G57719


Basic Information

Item Value
gene id G57719
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000009
NCBI id null
chromosome length 16003125
location 11815069 ~ 11822531 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU65750
GCACCAAAAATATTCTCGTCGCTTTATAATATTAATATTGAACCACTGTACTCACATGAACTGATTTAAATATGTTTTCAGTACATTAATGGACCTTGAGAGAGGAAATGTCATTGCTAGCTACGCAGGCCTCACTGAGCCATCGGATTTCAACAAAAATAACTTAATTTGCGTTTCGAAGATGAACGAAGGTCTTACGGGTGTGGAACGGCATGAGGGTGAGTAATAAATGACAGAATTTTCATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTAAGTTAAAATTAAGTTAATTAAAATTTTTAAAATACATTTTTTGAGGATTTTGTTAATGTTTTGTATTTTCCAGGTCTTAAAAACACGATTTAAAAACCCAGGTTTTCCACTGCTGTGGGAACCCTTCATCTAAATCTGGAGGGGAAAAAAATAGATTAAAAAACAAAAACAACAACAAAAAAAAAAACATTTACACTGTCCTACGGTTATGTTTCTATGCGTTTTCAGGCCGTTATGTGATTAGAATTATCACTGAAGTACCGTGTTTTGGGTGAGGAAATACAGCTGAGATCTGTTGAGCCACTGAGAACTTTCGTCACATTTGTTCAACGGCTCCTCTCGAGGAACAAAGATGGCACGATGTACTTTCTCTGAACACACTTTCTTCTGGGTGAACAGAGGCCGTGGTTCGCTGGGTTTGAAAACAAACACTGTACAGAGACCAAAGAACACATTAAAAGCAGCTTGTGCTTAACTCTTAATGATACATTAAAGAAAGAAACAAAGAGCATCAATCATAAATAAGTGTGTATTTATGATTGATGCTCTTTGTTTCTTTTCTTGCTACGTATATTGCTAATCAAACTCTAAGGAGATGAAGAATGTCAAGAAGCGATGACCGTTCAAACACTTACGGTCTGTATGTTTAGACTGGTATGAAAAGGCAGCCACATTTTCTGACAAGGGGTCTGGCTGCAGCTTGGAAACTTCCAAAGATGTGCTCCATTCCACTGTGAGCAAAGGAGATTTGACATTACATAAAACTGACCATGCAAAACCAAACCAGGCTGAACAAATCTAGTTAAAAGGAGAAGTTCACACAAAAATAAAAGTCCTGGCATTACTCACTCTCATGTTGCTTCAAACCTGTATACTGTTGTTTTTTCAAACGTTTATAATAACCAAGGGCTGTCAAACTCCTAAAAGGACCAAAAAGCCCATGAAAGTGCCATAAAAGCAGTCCATATGACAGATTCAGATTCAAAATGGTGCTTTTTGGAGCTTGACAGCCATGTTTGCTATGAAATGCCATTTTATATATTTTTATATTTTTATGTCATATTTTATATGTATTTTTATGTCTACAGATTGTTTCAAAAATGTTCTTTTTTGGCTGAACTATCCATTTAAGCTGGCTTGTTCAATTGATGCCTCATAACAAAATTTTAAAAGCAACTGAACCAATATTAATGAGCACTTACATGCACAAGTGAGGAGATTCCAGCAGCAGAGAAGGTTGTTGGTGGTGGTGCCAAGCAGGTATTTGGAGCAGCTTAATCGGCCGAAACAAAGGTCCCTGGTAGATCAGAGTAGCTGCCTTTAGTTAGTTTCAACAATTCAAAGACCACCGTGATCAGAAAGGCCCATGTCACTTACATATTTCATCAGATTAGTCTCAGTGCATGATAATCAGTTGCCTTACTGTTAATCAGAAACTGTGATACAACAGCAACGAACATTATCAAAAAACATTTACAATAAATATGACTGACTTCTTAGAATTGTACCCAAGTCTACAAATAATCAAACAGATGCACTTTTTCGTGAGATAATATAAATCAAATATGGCGCAAAGCTGCCCACGACTTTATGGCTCACCAAATCAGTGTGAGAGGATTGGAAATACTGTACAAAGCAGATTTAGCACTCGCTGAAATTTCGAATTATTATTAACTACATACTTACCTTCTATGCTTCATAATACAGTACATAATACAGTAAAATATTAAACTTTAAAGAATAGTTTACCCAAAAGGTGAAAATTCTGTCATGTTGTCATATGACAAAAGACACTTAATGTACTGTCCATGTTTTTTTTTTGCAATTACAAAAATAATCAAACTTAAATTACAGATTTTTCATGTTTGGCTGAACACTTCCTTTAAGGCCAATTTACTTGTGTTGCCACGATCCTTGAAATTCTAACTACGATACAATAGTTAAAAAAAGATTGATATTTAATACATTTTTGATACAAGTAAGCACTGCCACAACATTAAAGGGAAAGTTCACCCAAAAACATAAAATGCCATCATGCCATCCCTGATGTATATTACTTTCTTTCTTCAGATAAATACAAATGAAATGTTTATGAAAATGATCCATTTCTGTGAGTCAATATAATGCAAGTGATTGTGTGCCTCTCAGTTGACACTTGAAAATCTCAGTTGGCACTTTTCCACTGGATGGTACTACTCGGCTCGCTTTACTTTTCCCACTGCAGTTTAGTACCGCTTCAAAGTGGGTGGGATTATAGACTGATCGCATAGTTGCGCCGCCTCCACTGTCGTGGATCCCCTTCTGGGCTACCAACGAGTCTGCACCTCATCTACTGACCACGATACAGCCATTTCTTTTTTCAAGTTGTATGCGACGGTTGTTTAAAGCAAGTTGTTTCGCGAACAAATGATACTGCGGTGGCTGTTACTGACTATTTAAATCTAGCGGGTTTGGTGTCTTGTGTTTTAAATTCAATGACGCTGGTAGTGACGATTCTCTCTGACCAATCAGTGATCTGCAGTGTTTACGCGTCACATTTAGTATTGGTACGGCTCGCTTGGAACCTCAACCGAGGTGGTACTATTTAAGTGAGCCGTACCGTTCTGTACCGAGCCGTCCCATGCAGTGCCATAAGCACAGTGATCGTGACTGTAATCCATACAACCACAATCTTCTGAAGCGAAGCGACAGGTATGTTTAAGAAAAATACCAATGTTTTTAAGTTTAACAACTATAAATCAATGCTTCCAGTCTACTGTCATGAGGGGGACATGGTGACACTTGACATTGTGTTGAAGCTTTCACAAGTGCGAGAAGTAATGCAGAAGCGTTATTTTTCTTACACACACCTATTGGTTTGCTTCATAAGACATTGATTCATCCACTGGGGTCGTATGGATCACCATCACAATTGCTGTGCTTGGTTTTTTAAGTGTTCATTTTTGGATGAACTATCCCTTTAAGGGTAAAGGGCCCTATTTTAACGATCTAAGCTCATGGTCTGAAGCGCATGCCGCAAGTGCACTTAGGTCATGTCCGAACCCACTTTTGCTAGTTTAACAACGGGAAAAAATGGCGCGCCCGGCGCATGGTCTAAAAGGGTTGTCCCTACTCTCTTAATGAATAATGAGTGTGTTTTAGGCATAACGTGCAATAAACCAATCAGAGTTTCATCTCCCATTCCCTTTAAAAGCCAGCTGCGCTCACGCCACGGCAGTTTCGCTATTTACATAGCGGGATTTGCAAGCGGAAAAACTGAACGCTTCTCCAGAGAGGAAACACATGCAGACCATCTACAGGACAAGCCGGATTCCACCAAAGCATTTTTTTTTCTTTATGCACACAATAATAATCTTTTACACTGTAATCCTTTTATTTTTAATATTTAGCATGTTTGTGTGCTGCTGCGTGTCCCTATGTGTGTAATAAGTAGAGTGTATGTGCGCGCACCTGCATATAGGCGCATATTACTAAACACTCTTTAAATAAAAAAAATATCGTGCCATTGACTTTAGACCAGGTTTTTGTTGGTCAATGGCGCAGTCTATTTCAGTTGCCTCAAAATAGCAACGCGACAACAATGCACCTGAACACACCTCATTTTCAGACCAGCACGCCCATGGGCGAACAGACGGGTGCGAGTGCATTTGCTATTTAAACAACGTGGCGCAGGACGTGAAAACGATAACTGCGTCAGGCTGAAACTAGCAAAAAACACTTGTCGCACCTGGCGCTGCATTGCGCCGTGTATATGATAGGGCCCATAAAATCTGAAATGTCTCGAATTTACTTTTGATCATTATCAAAAGGTTTTCTTATCAACAGAAACCCTGTTGTCTAAGATTTATCCAGCCCGATAGCTCTATTAATAATAATAATAATAAATTATTTATTAAAATAAAAATAAAGATTTTCATGGTGCATGCTGCATTCCCAAATATGTGTTAAACTCACATCACATGCAGAGATAAAGTTTGCACCATTTACCATGAAATGAGAAGCTTTGCTCTGAAATGAGAATCTTCGCTCTTTCGAAATTTACTAATTAAATTTCGATACTGTGGAAAATTAGTACTGAAACCATTTCAAATTTCAGTATCGAAAAAAAAATAATATTTTTGACAACACAATTTACTGCTTGTGTGATACAGGGAGGTAAGGAAGAACTGAGAACAGTTGTTGACAAGAAATGTCATGTACTTTTTATCGTGATGTACCCTAGCTGCACCTAACGAACTTCCTTTTATTAAAAACAATGACACAGAGTGAAACTGTGTGTCCCTGGTGACCCTGCAGAGGATGGCTTGCATCCAGCTCCTTAAACAGGACTGAATCCCCAGTCTGTCTGGCCAGCATCTAAAAATTAATTGCTAAGTTACCACCATTCAACTGTGCGGACAGTCTGAAAAGAGCTCAGTGAATGCAGCCCACTGCACTGAATGGAATACACCTCTAAAGGCTGTAAGTTTTTAATAAGGAAGCTGTGAAATATATTCAAAACACATCAGAAAGAGTTTAGACTGGCTGATTTGAAGACAGGGAACATCTAGTATCACCTTATTTCTCCAGGTGGCTGGCAGAGGGTGGTGAGCAGCTCCCAGGTGTCCGGGCTCCATATGGTGATGACTTCTTGGAAGCTCACCGCCAGGAGAGAGCTATCGGCTGAGAAACTGCAGTTTTTGGGCTTTAAGTTATGGTAGCTTCCCACAAAATCACACGACCAGAAGTTCTGG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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU65750 True 7392 lncRNA 0.37 2 11815069 11822531

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000009_11803818_11808988 SLC40A1 coding upstream 5834 11802384 ~ 11809235 (+)
CI01000009_11789703_11791511 NA coding upstream 23333 11789703 ~ 11791736 (+)
CI01000009_11769442_11773619 OSGEPL1 coding upstream 41450 11769442 ~ 11773619 (+)
CI01000009_11761868_11765848 ORMDL1.S, ORMDL1 coding upstream 48738 11761606 ~ 11766944 (+)
CI01000009_11711277_11714191 MSTN, GDF-8, MSTNB coding upstream 100375 11711160 ~ 11714694 (+)
CI01000009_11835682_11873220 STAT4 coding downstream 13151 11835682 ~ 11873330 (+)
CI01000009_11875722_11882183 STAT1B, STAT1 coding downstream 52955 11875486 ~ 11882921 (+)
CI01000009_11892226_11892558 NA coding downstream 69695 11892226 ~ 11892677 (+)
CI01000009_11993879_12004644 NEMP2 coding downstream 171113 11993644 ~ 12004765 (+)
CI01000009_12022660_12022944 NA coding downstream 200029 12022560 ~ 12023388 (+)
G57790 NA non-coding upstream 27285 11787576 ~ 11787784 (+)
G57789 NA non-coding upstream 27743 11786904 ~ 11787326 (+)
G57787 NA non-coding upstream 34502 11780329 ~ 11780567 (+)
G57786 NA non-coding upstream 36964 11777839 ~ 11778105 (+)
G57772 NA non-coding upstream 57406 11746377 ~ 11757663 (+)
G57792 NA non-coding downstream 12207 11834738 ~ 11834960 (+)
G57813 NA non-coding downstream 115847 11938378 ~ 11938639 (+)
G57724 NA non-coding downstream 345000 12167531 ~ 12168221 (+)
G57737 NA non-coding downstream 348832 12171363 ~ 12172140 (+)
G57850 NA non-coding downstream 366014 12188545 ~ 12188820 (+)
CI01000009_09853929_09854476 SAP18 other upstream 1958482 9853929 ~ 9856587 (+)
G56100 NA other upstream 2684783 9129300 ~ 9130286 (+)
G53651 NA other upstream 5566677 6245564 ~ 6248392 (+)
CI01000009_05931829_05943829 KCNH3 other upstream 5882268 5931718 ~ 5943899 (+)
G57811 NA other downstream 111411 11933942 ~ 11935251 (+)
CI01000009_12432736_12435509 NA other downstream 610027 12432538 ~ 12436017 (+)
G57682 NA other downstream 1002938 12825469 ~ 12892339 (+)
G57691 NA other downstream 1083913 12906444 ~ 12918465 (+)
G57701 NA other downstream 1184112 13006643 ~ 13023138 (+)

Expression


Co-expression Network