LOC103026436 (LOC108411506,LOC103368653)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103026436
gene name LOC108411506,LOC103368653
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 30449364 ~ 30512826 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU30513
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XM_007252919.3 True 8749 mRNA 0.47 19 30482310 30512826
XM_007252920.3 False 8618 mRNA 0.46 18 30482309 30512826

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103028785 LOC103028785,LOC108412595,LOC105899448,LOC107695994,LOC107582101 coding upstream 153446 30283641 ~ 30295918 (+)
LOC103041619 NA coding upstream 199616 30227545 ~ 30249748 (+)
LOC103043161 NA coding upstream 269557 30174820 ~ 30179807 (+)
LOC103029213 NA coding downstream 559321 31072147 ~ 31076057 (+)
LOC103029526 NA coding downstream 570679 31083505 ~ 31089458 (+)
LOC103029852 NA coding downstream 586745 31099571 ~ 31103340 (+)
plb1 NA coding downstream 608569 31121395 ~ 31149177 (+)
LOC103028275 ppp1cb,LOC107583611,LOC108426284,LOC107582864 coding downstream 637600 31150426 ~ 31162648 (+)
G22614 NA non-coding upstream 2407 30440505 ~ 30446957 (+)
G22576 NA non-coding upstream 144748 30304295 ~ 30304616 (+)
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G22556 NA non-coding upstream 184718 30264370 ~ 30264646 (+)
G22456 NA non-coding upstream 443870 30000115 ~ 30005494 (+)
LOC111195805 NA non-coding downstream 3369 30516195 ~ 30519886 (+)
G22626 NA non-coding downstream 21502 30534328 ~ 30535041 (+)
G22635 NA non-coding downstream 57601 30570427 ~ 30583460 (+)
G22636 NA non-coding downstream 73639 30586465 ~ 30586802 (+)
G22638 NA non-coding downstream 101711 30614537 ~ 30614862 (+)
LOC111195794 LOC107569315,LOC107712034,LOC107751710 other upstream 185514 30259308 ~ 30263850 (+)
LOC103034207 ube2w,LOC107585923,LOC103354920 other upstream 1267233 29171008 ~ 29182131 (+)
pabpn1 pabpn1,LOC107596039 other upstream 1281451 29152052 ~ 29167913 (+)
G22276 NA other upstream 1460533 28988568 ~ 28988831 (+)
LOC111192074 LOC108249465 other upstream 1801176 28645061 ~ 28648188 (+)
G22834 NA other downstream 981519 31494345 ~ 31494898 (+)
G23086 cpsf2,LOC107704064,LOC107548411,LOC107559080,LOC107669458 other downstream 2309518 32822344 ~ 32826939 (+)
LOC103042732 NA other downstream 2324226 32837052 ~ 32841346 (+)
LOC103037425 LOC108426312 other downstream 2563798 33076624 ~ 33081862 (+)
LOC103036694 LOC108426313,LOC108257731 other downstream 2570816 33083642 ~ 33169392 (+)

Expression


Co-expression Network