G100975


Basic Information

Item Value
gene id G100975
gene name NA
gene type unknown
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035908.1
NCBI id CM008311.1
chromosome length 31403898
location 5086760 ~ 5091748 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU136387
AATCATTGGACAAAAAAACTGGTTTGGTCACCCTAGCAACAGTTGCTATGAAAGTGGGCGTGTCTGTGGGCGGAGCATACAGGCCTGGACCCGGTGGTCATAACTCATATCATTATGATGAAGATGGGGTCGGAGATGAGAtgattttactgattttttttttttttactgaggaagaggaggaagagcgtCCAAAAATAACTAGACTGCCGTATTTCACAGAAGAAGAGCTACTATAcatatttccatatatatatacagcatgtACGAGCATATTGATATTAAGTCTggatagtatatatttatatatttataaactgcCGTGTTCCCAGCCTCCTATGTTCTGGTTCTTGCTAAGCCATGATACATTATATAGTACACTGATTCTGTAGCTTATACACGAGTACACACCCTGAATTCAATGCTGGGCAGGTTGCATATagagggggtggggtggggggggtatTTACTGAGGCACTTTGATGCATTGGGCAGGTGGGTAGGTGGTGGAAGAgccaagaaaggaagaaaggggGCGTGGTATCGGGCTGGTTTCGGCCAATGGGAATCCCTGACACCCGACTGACAGCTAGGCAGTccagttattttgagatatcaGTGTTTTTGATCTTTTGAAAATGTGATGTAAAGTGTATGAATGTAGTGTTTCTCTGAATTAGGAAATACAGTAGGGCTGTCATgatgatttaattaaaaaacaaaattaaaaaaaaagtttgatatTTACCTCAAATCTTGAGcaatattgcaataatttctctTATTGTTCTCTTTTAGAGTAAGACAATAAGCTTTTTGAGGACATTTGAAGACAGTTTATCGATATCCATTTGTGTTATATACactctaaataataaaaaaataaaggtgctacaaaaaGATTTGTCGAGTGAtgccataaaataataattttttatgtCCTACAAAACTATTTTTGTTAAAGAAATATATGGAAGAACATGTCCCTAAAACATGTACATACtcccacatttttttgttttttaccctGCAGTATAAATGCAGTATCCCATAATTAGCCAGATTTAACCATCAACTACAGAAGCCCTAAAACTGAGCCCTGTGGGATGCCGCCCAAAAAAATCTGCtatcagctctggaaaaaaataagagagcacttaaaaaagatgagtttctttgtttttaccaaacagaaaacctctgggatataataaagaggaagatggatgatcacaagccatcaaaccaaactgaactgcttgaatctttgcaccaggagtaaagcagcataaagttatccaaaagcagtgtgtaagactggtggaggagagcatgtcAAGatgccaccaaatattgatttctgaactttttataaagctttatgaatatgaacttgttttctttgcattatttgaggtataaaaaaatatttttagcatcttttgtggttattttatttattttattttacaacatCACTCAAATAACCGGTTGTatcacctttattttaaagagtgtatttttattattttgcatgTTAATTTCACTCTTAATAAACTTGTATATATATGGTAAGTCTACTTAACTATATTAAAGTAggttaatgcatttattaaaagggGTGTACACAAATATATTCGGACATATAGAGTAAAATTAGTAGATTTACTGGTGTTTTAACGTAATCATCAGTGACAGCCCTACTTTTGAGTGTATGTAGTGTTTATTATAGGGTTTATTTTAAGGGTTTATTAGGGTTAATGATGATAGTGATATTAATGCTGTTGCTGGTTTGTTCACGTTAGggtttaaaaaacagaataaaatgaatataaaacgGGTCGAACTGAATGAAATTCTTCCCTTTGATCGatgtaaggattttttttttagaagtatatCATAGTTTCATAGTGCAATTccgtgtgtatatatgtatatatgtatgcttTACCTTGTGTATGACAGGCTGTATGTTATGGAGGATGTTTAATGTGGATTTATCTGGTTGTGAAGAGAAAATGCAGAACAGAAGAGAACAGAGTGTAAAgtgaaacacagaaacactgatgATGAACGTGACAGAGTGTTAGTTATGAAACTGATATTGCTgagctgattttaaaagaaaccaGTATTTCTAATGTGAAAAGTTAAACCTAATGCATGCACTGAATCCTGTAGCTGTAATAAACCCACGTCACAAAAAACTGAAACCTGTTAAAACTAGTCTATGAagataagaacaaaaaaatatatagtaaaactaAATGAAACCAAATTGAGAAGAAAATCTAAAAGTTAAAAATTGTAGCATTAAAACTGATGCACTGAAACATATTGTAACAGTAAGTCTCATATAAAGCCTTTATAACTGCAGCAAACAACTAATTTATTGAGTTAACTCAAATTAATTAACTCCTATTCTGTACTTCTGTATCTCAGTTTGGTCAACCTCAGGATTTTAAAATAGCTGAAACTGCAAAATGCCTTTTTTGGTGAAATTAAGAAAGCatttttgagttaactcaacttttAGTCAAAAGCTCTCCCAACTCATATTCTTCAAACTGAACCAATATATACTGAGGTGAGCCTCAGAAACAGTACATGAGCTGCAGCTGAAACTGGTTTTAAATCAGCTCAAATTTATAAAGACTTGAGTTAACTCAATTTATGTAAGCCAGAAGTTCTCATAACTCACATTTTTTACGTCTTTCTTCTCGGTTTGTTTGAAAATACACTAAGCCAAGCCTTAAAGGATTGTTAAATGAGGTTCAACTGAACTTGATTTTAAATCAGCTAAAATCATTTTAGGTTAACTCAATTTATGTACGTCAAAATTTCTCATAACTCACATTTTTTACTTCTTTCCTCTCggtttggttaaaaaaatacactaagcCAAGCCTTAAAGGATTAGTAAATGAGGTTCAACTGAACTTGATTTTAAATCagctaaaatgtttaaaataattttattttaactcaatTTATTTACGTCAAAATTTCTCAGAACTCACATTTTTTACCACTGCTTCTTAGATTGGTCAACCTTACATGTTGACCCGGGTCTGAAACTGATTTTAAAGCAGCTGCATCTGTGaagttttgaataaaaaaagttgagttaactcaaaaatCCCTCTGCAATGCTCTGTTTCTTATCATTTTTAGTTGACCTGATTTTATACCTGCTTTTTTTCAGCACATAGCTACATATATGCAGTTCATAGCTGTGTTCATGCATTTATAAAGGCTGAATgacttacattactttactAATTGAACTGATCCATCACTACTGTCTTCAGTCTATTGCTAATattgatattactgtataattagATGATAAGCTTAAACTGATTGATTGGTGATTAGTTGTATGTTGTGTGTGCTTTATTGTTCGGTATTGCTAGAaaactgtgttttgtttgtgtatatgtgtttgtgtatgtgtgtatatgtgtatgtatttgtgtgtgtaataatgcgacGGTGCCAAGGCCACCCTATTGTGCTGtgccaaaaaaaaacgttttttttttttaagttttaaagacTTTTATCAGTAAGTCAGCTCGCCCTGCTGCCAaacataatcacagtttttaaaccCACGCATAAAAATCATCCCTTATcaaatttcatatatttttgaaTAGTGCATACGCAAGTGCTGCGTTTCTTTCCATCAGTCTGTCGTCACGTGACCAAAACTCAGCAACAAAACGCAATTTTTGGGGCTCAATCTTTCGCAGCATCAATTGGCCAATCCAGAGCAAGCAAAATCAAAAATTACACATTTCTCGTCCAATCAGGTGCAAGGGTCAATCAAGTAGAGCTGAATGAATGGTGTCGAGAGTTGAtgatgagttaaaaaaaaagtatgaagaAAGATGATGTCATGGAGATGATTCACTAAATCGTTGTAAAAAATGGACTAAAAGTAGAGAAATAATGAAATCTGAACCAATCAGCTTCAGCTTaaactctgattggctgagtgaACTTGGAATCTCTAGGAATCTCTTAAAACCTCTAGGAATCTCTTGGAATCTCCGTGCCGTGTGATTGATTGGTGgatgattaaaacaaacaaaaacaaaaaattaacaaaaataaggaTGAAAAAATACAATTGGTCAATATCATATACGGGTTGCCTcgataaaattacaaaaaaattgaGCGAAAcgtctttttttcttcatcctaAATGGAATCAAgtcattttcttttgtttctgttgTTCCAAAACAGTTACTTTTCAGACATTTTCCGTTTTTCACGAAAAACATCCAGGATTCTGTGCTGTCTGTGTGGttgatttccagattttttctGCAGAGATTTGTAGAATTTTGAGcagttttccaggttttccaGGCTGACGGATCATGTGGAATTGTTTCAGGCGTTTGGAAGGACGAATGTGGAAATTCTCCAGGGTTTTAGAGAATCACGTGAAAGGTTTCCCGGCTTTCTGAAGAATCGATCGTGGAAGCGTTCTGGATTCCTCAGTACGGGACTCTTATGTTGAAGTGTTTTTTGGAGAAGTGGGCGGGGCGTGCAGGTTTAAGTTGATTAAGGTGTGTGATATGCTAATCGCGGTCCATACCTAGCTTTGTGTTTCCCGTTTCAGCTACAGACTAGAGTCTGTACGTTTCAGAGGGATCTTGTCAAAGGAACCAGGACTGT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU136387 True 4701 TUCP 0.35 2 5086760 5091748

