LOC103029909 (LOC108412949)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103029909
gene name LOC108412949
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 72921906 ~ 73033786 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU44038 False 1314 lncRNA 0.31 8 72980681 73012899
TU44041 False 1245 lncRNA 0.34 9 72938563 72984264
TU44043 False 724 lncRNA 0.36 4 72986199 73014449
TU44049 False 1385 lncRNA 0.29 11 72938563 73013453
TU44050 False 1253 lncRNA 0.40 10 72938563 73013453
TU44052 False 860 lncRNA 0.31 5 72986199 73013939
XM_022678547.1 True 11991 mRNA 0.43 78 72921906 73033786

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103029590 NA coding downstream 56281 72847549 ~ 72865625 (-)
LOC103032851 NA coding downstream 301926 72613438 ~ 72619980 (-)
lexm NA coding downstream 342394 72571479 ~ 72579512 (-)
bsnd NA coding downstream 394306 72522665 ~ 72527600 (-)
pcsk9 pcsk9 coding downstream 403611 72498722 ~ 72518295 (-)
LOC103026697 NA coding upstream 7682 73041468 ~ 73082008 (-)
tnfrsf21 tnfrsf21,LOC103398585 coding upstream 57789 73091575 ~ 73127688 (-)
ptchd4 ptchd4,LOC107553442,LOC107732383,LOC107732542,LOC107690039,LOC107601530 coding upstream 237774 73271560 ~ 73302026 (-)
spats1 spats1 coding upstream 395382 73429168 ~ 73436214 (-)
LOC103031805 LOC103031805,LOC105892805 coding upstream 570541 73604327 ~ 73609208 (-)
G32828 NA non-coding downstream 44132 72877060 ~ 72877774 (-)
G32816 NA non-coding downstream 79416 72841849 ~ 72842490 (-)
G32760 NA non-coding downstream 98108 72803247 ~ 72823798 (-)
G32758 NA non-coding downstream 118810 72801624 ~ 72803096 (-)
G32746 sf3b6,SF3B6 non-coding downstream 135546 72781826 ~ 72786360 (-)
G32870 NA non-coding upstream 144614 73178400 ~ 73196144 (-)
G32879 NA non-coding upstream 184114 73217900 ~ 73218151 (-)
G32891 NA non-coding upstream 228544 73262330 ~ 73263553 (-)
G32900 NA non-coding upstream 285858 73319644 ~ 73325367 (-)
LOC111191385 NA non-coding upstream 292581 73326367 ~ 73328154 (-)
LOC103026087 NA other downstream 2609 72869708 ~ 72919297 (-)
pla2g7 pla2g7,LOC108440964,LOC107553425,LOC107696191 other downstream 108376 72803993 ~ 72813530 (-)
G32714 NA other downstream 223896 72697673 ~ 72698010 (-)
G32611 NA other downstream 379459 72527783 ~ 72542447 (-)
G32557 NA other downstream 679636 72241530 ~ 72242270 (-)
G32914 NA other upstream 354076 73387862 ~ 73388612 (-)
G32946 NA other upstream 518629 73552415 ~ 73552883 (-)
ak9 ak9 other upstream 723122 73756908 ~ 73778866 (-)
LOC111191425 NA other upstream 762677 73796463 ~ 73868538 (-)

Expression


Co-expression Network