G56567


Basic Information

Item Value
gene id G56567
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000009
NCBI id null
chromosome length 16003125
location 10518816 ~ 10533725 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU64426
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU64426 True 14799 lncRNA 0.37 2 10518816 10533725

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000009_10491868_10508777 NA coding upstream 9807 10491401 ~ 10509009 (+)
CI01000009_10477699_10485965 NA coding upstream 31463 10476658 ~ 10487353 (+)
CI01000009_10454695_10474253 SLC12A8 coding upstream 44563 10454036 ~ 10474253 (+)
CI01000009_10445879_10449126 ZNF148 coding upstream 69566 10445879 ~ 10449250 (+)
CI01000009_10427119_10442186 SNX4 coding upstream 76565 10427119 ~ 10442251 (+)
CI01000009_10555555_10560050 NA coding downstream 20625 10554350 ~ 10560398 (+)
CI01000009_10583435_10617169 MAP2 coding downstream 49710 10583435 ~ 10617169 (+)
CI01000009_10644080_10691030 CPS1 coding downstream 110355 10644080 ~ 10692050 (+)
CI01000009_11342784_11347580 NA coding downstream 809059 11342784 ~ 11348827 (+)
CI01000009_11434018_11455253 NA coding downstream 900067 11433792 ~ 11455635 (+)
G56579 NA non-coding upstream 6176 10512413 ~ 10512640 (+)
G56564 NA non-coding upstream 165132 10352929 ~ 10353684 (+)
G56393 NA non-coding upstream 214331 10303482 ~ 10304485 (+)
G56540 NA non-coding upstream 226257 10290459 ~ 10292559 (+)
G56509 NA non-coding upstream 229304 10288850 ~ 10289512 (+)
G56548 NA non-coding downstream 97373 10631098 ~ 10638452 (+)
G56594 NA non-coding downstream 162001 10695726 ~ 10696013 (+)
G56628 NA non-coding downstream 181885 10715610 ~ 10715888 (+)
G56633 NA non-coding downstream 188169 10721894 ~ 10722336 (+)
G56695 NA non-coding downstream 297267 10830992 ~ 10860154 (+)
CI01000009_09853929_09854476 SAP18 other upstream 662229 9853929 ~ 9856587 (+)
G56100 NA other upstream 1388530 9129300 ~ 9130286 (+)
G53651 NA other upstream 4270424 6245564 ~ 6248392 (+)
CI01000009_05931829_05943829 KCNH3 other upstream 4586015 5931718 ~ 5943899 (+)
G53388 NA other upstream 4979762 5522242 ~ 5540638 (+)
CI01000009_11761868_11765848 ORMDL1.S, ORMDL1 other downstream 1227061 11761606 ~ 11766944 (+)
G57811 NA other downstream 1400217 11933942 ~ 11935251 (+)
CI01000009_12432736_12435509 NA other downstream 1898833 12432538 ~ 12436017 (+)
G57682 NA other downstream 2291744 12825469 ~ 12892339 (+)
G57691 NA other downstream 2372719 12906444 ~ 12918465 (+)

Expression


Co-expression Network