mtmr9 (mtmr9,LOC107746110,LOC107701508,LOC107723304)


Basic Information

Item Value
gene id mtmr9
gene name mtmr9,LOC107746110,LOC107701508,LOC107723304
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 59064473 ~ 59112315 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU39324
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>TU39325
ATTCACACAAacacacacacactatactaacACTATCAAATGTATTCTTGCCTCTTTAATTGCTTTCCAACACTGTTATTGCTAACAGAAAACTGGCTTGAGTGTAGCCACTACTTGCTTAATATTTTTAGTGGGTGGTGGTTGATTTTCGTTTCTCAGAAACAAGGAGTCACTGACAGTAAATGATTGCTTCATTCACTGAAACTGTTGCAAATACTTTGTTGACTTACAGTAGTGAATGACTTTACCATGAAAGGTCTTTTAAATAGGTAAAAGTGGGTATTGTTTTGTGTGACCACGATAAGGATGCCTGTTGGTTTCACAGGCTTTGGTTTAAAAGCAGCATGGTATTAAACACAAGAAATGTAATGATTTAAGAAATGCCAATATACATTCAGGTCCATGAGTCTTTAGGCAGTgacacattttctcattttgtctATGTACAACCCAGCAATGGATTTGAAATGAAGCAGTAAAGGTTAGCCTTTTGTCATCTTTTTAGAAAAGTACTATATTGTTGACTCAAAGGGACCAGATTTCTAAAAAGAACAGATAAATTGACAAGCTCAGCAGTACCAAGTGGACCACTGAAGATACCTTAAGTAACgataatcccagaaaaaaaatgacatcagtGATCTTTAAATCAAACCAGTtgatcatctttttttttacctaattaagACAAAACTGaagacatatacagtatatacacatatacacagcaTATACAGAAAAAGACATTACCTGATAGAATGTAATTGCAACAGAGCATTAAAAATGCttcttaatatttataataattagttTATACTATGTATGTTTGTCCAATGTTAAGCCTATGCTGtgctattaaaaatataaatggttaataaaaatactttgttATATTTgtcaaagtaaattaaagtcTTCACTTTAATCACATCTTGACTGCTTCATTTAAAAACCACTGAGGTGGAGAAACATgacaatgaaacaaaaaatgGTTAACTGTCCAAATACTTCTACATTTCACTATTACATTTCTTCCTTActattcacattttttcattcacaACCACCCTACTTGCTTATGCTGACTTCAGTTTGAGAATACTTCAGTTTGAGTGTGCTTTATCCTCTGCTCACATGTACATCACACATCAGTTTAAAGTGCCAGTTGATAAAATGCACCTTTTACAATATAGCACcaataatatttgttttatatgtacATTTGTCATTCCTCTCGATCTTTATGTAGGACGTGTCCTTTCAGTACGTTATGAGGTTTTGCTTGGTGTTATGATGAAGTGTCATACCTCATTCcactctttttctctgtgtCCCCAAGAGCAGAATGGGATTATAAAAACTGCACTGTAATGCTGAGGAGAGTAATATTGATTTACATTGATCTCATAAATGGTATATTTCCCAGCCTTTCTTTCAAGCTATATCTTATAGTTAGGAACAGAGTTACATGTCCATCTGTAGAAGAATAAAGAAAGCTCTTTGTCAGTGAAGATCGTAAAACAGCCTAAAAGCCTGAACATCAGAATTATTTCTGGTGTTTTAAGCCGCATTCTTGCCAAATGTGCATATAAAAGccttatattcatatattaagGGTGTTAAACTGACTGGTGATGGTTTTAGTCACTTTTCCCAAATGTTATTGTTGCCACAGTCATTGTTCTCACCGATGGTTGTAGTTGAACAAAATGGAAATAGAATAGTTGGGCAGTatccacttttttttatacattccaACTGTCGCAACAACGCAAATCACTGGACTTCCTCttctataaaatgtaaataggaAGATTATTGTTTTAGGACACGGATTTGTTGAATAtagaattataattattaattccCTCAATTACACTACTAAATCAAGACGCCATAAAAAATTCCTGAGACTAGGCTACCAGATTTCTGAGCTCCACAATTCAAATTAAACAGATTATCAGATCAAATTGGTTACATTCTGGATACGTttcaataatatattaaaatatatagaaaattatAGAATTGCCTCATTTTTGCACTTGATCAAGTTGGAGTTTTTACAAAATATGAAAGCATTTGTTgtgatgtactgtatgtgtgcacTGTTTTCTtagaaaatactttatttcaaatAGTAGAGGCAGTCCTACAGGCACTCTTGGCAGACATGCCAATGTCATTTTGAATGTGGGTGTACATGTCTGCTTAGTGTAATTAGAAAaaatgaaatcattttttttgtaccttatttcattgttgttttttttatattactcaCTCACCAAGCCCCTTATAAAGAACACTACAATACTACTGCTGAGAGACTACAAAAAATACTCTACTAACACTAAGCTGTGGCATTCAAGCAACAAAAACATTTCCCACCTCATTTActcttcctccaccagcctgGACCGTtgaaaaaaaatcctccatcTTCAATATTACAAAGATCCTGTTTTCTCCCCATTCTGATTATAATGAACATTTTATGCATTTCACTGCTGCCACATGGTTGGCTTGATAGATAATTGCATGAATGAGTAGGTTGTAGGTACAATTCTTAATAAAGTGCTTGGTGAGTGCATGTTTTTGTATGTTCTGTTTATGTGggcattaaaaatatatgattgaAAAGTTTATGTACACTGTAACAATCCGTTAATAAAGG
>XM_007256630.3
GTAGGCGGCGGTACTGTCACGAGTCTGCTCGTCGGCCGCCCGCTGTGTGAAGAGCCGAGAGAGAGCAAAAcatcagagagagggagagagaggagctgcagCAGGATGGAGTTCGCCGAGCTGATAAAGACCCCCCGAGTGGACAGTGTTGTTCTTCACCGTCCTTTTCTGCCAACAGTGGAGGGAACTTTGTGTCTCACTGGCCACCACCTCATCCTCTCCTCTCGACAGGACAATACAGAGGAGCTCTGGCTGCTTCATTCCAACATCGATGCCATCGATAAGAGGTTTGTTGGCTCTCTAGGCACAATTATTGTGAAATGCAAGGACCTGCGAATTATTCAGCTGGACATCCCTGGCATGGAAGAGTGCCTTAACATTGCCAGCTCCATTGAGGCATTGTCCACGCTTGACTCTCTCTCCCTGATGTACCCTTTCTTCTACCGCCCTATGTTTGAGGTCATTGAGGATGGTTGGAACTTGTTCTCACCAGCGGAGGCCTTTAAAGACCTGGAATCAATGACAGATGAGTGGAGACTTAGTGAAATTAATAAAGACTTTGCCGTTTGTCCCTCCTACCCATCACTGGTGACTGTGCCCAAGGACATAGATGATGACACTCTTTGCAAAGCTGCTGCATTTCGCCATGGAGGACGCTTCCCTGTGCTCAGCTACTACCACAAAAAGAACGGCATGGTGATGATGCGAGCAGGGCAGCCGCTTACGGGAACCAACGGCCGCCGCtgtaaagaggatgagaaactAATCAACGCTACACTCCGTCCAGGAAAGCGTGGGTACATCATCGACACCCGCACCATTGCAGTAGCACAGCAGGCTAAAGCTCGTGGAGGCGGGTTTGAACAGGAGGCCAATTATCCACAGTGGAGGAGAATCCACAAAGCTATTGAGAGGTCCAATATTCTACAGGAGAGCCTGATTAAGCTGGTGGAGGCCTGTAATGATCAGTCTAACAGCATGGATCGCTGGCTTAGCAAACTGGAAGCATCCAACTGGCAGAGCCATGTGAAAGAGATCCTCACCACAGCCTGTCTGGCGGCTCAGTGCATTGACAGAGAGGGTGCGTCAGTGCTGGTCCATGGGACAGAGGGCACTGACTCCACACTGCAGGTGACCTCTCTGGCCCAGATCATCCTGGAGCCTGTCTGCAGGACTATCCGTGGATTCCAGGCCCTGGTGGAGCGTGAGTGGCTGCAGGCTGGCCACCCATTCCAGCAGCGCTGTGCCCAGTCCGCTTATTCCAACGGAAAGCCACGGAGTGAGGCGCCAGTGTTCCTGCTCTTCCTGGACTGCGTGTGGCAGATACTGCGCCAGTTCCCCTGCTCCTTCGAGTTCAATGAGCACTTCCTGGTCACGCTTTTTGAACACGCGTACGCTTCTCAGTTTGGAACGTTTCTGGGAAACAGCGCCGCTGAGAGGGTGAAGCTGAAGCTTTCTCGGAAGACGGTGTCCCTATGGTCGTGGGTGAACAGGCCTCAGGAGCTGGAACGCTTTGTTAACCCGCTCTATGAGCCCAACAGCCTGGTGATCTGGCCTTCTGTAGCACCACAGAGTCTGCTGCTGTGGGAGGGTGTGTTTTTACGTTGGAATCGCTCTACCAAGTGTCTGGATGAGGCTTATGAAGAAATGGTGCACATTATCGAATACAACAAGGAGCTACAGAATAAAGTGAACAGCCTGAGCAGACAGCTTGCTCAGCTGGAGACGGAAGACAGTCCTCTACAGTCTCCATAAGTCGAGTAGTGCAATCTTTCAGAGAAATTTCAACAAAGCGGTTCTCTTTGGAGTTCCTCTTCAGCACTACTGAGATTACTCTGTCCAGTACATGTatgtacacacaaacaaacacacaaacacacacacacacagacaccctaCATTCTTTAAGGTTTACTACTGCTGTCTATAAATCTAACTATATTCATGTGTTTCTCAGCTGCTATACAGTTCAGCTTTAGCTATATACAGTCTTATCTGTTATTCTTGGCCTTCACTTTGCTCAGACTAACCAATTAGCTTTAGAAATGTGCTATGATGCTATGACTGACtgattcacacacaaacacacacacacacacacacactatactaacACTATCAAATGTATTCTTGCCTCTTTAATTGCTTTCCAACACTGTTATTGCTAACAGAAAACTGGCTTGAGTGTAGCCACTACTTGCTTAATATTTTTAGTGGGTGGTGGTTGATTTTCGTTTCTCAGAAACAAGGAGTCACTGACAGTAAATGATTGCTTCATTCACTGAAACTGTTGCAAATACTTTGTTGACTTACAGTAGTGAATGACTTTACCATGAAAGGTCTTTTAAATAGGTAAAAGTGGGTATTGTTTTGTGTGACCACGATAAGGATGCCTGTTGGTTTCACAGGCTTTGGTTTAAAAGCAGCATGGTATTAAACACAAGAAATGTAATGATTTAAGAAATGCCAATATACATTCAGGTCCATGAGTCTTTAGGCAGTgacacattttctcattttgtctATGTACAACCCAGCAATGGATTTGAAATGAAGCAGTAAAGGTTAGCCTTTTGTCATCTTTTTAGAAAAGTACTATATTGTTGACTCAAAGGGACCAGATTTCTAAAAAGAACAGATAAATTGACAAGCTCAGCAGTACCAAGTGGACCACTGAAGATACCTTAAGTAACgataatcccagaaaaaaaatgacatcagtGATCTTTAAATCAAACCAGTtgatcatctttttttttacctaattaagACAAAACTGaagacatatacagtatatacacatatacacagcaTATACAGAAAAAGACATTACCTGATAGAATGTAATTGCAACAGAGCATTAAAAATGCttcttaatatttataataattagttTATACTATGTATGTTTGTCCAATGTTAAGCCTATGCTGtgctattaaaaatataaatggttaataaaaatactttgttATATTTgtcaaagtaaattaaagtcTTCACTTTAATCACATCTTGACTGCTTCATTTAAAAACCACTGAGGTGGAGAAACATgacaatgaaacaaaaaatgGTTAACTGTCCAAATACTTCTACATTTCACTATTACATTTCTTCCTTActattcacattttttcattcacaACCACCCTACTTGCTTATGCTGACTTCAGTTTGAGAATACTTCAGTTTGAGTGTGCTTTATCCTCTGCTCACATGTACATCACACATCAGTTTAAAGTGCCAGTTGATAAAATGCACCTTTTACAATATAGCACcaataatatttgttttatatgtacATTTGTCATTCCTCTCGATCTTTATGTAGGACGTGTCCTTTCAGTACGTTATGAGGTTTTGCTTGGTGTTATGATGAAGTGTCATACCTCATTCTGGAGTTAGCTAAACCCACAATAGGATGATTACAGTATGTGCTGTGTACACGATGCCAGAATgcactctttttctctgtgtCCCCAAGAGCAGAATGGGATTATAAAAACTGCACTGTAATGCTGAGGAGAGTAATATTGATTTACATTGATCTCATAAATGGTATATTTCCCAGCCTTTCTTTCAAGCTATATCTTATAGTTAGGAACAGAGTTACATGTCCATCTGTAGAAGAATAAAGAAAGCTCTTTGTCAGTGAAGATCGTAAAACAGCCTAAAAGCCTGAACATCAGAATTATTTCTGGTGTTTTAAGCCGCATTCTTGCCAAATGTGCATATAAAAGccttatattcatatattaagGGTGTTAAACTGACTGGTGATGGTTTTAGTCACTTTTCCCAAATGTTATTGTTGCCACAGTCATTGTTCTCACCGATGGTTGTAGTTGAACAAAATGGAAATAGAATAGTTGGGCAGTatccacttttttttatacattccaACTGTCGCAACAACGCAAATCACTGGACTTCCTCttctataaaatgtaaataggaAGATTATTGTTTTAGGACACGGATTTGTTGAATAtagaattataattattaattccCTCAATTACACTACTAAATCAAGACGCCATAAAAAATTCCTGAGACTAGGCTACCAGATTTCTGAGCTCCACAATTCAAATTAAACAGATTATCAGATCAAATTGGTTACATTCTGGATACGTttcaataatatattaaaatatatagaaaattatAGAATTGCCTCATTTTTGCACTTGATCAAGTTGGAGTTTTTACAAAATATGAAAGCATTTGTTgtgatgtactgtatgtgtgcacTGTTTTCTtagaaaatactttatttcaaatAGTAGAGGCAGTCCTACAGGCACTCTTGGCAGACATGCCAATGTCATTTTGAATGTGGGTGTACATGTCTGCTTAGTGTAATTAGAAAaaatgaaatcattttttttgtaccttatttcattgttgttttttttatattactcaCTCACCAAGCCCCTTATAAAGAACACTACAATACTACTGCTGAGAGACTACAAAAAATACTCTACTAACACTAAGCTGTGGCATTCAAGCAACAAAAACATTTCCCACCTCATTTActcttcctccaccagcctgGACCGTtgaaaaaaaatcctccatcTTCAATATTACAAAGATCCTGTTTTCTCCCCATTCTGATTATAATGAACATTTTATGCATTTCACTGCTGCCACATGGTTGGCTTGATAGATAATTGCATGAATGAGTAGGTTGTAGGTACAATTCTTAATAAAGTGCTTGGTGAGTGCATGTTTTTGTATGTTCTGTTTATGTGggcattaaaaatatatgattgaAAAGTTTATGTACACTGTAACAATCCGTTAATAAAGGCATGTTACAACAACAA

