LOC103044046


Basic Information

Item Value
gene id LOC103044046
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 46387659 ~ 46395067 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007230708.3
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GATTTTAGTAGTATGATTAAACCTCCTTAAAATCACGATCCAAA
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_007230709.3 True 5088 mRNA 0.39 4 46387659 46395067

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC111194350 NA coding downstream 12742 46364129 ~ 46374917 (-)
LOC103043020 LOC103043020,LOC108411620,LOC108258012,LOC103375802 coding downstream 26833 46352209 ~ 46360826 (-)
LOC103042705 samd15 coding downstream 50118 46329406 ~ 46337541 (-)
LOC103029737 lrfn5b,LOC108411613,LOC108257655,LOC107712211,LOC107564320 coding downstream 58549 46317964 ~ 46329110 (-)
LOC103025714 NA coding downstream 258417 46108572 ~ 46129242 (-)
LOC107197829 NA coding upstream 1432 46396499 ~ 46404613 (-)
actr10 actr10,LOC106608088,LOC106571574 coding upstream 15389 46410456 ~ 46416421 (-)
peli2 peli2,LOC103047193,LOC108410474,LOC108258111,LOC100334245,LOC107567396,LOC107574485,LOC106571579 coding upstream 85578 46480645 ~ 46499667 (-)
LOC103047706 arf6,arf6a,arf6.2,ARF6,LOC105893149,LOC106608083 coding upstream 117572 46512639 ~ 46514813 (-)
LOC103022574 mdga2,LOC108411484,LOC108257548,LOC107704381 coding upstream 250570 46645637 ~ 46936593 (-)
G26663 NA non-coding downstream 25741 46361718 ~ 46361918 (-)
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G26612 NA non-coding downstream 320471 46066648 ~ 46067188 (-)
G26564 NA non-coding downstream 538067 45847617 ~ 45849592 (-)
G26563 NA non-coding downstream 542728 45843174 ~ 45844931 (-)
G26666 NA non-coding upstream 894 46395961 ~ 46409064 (-)
LOC111197648 NA non-coding upstream 183220 46578287 ~ 46599431 (-)
G26751 NA non-coding upstream 267052 46662119 ~ 46663963 (-)
G26771 NA non-coding upstream 710248 47105315 ~ 47106324 (-)
G26783 LOC108424466 non-coding upstream 722515 47117582 ~ 47120006 (-)
G26636 LOC108411685,LOC108258103,LOC101066055,LOC105902101 other downstream 94853 46292087 ~ 46292806 (-)
G26588 NA other downstream 452037 45935153 ~ 45935622 (-)
G26388 NA other downstream 950074 45436109 ~ 45437585 (-)
G26295 atad2b,LOC107697175,LOC107603081 other downstream 1501858 44882778 ~ 44885801 (-)
ubxn2a ubxn2a,LOC107603085,LOC107750080,LOC107697178 other downstream 1516969 44856099 ~ 44870690 (-)
naa30 naa30,LOC108270341 other upstream 32350 46427417 ~ 46435925 (-)
G26695 prpf39,LOC107729032 other upstream 123804 46518871 ~ 46525996 (-)
fkbp3 fkbp3 other upstream 138628 46533695 ~ 46535835 (-)
G26754 NA other upstream 309280 46704347 ~ 46738736 (-)
LOC103039734 LOC108424428 other upstream 1822439 48217506 ~ 48324662 (-)

Expression


Co-expression Network