LOC111193563


Basic Information

Item Value
gene id LOC111193563
gene name NA
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035908.1
NCBI id CM008311.1
chromosome length 31403898
location 25361744 ~ 25369439 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU143503
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>TU143505
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>TU143509
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>TU143513
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>XR_002650604.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU143503 True 3266 TUCP 0.39 6 25361744 25369439
TU143505 False 3266 TUCP 0.39 6 25361744 25369439
TU143509 False 1866 lncRNA 0.37 5 25361744 25369439
TU143513 False 2012 lncRNA 0.37 4 25361744 25369439
XR_002650604.1 False 884 lncRNA 0.45 3 25361871 25364321

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
slitrk6 slitrk6,LOC107674010,LOC107730399,LOC107558904,LOC107737039,LOC107574216,LOC107698122 coding upstream 259171 25076936 ~ 25102573 (+)
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LOC103035907 NA coding upstream 1722856 23632379 ~ 23638888 (+)
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LOC103022503 NA coding downstream 3367 25372806 ~ 25374832 (+)
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LOC111193460 NA coding downstream 115404 25484843 ~ 25519366 (+)
G106250 NA non-coding upstream 148275 25213203 ~ 25213469 (+)
G106248 NA non-coding upstream 149668 25211579 ~ 25212076 (+)
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G106205 NA non-coding upstream 563543 24797868 ~ 24798201 (+)
LOC103043670 NA non-coding downstream 31478 25400917 ~ 25401805 (+)
G106274 NA non-coding downstream 82698 25452137 ~ 25542268 (+)
G106273 NA non-coding downstream 86681 25456120 ~ 25548983 (+)
G106277 NA non-coding downstream 135367 25504806 ~ 25530624 (+)
G106281 NA non-coding downstream 154138 25523577 ~ 25526560 (+)
G106146 NA other upstream 948646 24411208 ~ 24413098 (+)
G106036 NA other upstream 1372152 23987207 ~ 23989592 (+)
G106017 si:ch73-12o23.1,LOC108439175,LOC108258846,LOC107722961,LOC107590719 other upstream 1437973 23915635 ~ 23923771 (+)
LOC103038624 zgc:77849,LOC103038624,LOC108439082,LOC107722949,LOC107692663,LOC107590708,LOC107564565 other upstream 2541648 22810079 ~ 22820096 (+)
LOC103045705 LOC107725350,LOC107692700,LOC108439093,LOC107565240,LOC108441473 other upstream 2772783 22525257 ~ 22588961 (+)
LOC111193565 NA other downstream 89376 25458815 ~ 25570821 (+)
LOC103037236 NA other downstream 784978 26154417 ~ 26171801 (+)
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Expression


Co-expression Network