCAACTATCCTGTTCGCTGGGATCTGATCATTAATGAGTGTCCCAACGAGAAAGATGGCACAGTGGAGGTGCTGCAGAATGGAATCTGGACAGCCAGTCACTTCTCTTTCAGGATGTTCACCTTCACTAACCTATCTAACAGAATCTTCCTGCACTGTCAGGTGCACCTGTGCCCGCGGATGAGTGGTCAGTGCTCTCAGccatgtaataaaaatgatgacgATGATCAATTCAGAGGAAGACGTCGCAGATCTGTGGACTTCCACGACAAAGCTTCTATCAGCATGAGCTTCTAACTCTCTGGCCCTTTGAAACCTCTGTTTGTGTAACATGGCCTAGACTGTTTATTCTGTATGTAATTAAAGTGCTGTATTTACTAATGAACACaactatacaatatttttcatgATTAAGCTACAGGTGCAGATTAGTTTTTACAGATTAGGCgaacaatgaaaaacatttagattgattattgattatattttcacttattttcttctttagtaaaaataaatcttcTTAAGCACTTTATTTCACAGATTCAGTTTTCTTTACtgtattatcttattattattttatgttatactGAAGTTTGCCTTTTGGGTGCTTCTGTTTGCataatttttaatgttattactTTTTACTCAGAATTATTAGCTCTACTGTAACAGCACAGCAAAAAATTGGTTGTGCAGCAGATTGGGTGGAACGGTAGATAAAAAACTATAATTGTGTGCAGATTATTTGGACTGTGGATTATAAATGATGACCCTGCTTTAAAGGAGTATATGCTAGTGATCAAccgatatgtttttttttctctactctttttttttaaagcaattttttgttttgatacATAGGAATCACAAAAgtagagaaaacaaaacaaaaggcaaagaaaagaaagaacttcAAAGTACAATCACAAATATgcacacacaaaaagaaaagaaaacctgCACAGTGGGGTGACGGTTCCCATAATTATAAGTCTTTTGCATTAGAGTTCTTGTAGAATGTCCATTTCTGCCAGCTCTGCTCAGCCGCATTTTTTTGGATACGCAGAAGGAATGTAATTTTTTCCATGTTATATATCTCTTCCATTATTTCCatccattgttttatttttggtgaCTCTTTTTTCAACCAGTTCTTTGTAATAACTTTCTTTACTGccataatcattattttaaagatataaaCATCCGCTTTTTCAATCGATCCTTCCGGAATCAGGCCAAGATATAAAATCCTTGGATCTCTCGGAACTTCATATTGGAGGACTTCCTCTATTATTTCTAATACTTCCGACCAGAGTGGTTGTAATTTCACACATGACCAAAAAACATGCAGGTGATTGGGATTGATATGGCCACATTCTCTCCAACAAATCTGGTTTCCGATATGGGTTTTTTGATGGCCGATGCCGATATTTAGACAAAAGTAGTGGCCGATACAAAGCCGAtaatcccattttttttttctgatatctTTGTAAGTGTTTGAAgtttgttcattttgtgttcTTAGTGTTATTCTAGTTATTCAATTTCTTGTTTGTGTAGTCAAGCttagttttggttttagttttcttattta

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022669182.1 True 3249 mRNA 0.42 24 15746284 15769469
XM_022669183.1 False 3095 mRNA 0.41 21 15746284 15769468
XM_022669184.1 False 2890 mRNA 0.41 17 15746285 15769468

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103025516 NA coding downstream 9209 15723259 ~ 15737075 (-)
LOC103026344 LOC108410807,LOC106579091,LOC107569191,LOC105909101,LOC105006181 coding downstream 134862 15582625 ~ 15611422 (-)
LOC103026640 si:dkeyp-118b1.2,LOC103026640,LOC108410802,LOC107694074,LOC107745658,LOC108273584,LOC105909120,LOC107684755 coding downstream 165526 15572780 ~ 15580758 (-)
smarcd2 smarcd2,LOC107569192,LOC107684754 coding downstream 180367 15552591 ~ 15565917 (-)
psmc5 psmc5,LOC107745657,LOC107753303 coding downstream 198714 15541100 ~ 15547570 (-)
LOC103033657 NA coding upstream 3489 15772958 ~ 15778847 (-)
LOC103023209 NA coding upstream 71924 15841393 ~ 15851677 (-)
ank3 ank3b,ank3,LOC107654059,LOC107695539 coding upstream 104890 15874359 ~ 16026122 (-)
LOC103021447 tmem26 coding upstream 426944 16196413 ~ 16208914 (-)
egr2 egr2,egr2b,LOC107596611,LOC107596614,LOC107653961,LOC107739063,LOC107745678 coding upstream 693859 16463328 ~ 16484145 (-)
G36664 NA non-coding downstream 66978 15608091 ~ 15679306 (-)
G36657 NA non-coding downstream 197205 15548879 ~ 15549079 (-)
LOC111192377 NA non-coding downstream 218987 15514858 ~ 15527297 (-)
G36634 NA non-coding downstream 334276 15407460 ~ 15412008 (-)
G36629 ki67 non-coding downstream 349247 15393011 ~ 15397037 (-)
LOC111192406 NA non-coding upstream 21628 15791097 ~ 15795369 (-)
G36681 NA non-coding upstream 31561 15801030 ~ 15801264 (-)
LOC111192407 NA non-coding upstream 49847 15819316 ~ 15835522 (-)
G36754 NA non-coding upstream 93813 15863282 ~ 15864264 (-)
G36755 NA non-coding upstream 180306 15949775 ~ 15950699 (-)
c4h10orf88 LOC103041415 other downstream 949072 14785952 ~ 14797212 (-)
p4ha1 p4ha1,p4ha1a,LOC107753313,LOC108273903,LOC107560551,LOC107684765 other downstream 2246107 13475166 ~ 13500177 (-)
lsm5 lsm5,LOC107653262,LOC107727957,LOC107674592 other downstream 2434759 13307088 ~ 13311525 (-)
G36074 NA other downstream 3034739 12709808 ~ 12711545 (-)
LOC103036331 NA other downstream 3673857 12067533 ~ 12072427 (-)
LOC103023526 ndua4,ndufa4,LOC103023526,LOC108443163,LOC107745684,LOC107684782,LOC107569184 other upstream 67636 15837105 ~ 15840516 (-)
LOC103043629 LOC108412394 other upstream 1144101 16913570 ~ 16915285 (-)
G37183 NA other upstream 1246659 17016128 ~ 17018918 (-)
crym rac1,RAC1,rac1a,crym,LOC105898786,LOC108412270,LOC108437155,LOC107569188 other upstream 1278138 17047607 ~ 17062947 (-)
LOC103030148 csdc2,LOC105919973,LOC102235694 other upstream 1409878 17179347 ~ 17184427 (-)

Expression


Co-expression Network