cryzl1 (cryzl1)


Basic Information

Item Value
gene id cryzl1
gene name cryzl1
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035908.1
NCBI id CM008311.1
chromosome length 31403898
location 12483622 ~ 12522303 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU139117
AAACATTCTGAGTCACTAATTTCCGTCTTGTCggttggtgaaaaaaaaaaatttgatgagaatgtgtaatttaatttgaaacatatattttaatatgtggCTGAAAAgttgcattttaataaaaaaaagtgggcACAACATTGTAGACCAATTTAAACATGAAGTACAGTTAAcagtttcaatttttttttatcttttattatataaaacattgtaACATGTATCTGATTAAACATTTCAACATGACAAAGTCACATACCAAAAACCCTGCTTGTAATTGCTTCTTTTGAtcataaagtc
>XM_007251339.2
TAACGCGAGAGGTCGGCGGCTACGTCATTGTTTTGGTCAGGCGGTTGGTTGTCtgtcattagcattagctagttaGCCTAGCGATAagaagagagaaacacagtgaATAACCATAATAATGATATAGTTACCTATTTATCTGAATGAATTATCTAACGTTAGCTATAAATAAGTGATTATTGTCTGTGTGAGTTCCTGACATAGAGTAACCAGGATCTTACAGCGACTAACGTCCATTTCAAGCTAACAGGACAGCCAGTATGAAAGGACTGTATTGCAAGCTGAGTGAAGCTGGAGAGGTTAAGTTTATTATACAGGACACGAGCCTGCCGACAGCTATCGGGAACCATCAGGTCAAAGTTCAAGTTAAAAGCTGTGCTCTGAGTCATGTTGACATAAAGttgcgtGAGGATTTAAAGCTGCAAAGTGAACATGTGCCAGTTGGACGAGAGATAGCAGGAGTCGTGCTCCAAGTTGGGCCCAAGGTGACCTTTTTCCAGCCTGATGATGAAGTTGTAGGAATCCTCCCCCTGGATGCCGAGGTGTCTGGTCTCTGTGATGTTGTCCTTATAGATGAATATAATTTAGTTCAGAAGCCTGAAAAGGTGGGCTGGTTTGAAGCTGCTGGAGCAATTAAGGATGGCCTCAAGGCCTACACAGCTCTACACACTCTGGCTCGGATAGCTGTGGGACAAACGCTACTAGTGTTGGATGGTGCGAGTCCTTTTGGACTCCTGGCCATCCAGCTAGCCCACTACCATGGGGTAAAAGTCCTGGCTACTGCCGTGTCCCCTGAGGACCAGAAGTTTCTGGAACAGCTCCGGCCGAGTTTGGGTGTGCTGGAATCGCTTGTAGccaGAGTGATTGGAGTGTGGGATTTAAAGGTGGACCTAGTGGACTTATGCCTGGAAGAAACTGGAGGACTAGGAGTGGATATAGTCATTGATGCTGGAGTGCGGCTTCATGAAGAAGACACTGAAGAAGTCAGGAATCATCTCCCACACAAACATGATATCATCAGTCTTCTTGGAGTTGGAGGACATTGGGTCACCACAGAAGACAACTTGCAGCTGGATCCTCCAGACAGCTGCAGTCTCTTCCTGAAGGCAGCCTCTGTGTCCTTTCTAAATGAGGAGGTGTGGGAGGCATCCAGGGCCAGACAGGGCAGATATATCCATATAATGAAGGATGTGGTGGAGAAGCTATCAACAGGAACCTTCAGgcCACTAGTAGAAAATCCTGTGCCTTTGTATGAAGCCACTGTTTCAATGGAGATGGTGCAGAGAAGACAACTCAGAAAGCGAGTCGTGGTGAAGCTTTAGGGGGAAGATTCTGGAACTACAAATTTCATCATTCCATGATAAAGGGACTATATATGCATATGATGAGGATAACTTTCTCAGCAGTcagtatatgtatgtgtttatttgcattgtgGATGGATTGTGGATGGTCACTTTTTTCATCTTTATTTAGGATATTcatcatataataaatatgtttaaataaaaaaatcatcatcaaTGAAATGGTTGCAAAAATAGTTAGACAtaaattagggctgtcaacgttcAAAATCAGTAacgcattaattttttttacgtaaataATTACACCACCAGGTTTGACCCGAACTTCCTGCCAAACTGACTTTTTTCTGGAGTGGTTCATTTATGGTGAGATCGTGATTTGATCTttatccgacccagctatcaaatatacttcttttcaATTGAGCTGAACTGCTGATTAGCCGCAGactaatctgatatattatttAGATAATCTACTGCTATGAAAAATGCTGCTCCATGGTGTTTCCACATGCAGtaatgtgcagcattcactgctcacatcagcGTTCTGTGTTATagcagcttcacactgaacagatatacacactggaacacagaatcttctcactattatttactttattgctCCAGCACcggacagctctgaccaatcagaggagacaatgtgctcgcctggtttattggtgcacattttggtacGTTTAGGTTTGTATCTGCgtgaaatcaaaccaaacagagggagaaaacgcttcaaataaacaaactcattaactgatccggaccataaaaacttttaaacaacCAATGCTGAGTGGGTTTTATCTCGCCTctaacatacaagtatatactagtgttttaactgacaccactaatataaatataaatataattgcattttaagcTTCTTACATTcataaatatccactataaaaacttgcatcttaagaTAAACAAATACGATTAAACAGTCACTAATTTCCGTCTTGTCggttggtgaaaaaaaaaaatttgatgagaatgtgtaatttaatttgaaacatatattttaatatgtggCTGAAAAgttgcattttaataaaaaaaagtgggcACAACATTGTAGACCAATTTAAACATGAAGTACAGTTAAcagtttcaatttttttttatcttttattatataaaacattgtaACATGTATCTGATTAAACATTTCAACATGACAAAGTCACATACCAAAAACCCTGCTTGTAATTGCTTCTTTTGAtcataaagtcttttttttgta
>XM_007251340.2
TAACGCGAGAGGTCGGCGGCTACGTCATTGTTTTGGTCAGGCGGTTGGTTGTCtgtcattagcattagctagttaGCCTAGCGATAagaagagagaaacacagtgaATAACCATAATAATGATATAGTTACCTATTTATCTGAATGAATTATCTAACGTTAGCTATAAATAAGTGATTATTGTCTGTGTGAGTTCCTGACATAGAGTAACCAGGATCTTACAGCGACTAACGTCCATTTCAAGCTAACAGGACAGCCAGTATGAAAGGACTGTATTGCAAGCTGAGTGAAGCTGGAGAGGTTAAGTTTATTATACAGGACACGAGCCTGCCGACAGCTATCGGGAACCATCAGGTCAAAGTTCAAGTTAAAAGCTGTGCTCTGAGTCATGTTGACATAAAGttgcgtGAGGATTTAAAGCTGCAAAGTGAACATGTGCCAGTTGGACGAGAGATAGCAGGAGTCGTGCTCCAAGTTGGGCCCAAGGTGACCTTTTTCCAGCCTGATGATGAAGTTGTAGGAATCCTCCCCCTGGATGCCGAGGTGTCTGGTCTCTGTGATGTTGTCCTTATAGATGAATATAATTTAGTTCAGAAGCCTGAAAAGGTGGGCTGGTTTGAAGCTGCTGGAGCAATTAAGGATGGCCTCAAGGCCTACACAGCTCTACACACTCTGGCTCGGATAGCTGTGGGACAAACGCTACTAGTGTTGGATGGTGCGAGTCCTTTTGGACTCCTGGCCATCCAGCTAGCCCACTACCATGGGGTAAAAGTCCTGGCTACTGCCGTGTCCCCTGAGGACCAGAAGTTTCTGGAACAGCTCCGGCCGAGTTTGGccaGAGTGATTGGAGTGTGGGATTTAAAGGTGGACCTAGTGGACTTATGCCTGGAAGAAACTGGAGGACTAGGAGTGGATATAGTCATTGATGCTGGAGTGCGGCTTCATGAAGAAGACACTGAAGAAGTCAGGAATCATCTCCCACACAAACATGATATCATCAGTCTTCTTGGAGTTGGAGGACATTGGGTCACCACAGAAGACAACTTGCAGCTGGATCCTCCAGACAGCTGCAGTCTCTTCCTGAAGGCAGCCTCTGTGTCCTTTCTAAATGAGGAGGTGTGGGAGGCATCCAGGGCCAGACAGGGCAGATATATCCATATAATGAAGGATGTGGTGGAGAAGCTATCAACAGGAACCTTCAGgcCACTAGTAGAAAATCCTGTGCCTTTGTATGAAGCCACTGTTTCAATGGAGATGGTGCAGAGAAGACAACTCAGAAAGCGAGTCGTGGTGAAGCTTTAGGGGGAAGATTCTGGAACTACAAATTTCATCATTCCATGATAAAGGGACTATATATGCATATGATGAGGATAACTTTCTCAGCAGTcagtatatgtatgtgtttatttgcattgtgGATGGATTGTGGATGGTCACTTTTTTCATCTTTATTTAGGATATTcatcatataataaatatgtttaaataaaaaaatcatcatcaaTGAAATGGTTGCAAAAATAGTTAGACAtaaattagggctgtcaacgttcAAAATCAGTAacgcattaattttttttacgtaaataATTACACCACCAGGTTTGACCCGAACTTCCTGCCAAACTGACTTTTTTCTGGAGTGGTTCATTTATGGTGAGATCGTGATTTGATCTttatccgacccagctatcaaatatacttcttttcaATTGAGCTGAACTGCTGATTAGCCGCAGactaatctgatatattatttAGATAATCTACTGCTATGAAAAATGCTGCTCCATGGTGTTTCCACATGCAGtaatgtgcagcattcactgctcacatcagcGTTCTGTGTTATagcagcttcacactgaacagatatacacactggaacacagaatcttctcactattatttactttattgctCCAGCACcggacagctctgaccaatcagaggagacaatgtgctcgcctggtttattggtgcacattttggtacGTTTAGGTTTGTATCTGCgtgaaatcaaaccaaacagagggagaaaacgcttcaaataaacaaactcattaactgatccggaccataaaaacttttaaacaacCAATGCTGAGTGGGTTTTATCTCGCCTctaacatacaagtatatactagtgttttaactgacaccactaatataaatataaatataattgcattttaagcTTCTTACATTcataaatatccactataaaaacttgcatcttaagaTAAACAAATACGATTAAACAGTCACTAATTTCCGTCTTGTCggttggtgaaaaaaaaaaatttgatgagaatgtgtaatttaatttgaaacatatattttaatatgtggCTGAAAAgttgcattttaataaaaaaaagtgggcACAACATTGTAGACCAATTTAAACATGAAGTACAGTTAAcagtttcaatttttttttatcttttattatataaaacattgtaACATGTATCTGATTAAACATTTCAACATGACAAAGTCACATACCAAAAACCCTGCTTGTAATTGCTTCTTTTGAtcataaagtcttttttttgta
>XM_022674725.1
gctggcACGTCTTCAGATTAAGCTGGAAAATAGGTagcggttagctagctaacgttaacggCCTTTGCTGTGCTTTTAACGGACAGCCAGTATGAAAGGACTGTATTGCAAGCTGAGTGAAGCTGGAGAGGTTAAGTTTATTATACAGGACACGAGCCTGCCGACAGCTATCGGGAACCATCAGGTCAAAGTTCAAGTTAAAAGCTGTGCTCTGAGTCATGTTGACATAAAGttgcgtGAGGATTTAAAGCTGCAAAGTGAACATGTGCCAGTTGGACGAGAGATAGCAGGAGTCGTGCTCCAAGTTGGGCCCAAGGTGACCTTTTTCCAGCCTGATGATGAAGTTGTAGGAATCCTCCCCCTGGATGCCGAGGTGTCTGGTCTCTGTGATGTTGTCCTTATAGATGAATATAATTTAGTTCAGAAGCCTGAAAAGGTGGGCTGGTTTGAAGCTGCTGGAGCAATTAAGGATGGCCTCAAGGCCTACACAGCTCTACACACTCTGGCTCGGATAGCTGTGGGACAAACGCTACTAGTGTTGGATGGTGCGAGTCCTTTTGGACTCCTGGCCATCCAGCTAGCCCACTACCATGGGGTAAAAGTCCTGGCTACTGCCGTGTCCCCTGAGGACCAGAAGTTTCTGGAACAGCTCCGGCCGAGTTTGGGTGTGCTGGAATCGCTTGTAGccaGAGTGATTGGAGTGTGGGATTTAAAGGTGGACCTAGTGGACTTATGCCTGGAAGAAACTGGAGGACTAGGAGTGGATATAGTCATTGATGCTGGAGTGCGGCTTCATGAAGAAGACACTGAAGAAGTCAGGAATCATCTCCCACACAAACATGATATCATCAGTCTTCTTGGAGTTGGAGGACATTGGGTCACCACAGAAGACAACTTGCAGCTGGATCCTCCAGACAGCTGCAGTCTCTTCCTGAAGGCAGCCTCTGTGTCCTTTCTAAATGAGGAGGTGTGGGAGGCATCCAGGGCCAGACAGGGCAGATATATCCATATAATGAAGGATGTGGTGGAGAAGCTATCAACAGGAACCTTCAGgcCACTAGTAGAAAATCCTGTGCCTTTGTATGAAGCCACTGTTTCAATGGAGATGGTGCAGAGAAGACAACTCAGAAAGCGAGTCGTGGTGAAGCTTTAGGGGGAAGATTCTGGAACTACAAATTTCATCATTCCATGATAAAGGGACTATATATGCATATGATGAGGATAACTTTCTCAGCAGTcagtatatgtatgtgtttatttgcattgtgGATGGATTGTGGATGGTCACTTTTTTCATCTTTATTTAGGATATTcatcatataataaatatgtttaaataaaaaaatcatcatcaaTGAAATGGTTGCAAAAATAGTTAGACAtaaattagggctgtcaacgttcAAAATCAGTAacgcattaattttttttacgtaaataATTACACCACCAGGTTTGACCCGAACTTCCTGCCAAACTGACTTTTTTCTGGAGTGGTTCATTTATGGTGAGATCGTGATTTGATCTttatccgacccagctatcaaatatacttcttttcaATTGAGCTGAACTGCTGATTAGCCGCAGactaatctgatatattatttAGATAATCTACTGCTATGAAAAATGCTGCTCCATGGTGTTTCCACATGCAGtaatgtgcagcattcactgctcacatcagcGTTCTGTGTTATagcagcttcacactgaacagatatacacactggaacacagaatcttctcactattatttactttattgctCCAGCACcggacagctctgaccaatcagaggagacaatgtgctcgcctggtttattggtgcacattttggtacGTTTAGGTTTGTATCTGCgtgaaatcaaaccaaacagagggagaaaacgcttcaaataaacaaactcattaactgatccggaccataaaaacttttaaacaacCAATGCTGAGTGGGTTTTATCTCGCCTctaacatacaagtatatactagtgttttaactgacaccactaatataaatataaatataattgcattttaagcTTCTTACATTcataaatatccactataaaaacttgcatcttaagaTAAACAAATACGATTAAACAGTCACTAATTTCCGTCTTGTCggttggtgaaaaaaaaaaatttgatgagaatgtgtaatttaatttgaaacatatattttaatatgtggCTGAAAAgttgcattttaataaaaaaaagtgggcACAACATTGTAGACCAATTTAAACATGAAGTACAGTTAAcagtttcaatttttttttatcttttattatataaaacattgtaACATGTATCTGATTAAACATTTCAACATGACAAAGTCACATACCAAAAACCCTGCTTGTAATTGCTTCTTTTGAtcataaagtcttttttttgta

Function

symbol description
cryzl1 Predicted to enable oxidoreductase activity. Orthologous to human CRYZL1 (crystallin zeta like 1).

NR:

description
quinone oxidoreductase-like protein 1 isoform X4

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU139117 False 300 lncRNA 0.27 2 12483622 12522292
XM_007251339.2 True 2583 mRNA 0.40 14 12511717 12522303
XM_007251340.2 False 2562 mRNA 0.40 13 12511717 12522303
XM_022674725.1 False 2414 mRNA 0.40 14 12513191 12522303

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103032463 NA coding upstream 104660 12357030 ~ 12378962 (+)
arl11 NA coding upstream 425168 12056110 ~ 12058454 (+)
LOC111193615 mcf2l coding upstream 486895 11986919 ~ 11996727 (+)
LOC103035965 sox1 coding upstream 849847 11631733 ~ 11633775 (+)
LOC103036596 arhgef7,arhgef7b,LOC107718510,LOC107567796,LOC107746262 coding upstream 1033238 11404244 ~ 11450384 (+)
cbr1 cbr1,LOC108428204,LOC107746284,LOC107692178 coding downstream 12977 12535280 ~ 12539566 (+)
LOC103025394 NA coding downstream 24031 12546334 ~ 12561111 (+)
bcl9 bcl9,LOC107676875,LOC107746055,LOC107746285 coding downstream 46276 12568579 ~ 12733197 (+)
LOC103027506 gja8,LOC108258942,LOC107603011,LOC107566539,LOC107746070 coding downstream 239963 12762266 ~ 12767170 (+)
LOC103028151 fstl1,LOC103028151,LOC108428196,LOC108258944,LOC106575075,LOC105019681 coding downstream 263455 12785758 ~ 12815661 (+)
G102917 NA non-coding upstream 60805 12416419 ~ 12422817 (+)
G102916 NA non-coding upstream 68649 12414166 ~ 12414973 (+)
G102902 NA non-coding upstream 81368 12379091 ~ 12402254 (+)
G102907 NA non-coding upstream 115348 12366250 ~ 12368274 (+)
G102901 pdxkb,LOC108428208,LOC103021965,LOC102792432,LOC106527750,LOC107376125,LOC108247466,LOC107676865 non-coding upstream 160038 12319012 ~ 12323584 (+)
G103023 NA non-coding downstream 103896 12626199 ~ 12740168 (+)
G103025 NA non-coding downstream 132298 12654601 ~ 12676518 (+)
G103067 NA non-coding downstream 244913 12767216 ~ 12783303 (+)
G103068 NA non-coding downstream 252951 12775254 ~ 12782304 (+)
LOC111193478 NA non-coding downstream 259296 12781599 ~ 12783058 (+)
cab39l cab39l,LOC107676861,LOC107718429 other upstream 458858 12000639 ~ 12024764 (+)
map2k7 map2k7,LOC107676852,LOC107712243 other upstream 1188807 11274746 ~ 11294815 (+)
LOC111193528 NA other upstream 1613466 10868577 ~ 10870156 (+)
G102411 LOC107747660 other upstream 1957462 10525677 ~ 10526160 (+)
LOC103025691 NA other upstream 3647541 8797745 ~ 8836081 (+)
sh3pxd2a sh3pxd2a other downstream 328698 12851001 ~ 13032506 (+)
G103376 zgc:77880,LOC108439367,LOC107692630,LOC107723165,LOC103363053,LOC107758853,LOC105904859,LOC107590776 other downstream 1406762 13929065 ~ 13935667 (+)
G103490 LOC106510829 other downstream 1738322 14260625 ~ 14261539 (+)
G103551 NA other downstream 2096332 14618635 ~ 14619082 (+)
G103561 NA other downstream 2168740 14691043 ~ 14692199 (+)

Expression


Co-expression Network