Function

symbol description
mtmr9 Predicted to enable phosphatidylinositol-3-phosphatase activity. Predicted to be involved in negative regulation of autophagy and phosphatidylinositol dephosphorylation. Predicted to be active in cytoplasm and membrane. Orthologous to human MTMR9 (myotubularin related protein 9).

NR:

description
PREDICTED: myotubularin-related protein 9-like

GO:

id name namespace
GO:0016311 dephosphorylation biological_process
GO:0016791 phosphatase activity molecular_function

KEGG:

id description
K18084 MTMR9; myotubularin-related protein 9

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU39324 False 2740 lncRNA 0.34 2 59064473 59112299
TU39325 False 2677 lncRNA 0.37 3 59064473 59112299
XM_007256630.3 True 4839 mRNA 0.41 11 59092440 59112315

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103022804 LOC108435018 coding upstream 100810 58954101 ~ 58963663 (+)
LOC103022293 eif5,if5,LOC103022293,LOC108435020,LOC107723356,LOC106610956 coding upstream 129682 58925376 ~ 58934791 (+)
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LOC103021996 NA coding upstream 182282 58865600 ~ 58882191 (+)
LOC103021664 LOC108411900,LOC108257513,LOC107684818,LOC107746282,LOC107723542 coding upstream 244696 58804247 ~ 58819777 (+)
LOC103024478 tdh,LOC103024478,LOC108435012,LOC107723287,LOC107561940,LOC107589050,LOC107701506,LOC107746115 coding downstream 3124 59115439 ~ 59123577 (+)
pinx1 pinx1 coding downstream 27265 59139580 ~ 59168498 (+)
sox7 sox7,LOC107701473,LOC107561931,LOC107589052,LOC107684791 coding downstream 68330 59180645 ~ 59184033 (+)
trnal-cag_8 NA coding downstream 85887 59198202 ~ 59198284 (+)
LOC111194376 NA coding downstream 116529 59228844 ~ 59230388 (+)
G29304 ccm2,LOC107684794 non-coding upstream 84776 58976662 ~ 58979697 (+)
G29299 enpp5 non-coding upstream 115893 58935011 ~ 58948580 (+)
LOC111191936 NA non-coding upstream 169133 58888723 ~ 58895340 (+)
G29290 NA non-coding upstream 176124 58888118 ~ 58888349 (+)
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G29388 NA non-coding downstream 124181 59236496 ~ 59243834 (+)
G29405 NA non-coding downstream 164292 59276607 ~ 59276837 (+)
G29409 NA non-coding downstream 200287 59312602 ~ 59312912 (+)
G29432 NA non-coding downstream 323845 59436160 ~ 59436375 (+)
G29155 foxq1 other upstream 645656 58417394 ~ 58418817 (+)
LOC103042006 NA other upstream 1251985 57802891 ~ 57812488 (+)
G28865 NA other upstream 1662081 57401925 ~ 57402392 (+)
dcaf4 dcaf4,LOC107602090,LOC107659175,LOC107562700 other upstream 2358381 56695844 ~ 56706092 (+)
sipa1l1 sipa1l1,LOC107721317,LOC107668228,LOC107756605,LOC107659170,LOC106932450,LOC102236503,LOC106960899,LOC103130950,LOC103457354,LOC107081118 other upstream 2610539 56337156 ~ 56453934 (+)
G29382 NA other downstream 108217 59220532 ~ 59221036 (+)
LOC111194375 NA other downstream 108951 59221266 ~ 59228840 (+)
atraid atraid other downstream 441970 59554285 ~ 59559762 (+)
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c3h14orf2 NA other downstream 1408027 60520342 ~ 60525051 (+)

Expression


Co-expression Network