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rad23a rad23a coding upstream 15618 5060535 ~ 5071142 (+)
LOC103026170 NA coding upstream 282213 4796254 ~ 4804547 (+)
LOC103042234 meis1,LOC107757034 coding upstream 299875 4730629 ~ 4786885 (+)
LOC103025559 actr2,LOC108423375,LOC108441254,LOC104930021,LOC106585927,LOC107583198 coding upstream 415424 4648447 ~ 4671336 (+)
LOC103024921 LOC108441252,LOC108258536 coding upstream 461912 4507634 ~ 4624848 (+)
LOC103031288 NA coding downstream 362944 5454692 ~ 5457457 (+)
rnaseh2a rnaseh2a,LOC107747423 coding downstream 385787 5477535 ~ 5486445 (+)
snrpb2 snrpb2,LOC107684252,LOC107676294 coding downstream 395714 5487462 ~ 5493881 (+)
LOC103027484 LOC108441199,LOC108258526 coding downstream 426325 5518073 ~ 5527443 (+)
fbxo48 fbxo48,LOC107684254 coding downstream 495541 5587289 ~ 5590899 (+)
G100974 NA non-coding upstream 2955 5081767 ~ 5083805 (+)
G100973 NA non-coding upstream 5079 5033650 ~ 5081681 (+)
G100984 NA non-coding upstream 26884 5057932 ~ 5059876 (+)
G100956 NA non-coding upstream 58352 4972964 ~ 5028408 (+)
G100962 NA non-coding upstream 61273 4996838 ~ 5025487 (+)
G101007 NA non-coding downstream 82195 5173943 ~ 5177140 (+)
G101020 NA non-coding downstream 185516 5277264 ~ 5277491 (+)
G101167 NA non-coding downstream 187279 5279027 ~ 5283843 (+)
G101186 NA non-coding downstream 272118 5363866 ~ 5364347 (+)
G101207 NA non-coding downstream 374202 5465950 ~ 5466415 (+)
atg4d atg4d other upstream 441404 4629123 ~ 4645356 (+)
G100820 akt3b,LOC108438606,LOC108259077,LOC107594289,LOC107729704,LOC107703832,LOC101071975 other upstream 818934 4250083 ~ 4267826 (+)
LOC103022119 NA other upstream 1026011 4011995 ~ 4060749 (+)
LOC103023443 NA other upstream 1857394 3226739 ~ 3229366 (+)
G100314 NA other upstream 1877430 3158656 ~ 3209330 (+)
G101452 NA other downstream 1190277 6282025 ~ 6407811 (+)
mzt1 mzt1,si:dkey-15d12.2,LOC107556706 other downstream 1208366 6300114 ~ 6302702 (+)
LOC103032856 march9,LOC108435943 other downstream 1863571 6955319 ~ 6997446 (+)
G101622 zc3h13 other downstream 2053054 7144802 ~ 7146340 (+)
LOC103042156 NA other downstream 2293009 7384757 ~ 7393225 (+)

Expression


Co-expression Network