G58893



Basic Information


Item Value
gene id G58893
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000009
NCBI id null
chromosome length 16003125
location 11708987 ~ 11709175 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU67055
GTTCATCAACATGCTTTCTCATTCTCCTCTGGAGTAACCGAGACTGGTGACGAGGAAGGCGCTTCTGCCTGTTATTAGTGTGGATTTATCGCAGTTTTCCTTTTAAATAACGCATTTCGATGTGGATTAAACGATTTCTTCGATTTTTATATCCATAATATTGACGCTTGCAGCCTGCAGTCCGAAGGGGGCAAGTGTGAGAATGCTATACATCATGGCTGACCATCTGGAGTGTCTCAACTACACTTTGTACAGAAATACCTACATTCTAGCTTCTTACCCATACAAAACCCTATAAACTGTCAACCAAGGGAATAAAACCTCTGTATCAGGCCATCTTTGCATCTCTTCGCCTCACTGCTTTCAAACCAATGCTACATTATTTATATCATGGGATGCATGAAATCCAAGCACCGCGACCCTACTCAGAATGCCAGCTCATCGGAGAAAGTGGATGGCAAGTCAGGAAAGCAAGGAGATAAAGCCGTTCTAGTTTTCTCAGAGATCGGCTCCATGGAGGACTCAGTGCAGGTCAATCCAGTACTGCTGGACTATGCCCAAAGACTCTCAGAGGAAATTGTGGCCCGGGCAGTACAACAATGGGCAGAGGTGGACAGCCGGTACAGTGACATCCCCTACATTGAGTGTGACGTGCCATAAGTTTTTAACTGTGTGGAATAAGATTGGATTGGTCTGGCTCACTCCTCTCCTGTATGTACTGTAAAAGAGAGCTTTCAGATCAACAAATGAAGGCCAGTGGAGAATCATGTCATTTCGGGAAGAGGTTTTCTTAAGAAATGGCCATGGAGCTGTTATAATACAAGACTGCATCTTTTTATGTCTCTTGTTTACCCTCAAAGCCCAGTTGTTTAATTGGAGAGTCCCTGAAATTGTCCAAAGGCCACAATCTTTCCAACCATGTTAATTATAGACTTCATCTTTTTGCCTTTAGTATTTCATGTTTATGTGGCTCAGCACATCAGACAGTACCTCATTTCTATTTTCCATCCATCCATCCATCGGTCTTAAGGTGTGGTCACATTGGCTTTCTGTGAAAAAGGTTCATTGTCTGTTACCACTTCAATCCAAGTCACTTTCAAACCAAGCAGCTTTCTGTTGGTCAACGTAGTGAATCTGAGTGACCAACTGTACCTGTAGCGAAATCTACATGGGCAAACCTTTCGCCCTCAGATTAAATTCTCAATCACCTATTTAAATGACTGGATTTTCGCCATGGATTTTGCTGAACAACAGTAAATGTTACCACACATTTACAGAGCATCCGCTCAGGGGTCACGGTTTCTCTTTAAGGGGCCAGTGCTGGCTTTTAGGGATCAATAGGTGTACATTACTTCACCGGTAACCTTTTTTTGACATGACAGCTGTGTCAACTGTAATTCCTGGTACAAAATCAACGACCTTGTGGTCACTATGGCCAGACATTGTTTATCAATGACACATTCTTAGATTTAGAGCTGTTTAAAGATCATCCTGTATCCTCATGATGATGGCATGAGAGAATACATTCGAGCAGAAGGATTATATCCATCCATCCCAAAATTTGTGTATCAAGCCATTATATAATTTTGTTAATTTAAGTTTTTTTCTGTGCAGATCAAATATGCAATTCTTAAAGGCTAAGAAGATTTAAAAAGAAACTGAAAATTACATATTGCTACCAAGACTGCCAAACCCCTCACTAAGAGAAAGAAAAAATTCAGACTGGGGACCAAACACGCCAATGTCCTTAATGATCGTTAATACAAGCACAATTACTCTTCTGGTAGTGTTTTAACAGCTGCTCACCAATGCTTTTTATTGATGGATATATTGGCACTTCTGGATCTTGTGCCATGCTGTCAGGTAGCCAGAATCCCTTTAATGATTTCCAGATCAATAGAGTGCAACAGTTGGGTTCTGGAAGTAAAAATCACATTATTTTTCTCCATAGAGATCGATTTTTAATGATAAATGTATAAAGCTTTTAAAATCTACCTGAGCTCTGAGGTGGTTAACTGATGATATATGCTTCTTCACAAGTCAGTGTGTTTTCAACTACATAAAAAAAAACTTAAATTCAGAGGGAAGGATCTACTTATAATCATAAGGTTACCATGAAAATCTGTTCTGAAGGAACTCGCCAGTGACCACCCTCTCCCATAAAGCATTTTGAATCCTGTAATCAAATAAATATCACAAAAAACTTATATTTTTGTATATGTCAGAAAATGTTGTGATTAACCTAAAATTTTAGGTTCACAGTTTTGTACCTTTGTCTTGTTTTTCAGATTACTTTTTTTTTTTTTGCTTCAAATAAAAGGTTGTTGGAGCTGGCTGTTTGGTTCATGGCTTTAAACTCTTTACTGAGGACCATTTTCAAATCCCTATGGAGAAAATGAACGAGAAAATTACTTCCAGAACCGAGGCCACTGAAAAAGTGGGTAGTCACTGTTACGGCCTGTTGCAAGGAGCAAGGACTGCACTTTGACCATTATACTTTTGCATAGAAAGTCATAAATGCAGAGTGAAATCATAAGATATAAAAGAAGGACTTAAAGTTGTATTTTACGAGGCCTTTCAGCACATTACTTAATGTGCTCAGAGTAGAACTTCAGTATATCTCAGTATCTCAAAGAACAATCAGTACATGATTCATGGTGTTCATTACTCTCCTTATCTTCCTTAATTATAATAGGCCAATAGAACTAGGTCATATTTGGTTTAGGATGAACTAATAAAAGTGTGCGATCATGTATCACAGAAAAATATGCTTCAAATAAATGAATTAAATAAATAAATAAATAAATACACTGCAGTCAGACTACATTTGTACCAGCTTGTACTGTCAAGCTGATTTCTCCTGAGATCTCCATCTCATAAATGTTTGATGAGGTGCTGATGATTCTTACCAAAATGGTTGTCTTTCATATTTCAGTGTATATTTCAGACAGAAGTGTTTTACCTGTAATCTGTGCAATCTCAGTTCTGTAACCTAAAAAAAAAAAAGGGAAAAAACACTGCAATGCCAATAAATAAAACAACGGCCTTCCTCGATACCTCAGCTGTTACCTTCTTTCAGTTTCTTCTGTTTCATATTTATCACATAACTTTGTAACATGACAGAACAACTTTAAAAAATGTCTTTTATCATATGGTCCTTCGGTCCCTCCTTCAGTGCAAGTCTATGGGAATTTTAACCCTCTACACAAAATGTCATACGATTTGAGGTAACATTCATGACCATAGGGGCTTTCGGACCGAATAGTTCTAGGAACTCACTTATAGGAACTAGCCACTAGGATAGTTCCCCCGAGAACTAATTTCTCCCCTGGGCCATGTTCCTGGTTGCATTCGCACCGGGAATATGAACTCTGAAGCGGCCGACAGCGGCGTCTTTAAGCGCGGCATTTACAAACGCTAAAAAACGGTGGATGGGGGATGCCGTGATCAAAGCTGTGTTTGTTGTGTGTCGTAGGTTTCGTGATAATGGAGATGGAATGTAAATGCAGAATTTATGCGACTGAAACAGTAAAAAGTGGGGCTAAGAGACGAAATCTCCTATGACAACTTTCAGTATTACATATCATCGAGGCAGAGAAAAGAACAGAACCCTGCAGACAACAGGTAAATGCTGCCATTGCTGTTTTCCATGTTTGTGAAGTAAATATGTTTACACAGCTTTTTAAAAATGCCGGGTGCCGGTGTTTGACCTGCGTTTGACCAATCACTGATAGTTCCTATAGTCCTGGTTTAGACCCTACTCTGAAGTAGGAGCTAATTTAGTTCCCCCAAAAGGAGTTCCTAAAACTAAAATCGTTCCTAGTTCCTGCAGTGAAAATCCGGGTACTTCAGCCAATAGTTCTAGGAACTGTGAAAAGGTTCCTCCGGTGCAAAAGCCCCTCATATATACAAACGGCGTGTCTAACTTTACTACTTAGGGTTAGGGCAGAACTCTATCCCTAGTATTTTCTAATTAGCTCAATGAATGCAGAAAATCAGATTATTTTTTTATTTTTTATTGAGAGGTACTGTGGGCATGTTAAAATTTTATGACATCTGCTATCAAAATCAAAAACAATCTTTTTATGTTTTGTTTTTGCACAAATATAGGTCACACACATTTTATGAACATCCACAGATATATGAGCAAAGCAGAGGAGAATCATTTGAATTCAAGGCATCACAGTTGTCTCGACATCATTCAGATTTATTCTAAACAAGATACGTTTATAGTCTAGGCCAGTGGAACTGCTTGTGTAGTAAACACTGTGGTTAATGGCAGTCATACTGCATGCACCACATGACAATACTTTAATCCCGCCAAACTGAATCGTGACCAGGGTATGTGTTAAGGTTGTCAAGGTTAATCATGGATTGCAGAATGTGCAAAAATAATTGTCTGCCATTCTCTTTTCACAGGATTTACACAAATGATTACACAGTATGGAGGAAAATGACACCTCTAAGAATGAAGTATGCAAGATCTGATTCCCAACACCTCACCCTGACAAGTCTGCTGTAAATTCATATTGTCATATAGTTCACCCAAAAATGGAAATGCTGTCATTATTTACTCACCCTCATGTCATTTCAAATATGTATGCTGGTATTTTGTCTGTGGAACACAAAATTAGAATATTTGTAGAACCTTATTCTAGTTCATTTTATATAAAAACCTGCATGAAGATTCTTCAAAATTCTAAGATTAAAAATTAAAAGTAAAAGCATAAATGTCTGAAATGGGGTTGCGTAAATAATGACACGATTTGAATTTTTGGGTGAACTTTTCCTTTAAAATATGACTAGGCTGCTCTCAATTGTTAGCTTATTTTAAATGCCATTTCCCAGTGGAGAAAAGAAAACTCTCTAAACCTCTGAATTTCCGCAAGAAACCAGCATTGTTCATTTCAACACAAGGATCAGCAGATCTTTGCAGAAGTCTCAGAGGAACGTTTGCTTTAGCTATAAGCAGCAGAATTATTTTTGCATTCGTCAGTTCT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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU67055 True 189 lncRNA 0.38 1 11708987 11709175

Expression



Co-expression Network


Homologous


species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
tiger barb (Puntius tetrazona) G71667 cunh2orf88,LOC107728910,LOC107657540,LOC107714370,LOC798500,LOC103027948 non-coding NC_056707.1 CM032076.1 19667000 ~ 19671164 (-)