LOC103032361 (gpm6ba,LOC108434682,LOC108259029,LOC107552377,LOC107588840,LOC107654257,LOC107667658)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103032361
gene name gpm6ba,LOC108434682,LOC108259029,LOC107552377,LOC107588840,LOC107654257,LOC107667658
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035908.1
NCBI id CM008311.1
chromosome length 31403898
location 18009302 ~ 18082462 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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>XM_022674810.1
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gagaaaagaagagagagggagagcgagggagcgacagacagacagacggacggacagagagacagacagacagtgagagcGAGTCCAGCGTGCAGGAGAAAGTGTAGCTAATATCTGTACTCTCGGTAAGGAATTCCAAATGGATGGAATGAAACCAGCCATGGAGACGACGGCCGAGGAGAACCAGGACGAGAGGGAGGAGAGCAAAGGTTGCTTGGACTGCTGCATTAAGTGTCTGGGCGGGGTGCCGTATGCCTCATTGGTGGCCACCATCCTGTGCTTCTCGGGTGTGGCGCTGTTCTGTGGCTGCGGACATGTGGCACTGACGGGCACCGTGACCATGCTGGAGAACCACTTCTCCCGCATCACATCTGACCATGCCACCCTTATCGACGTCGTCCAGATTCTGCAGTACATCATCTACGGCATCgcctccttcttcttcctctatGGCATCATCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCAGCGCCGTCAAAGAGATGCACAGCGAGTTCAAGACCACTGTGTGTGGGCGCTGCATCAGTGCCATGTTTGTGTTCCTGACCTACATTCTGGGCTTGGCTTGGCTGGGCATCTTCGGCTTTTCCGCTGTGCCTGTCTTCCTCTTCTACAACATGTGGACCACGTGTGCCGCTATGAAGTCTCCCATCGCCAACCTTACCTCTGTGGACAACATCTGTGTGGATGTGAGGCAGTACGGAGTCATCCCTTGGAATGCTGATCCTGGCAAAGCATGTGGGCAAAACTTGGCTGATATTTGTAACACCAGTGAGTTCTATTTGTCCTACCATCTGTACATTGTCGCatgtgctggagctggagccaCTGTGATTGCACTGCTCATCTACATGATGGCCACCACGTATAACTATGCTGTGCTGAAGTTTAAAAGCCACGACCACACCCACACCACTAAGTTTTAAACCCGGGGGCTTTTTAAAGAGGGCAACCGCTAAGTGTGGACGAGTGCTCTGACTGAGGGAGGGAAAGGGTGAGGGAGGTAGAAATGTATTgagggatagagaaagagagagagagagagagagagagcgagggagagaggtagagttaaGGAAGAGTGCTACTGACACCATGGACCATACAGTAGCTTACTGAGGATTACGTTGATCATCAGGATGATGTAGTGCAGTAATcgtttcttgtttcttccttGTCGTAATCAAAATGTGTGTTTGGTCTCTAGTGAAGAAAGCCCATTTAATTCATTGACCCTGCGTTTTTTACCatggattttctttttgttaatcCTCATCTCTGTTCATTTTGTGTTCGTTGAAAACCGGATCTTAGAACTTTTGCTGGCCAGCTACGTCCCAGCAGACCACTTGTATTAACTTGTAACACAATGCCCGTCCACTAGATGATGTCTGTCCTATAGAATCTAATGCATAGGATTAAGATCAGGCAAGTAGAAACAGGCCCAGGATCAGTATTCAAGGACACGTTCTGTCCATTGGATTATGCAGTACACGCCCTGAGGCACCAGTGGTTAAGAATTGGTAGAAATGGCAGGTTAagtgctgtgtgtagctgtgtagAGCTTAAACGGAAGGACAGTTGTTTTTTGgaattttggttttgtttttgggGCTCTAACTCAACTTCTATTCACTCGTCTTCATTGTAATCTTTGAATTGATAATTGTACCAGTGAAGGGCATGAATCGTACTTTACACTGATCCTGAGAGTATTATGTTTTGTTGTGCAGAACTGGAACTAGCAAACACGTGTTAGCTACTTTTAGTGCCCTTGATGTGGTGTTCAACACTGACTTTCAGCTTCGTCTGATGTTTTGTTCAGATTTAGAGTTGCTTTCAGACCAGTAGAGGCTATTTTCCAACTTTTCATGATGggaaaataaaggtttaataTGTAGAA
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Function

symbol description
gpm6ba Predicted to be involved in negative regulation of serotonin uptake and neuron projection development. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in membrane raft and plasma membrane. Is expressed in nervous system. Orthologous to human GPM6B (glycoprotein M6B).

NR:

description
PREDICTED: neuronal membrane glycoprotein M6-b-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gemin8 gemin8 coding upstream 2791 17998315 ~ 18006511 (+)
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G104656 pcdh8 other downstream 836598 18919060 ~ 18923203 (+)
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Expression


Co-expression Network