LOC103042026 (mief2,LOC107725398,LOC107564637,LOC108258856,LOC107692671)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103042026
gene name mief2,LOC107725398,LOC107564637,LOC108258856,LOC107692671
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035908.1
NCBI id CM008311.1
chromosome length 31403898
location 22601210 ~ 22616958 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007260274.2
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>XM_022674891.1
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>XM_022674892.1
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Function

symbol description
mief2 Predicted to be involved in positive regulation of mitochondrial fission. Predicted to be active in mitochondrial outer membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in combined oxidative phosphorylation deficiency 49. Orthologous to human MIEF2 (mitochondrial elongation factor 2).

NR:

description
PREDICTED: mitochondrial dynamics protein MID49

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007260274.2 True 4171 mRNA 0.43 5 22601211 22616958
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XM_022674892.1 False 4169 mRNA 0.43 5 22601210 22616958

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
alkbh5 alkbh5 coding upstream 1356 22592638 ~ 22599854 (+)
LOC111193458 NA coding upstream 83634 22509446 ~ 22517576 (+)
LOC103046323 LOC108441470 coding upstream 120782 22313226 ~ 22480428 (+)
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LOC103037976 LOC103037976,LOC108437127 coding upstream 984774 21611572 ~ 21616436 (+)
LOC103042343 NA coding downstream 2072 22619030 ~ 22631714 (+)
LOC103041008 slc29a4,LOC108439098 coding downstream 54755 22671713 ~ 22689088 (+)
LOC103039247 LOC108439081 coding downstream 145480 22762438 ~ 22774207 (+)
LOC103045101 NA coding downstream 665773 23282731 ~ 23286928 (+)
LOC103044794 NA coding downstream 675235 23292193 ~ 23305156 (+)
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G105580 NA non-coding upstream 134411 22409426 ~ 22466799 (+)
G105547 NA non-coding upstream 347597 22253376 ~ 22253613 (+)
G105542 NA non-coding upstream 369890 22231007 ~ 22231320 (+)
G105501 NA non-coding upstream 608647 21990430 ~ 21992563 (+)
G105645 NA non-coding downstream 74693 22691651 ~ 22692463 (+)
G105654 NA non-coding downstream 89542 22706500 ~ 22706805 (+)
G105668 NA non-coding downstream 162312 22779270 ~ 22791181 (+)
G105760 LOC108439083,LOC107725390,LOC107692695,LOC107722958,LOC107564541,LOC107590710 non-coding downstream 308159 22925117 ~ 22928356 (+)
G105793 NA non-coding downstream 510997 23127955 ~ 23128154 (+)
LOC103045705 LOC107725350,LOC107692700,LOC108439093,LOC107565240,LOC108441473 other upstream 12249 22525257 ~ 22588961 (+)
LOC103046939 LOC107701771,LOC107725347,LOC107565259 other upstream 317757 22255085 ~ 22283453 (+)
G105357 NA other upstream 1232006 21327192 ~ 21369204 (+)
G105276 NA other upstream 1545727 20989273 ~ 21055483 (+)
LOC103038624 zgc:77849,LOC103038624,LOC108439082,LOC107722949,LOC107692663,LOC107590708,LOC107564565 other downstream 193121 22810079 ~ 22820096 (+)
G106017 si:ch73-12o23.1,LOC108439175,LOC108258846,LOC107722961,LOC107590719 other downstream 1298677 23915635 ~ 23923771 (+)
G106036 NA other downstream 1370249 23987207 ~ 23989592 (+)
G106146 NA other downstream 1794250 24411208 ~ 24413098 (+)
LOC111193563 NA other downstream 2744786 25361744 ~ 25369439 (+)

Expression


Co-expression Network